epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2022-21-6-59-64epidemiology-1705Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESАктуальные серотипы Streptococcus pneumonia, циркулировавшиe на территории Свердловской области в 2020–2021 годахCurrent Streptococcus Pneumoniae Serotypes in Sverdlovsk Region in 2020–2021https://orcid.org/0000-0001-6140-2546БолгароваЕ. В.BolgarovaE. V.

Екатерина Викторовна Болгарова – научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций.

620030, Екатеринбург, ул. Летняя, 23. +7 (912) 208-59-02

Ekaterina V. Bolgarova – researcher, laboratory of respiratory viral infections.

Ekaterinburg, +7 (912) 208-59-02

bolgarova_ev@eniivi.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3416-0902ЗахароваЮ. А.ZakharovaYu. A.

Юлия Александровна Захарова – доктор медицинских наук, заместитель руководителя по научной работе, главный научный сотрудник.

Екатеринбург, +7 (912) 643-50-60

Yulia A. Zakharova – Dr. Sci. (Med.), deputy Head of Scientific work, head researcher.

Ekaterinburg, +7 (912) 643-50-60

zakharova_ya@eniivi.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2669-7144МухачевИ. С.MukhachevI. S.

Иван Семенович Мухачев – начальник центра.

Екатеринбург, +7 (912) 260-61-31

Ivan S. Mukhachev – head of the center.

Ekaterinburg, +7 (912) 260-61-31

faust.78@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5074-7925КоротковаИ. А.KorotkovaI. A.

Инна Александровна Короткова – младший научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций.

Екатеринбург +7 (914) 463-49-10

Korotkova Inna A. – junior researcher, laboratory of respiratory viral infections.

Ekaterinburg, Russia. +7 (914) 463-49-10

korotkova_ia@eniivi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3584-9528ИващенкоИ. А.IvashchenkoI. A.

Иван Александрович Иващенко – старший лаборант лаборатории клеточных культур.

Екатеринбург +7 (922) 100-46-90

Ivan A. Ivashchenko – senior technician, cell culture laboratory.

Ekaterinburg, +7 (922) 100-46-90

chizzarp@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8157-6866ОстапчукА. В.OstapchukА. V.

Анна Владимировна Остапчук – младший научный сотрудник, Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций.

Екатеринбург. +7 (982) 773-16-96

Anna V. Ostapchuk – junior researcher.

Ekaterinburg, +7 (982) 773-16-96

ostapchuk_av@eniivi.ruМамонтовО. И.MamontovO. I.

Олег Игоревич Мамонтов – начальник отдела.

Екатеринбург, +7 (982) 735-24-25

Oleg I. Mamontov – department head.

Ekaterinburg, +7 (982) 735-24-25

evildoctor47@mail.ruЕкатеринбургский НИИ вирусных инфекций, ФБУН Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор РоспотребнадзораРоссияEkaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution State Research Center of Virology and Biotechnology Vector, Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well­-Being)Russian FederationФГКУ 1026 Центр государственного санитарно­-эпидемиологического надзора, Минобороны РоссииРоссияFederal State­Owned Enterprise 1026 Center of State Sanitary and Epidemiological control, Ministry of Defense of the Russian FederationRussian FederationЕкатеринбургский НИИ вирусных инфекций, ФБУН Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор, РоспотребнадзорРоссияEkaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution State Research Center of Virology and Biotechnology Vector, Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-­Being)Russian FederationЕкатеринбургский НИИ вирусных инфекций, ФБУН Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор, Роспотребнадзора=РоссияEkaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution State Research Center of Virology and Biotechnology Vector, Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well­-Being)Russian FederationФГКУ 1026 Центр государственного санитарно­эпидемиологического надзора, Минобороны РоссииРоссияFederal State­Owned Enterprise 1026 Center of State Sanitary and Epidemiological control, Ministry of Defense of the Russian FederationRussian Federation2022090120232165964Copyright © Болгарова Е.В., Захарова Ю.А., Мухачев И.С., Короткова И.А., Иващенко И.А., Остапчук А.В., Мамонтов О.И., 20232023Болгарова Е.В., Захарова Ю.А., Мухачев И.С., Короткова И.А., Иващенко И.А., Остапчук А.В., Мамонтов О.И.Bolgarova E.V., Zakharova Y.A., Mukhachev I.S., Korotkova I.A., Ivashchenko I.A., Ostapchuk А.V., Mamontov O.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1705Актуальность

Актуальность. Изучение распространения отдельных серотипов S. pneumoniae имеет важное эпидемиологическое и клиническое значение. Особую актуальность в аспекте данной проблемы имеет Свердловская область, где 20% внебольничной пневмонии (ВП) вызывает S. pneumoniae и до 70% ВП заканчивается летальным исходом.

