Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия)

20.10.2008

Сравнение полученных аминокислотных последовательностей (табл. 3) c референтными штаммами из GenBank в пределах одного генотипа показало, что 111 нуклеотидных замен приводили к 53-м аминокислотным заменам у изолятов генотипа D (48%), 36 нуклеотидных замен у генотипа А - к 22-м аминокислотным заменам (61%) и у изолятов генотипа С 22 нуклеотидные замены приводили к пяти аминокислотным (22%).

Из выявленных аминокислотных замен следует выделить замену T40S (12), расположенную в участке, взаимодействующем с клеточным рецептором, а также замену N103D (61п, 81, Y1) - в матриксном домене L-белка, участвующем в морфогенезе вирионов. В области цитозольной петли S-белка (33 - 80аа), которая, как полагают, участвует в сборке и секреции вирионов и пустых субвирусных частиц, обнаружены следующие замены: T68I (4); F80S (12); S45A, C76R (39); I68T, W74S (176); P67Q (Y2, Ya1) [8].

Генотип Штамм Замены
в N'-конце преS1 в N'-конце преS2 в N'-конце S-гена в MHR S-гена в С'-конце S-гена всего замен
D 4     T68I V118A   53
11   L54R      
12 T40S P41H F8L; F80S   S193L; L205M; Y206L; F220L
61п 1—1 4-1, H9N;     S207R; L209S
81 G55S; F56L; L74I; S90T; N103D 22-делеция; F8L   S193L; P203R; L213I
362 Q75H; L77V P41H      
Y1 L74I; N103D P41H; L42I V14A; L15S; Q16L; F20S Q101R; I110L S193L; M198I; W199L; S204N; Y206C; S207N; P211L; P214Q; V224A; Y225S
A 2           22
39     V14G; S45A; C76R; F93L M133I S210R
42     F8L    
176   22-делеция; T54K I68T; W74S   Y161F; S210R
Y2   Q10K; A11T P67Q   V184A
260 I84M   F8S; T27A   S210R
Ya1     P67Q    
C 55 и 162   I45T; T49I S3N   V184A; Y200F 5

Таблица 3. Аминокислотные замены в преВ1/преЭ2/В-белках у изолятов вируса гепатита В, выделенных в Республике Саха (Якутия)

В главном гидрофильном регионе S-белка выявлены следующие замены: V118A (4); Q101R, I110L (Y1) и M133I (39). Из них замены Q101R и I110L ранее выявлялись из сывороток крови с негативным тестом на HBsAg, а замена M133I была описана в случае получения расходящихся результатов детекции HBsAg разными тест-системами ИФА [9, 10].

В С-концевом участке S-белка обнаружены замены, описанные в комбинации с другими заменами при отрицательном тесте на HBsAg [9], среди них - S207R (61п); P203R (81); M198I, Y206C, S207N (Y1); V184A (Y2, 55, 162).

Таким образом, показано, что на территории Республики Саха (Якутия) в структуре циркулирующих генотипов ВГВ обнаружены три варианта: А (44%), С (12%) и D (44%). Выявлено значительное генетическое многообразие вирусов гепатита В, особенно изолятов, принадлежащих к генотипам ВГВ А и D. Обнаружены аминокислотные замены, обусловливающие способность ВГВ к «диагностическому ускользанию».