Цель

Цель. Изучить особенности серотипового пейзажа S. pneumoniae среди невакцинированных детей (от 0 до 5 лет) и вакцинированных взрослых (от 19 до 27 лет).

Материалы и методы

Материалы и методы. В эпидемиологическом наблюдательном описательно­оценочном исследовании анализировались данные, полученные при исследовании носоглоточных мазков, взятых в двух группах наблюдения: невакцинированные дети в возрасте от 0 до 5 лет с диагнозом «острая респираторная инфекция (ОРИ)» – 159 человек и вакцинированные взрослые в возрасте от 19 до 27 лет с диагнозом «практически здоров» – 392. Методом мультиплексной ПЦР выполнено молекулярно­генетическое типирование 20 распространённых серотипов/серогрупп S. рneumoniae (1, 2, 3, 4, 5, 14, 16F, 19A, 19F, 23A, 23F, 6ABCD, 7AF, 9AV, 9LN, 11AD, 15AF, 18ABCF, 22AF, 12FAB/44/46, 33AF/37).

Результаты и обсуждение

Результаты и обсуждение. У 27,0% и 28,1% лиц изучаемых групп наблюдения установлено присутствие в биологическом материале 12 серотипов S. pneumoniae: вакцинных – 19F – 2,6%, 6ABCD – 2,6%, 4 – 2,0%, 23F – 2,0%, 9AV – 1,3%, 9LN – 0,6%, 11AD – 1,3%, 18ABCF – 2,0% и невакцинных – 15AF – 0,7%, 16F – 0,6%. В структуре доминировали нетипируемые штаммы с наибольшей долей (77,3%) среди взрослого иммунизированного населения и 53,5% среди невакцинированных детей. Среди типируемых штаммов, выявленных у детей,70,0% относились к вакцинным (чаще определяли серотипы 19F и 23F), среди взрослых преобладали 3 и 12F/A/B/44/46.

Заключение

Заключение. На примере детского неиммунизированного и взрослого иммунизированного населения Свердловской области подтверждена тенденция роста циркуляции на территории РФ нетипируемых штаммов S. pneumoniae, что делает актуальными задачи по совершенствованию мониторинга и оптимизации молекулярно-­генетических методов идентификации возбудителя с целью дальнейшей разработки современных средств специфической и неспецифической профилактики, включая современные антимикробные средства и отечественную вакцину.

Relevance

Relevance. Studying the spread of individual S. pneumoniae serotypes is of special epidemiologic and clinical importance. Sverdlovsk Region with the 20% proportion of community­-acquired pneumonia and its proportion among the causes of mortality of up to 70% is of special concern.

Aims

Aims. Studying the features of the S. pneumoniae serotype landscape in individual socially significant population groups in Sverdlovsk Region in 2020 and 2021.

Materials and methods

Materials and methods. The work presents the results of testing nasopharyngeal smears collected in two observation groups, namely, that of 159 unvaccinated children aged 0 to 5 with acute respiratory infections (ARI), and that of 392 apparently healthy adults aged 19 to 27. We performed molecular genetic typing for identification of 20 leading S. рneumoniae serotypes/serogroups (1, 2, 3, 4, 5, 14, 16F, 19A, 19F, 23A, 23F, 6ABCD, 7AF, 9AV, 9LN, 11AD, 15AF, 18ABCF, 22AF, 12FAB/44/46, 33AF/37) using multiplex polymerase chain reaction (PCR).

Results and discussion

Results and discussion. In the individuals of the studied groups of observation, in 27.0% and 28.1% of the cases the study detected the S. pneumoniae in the biological material with circulation of 12 «vaccine» (19F – 2,6%, 6ABCD – 2,6%, 4 – 2,0%, 23F – 2,0%, 9AV – 1,3%, 9LN – 0,6%, 11AD – 1,3%, 18ABCF – 2,0%) and «nonvaccine» (15AF – 0.7%, 16F – 0.6%) serotypes. Nontypable strains with the highest proportion (77.3%) among the immunized adult population were predominant in the structure; in the unvaccinated children, this rate was 53.5%. Among the typable strains in children, 70.0% belonged to the vaccine ones, and most frequently the study identified 19F and 23F serotypes, while serotypes 3 and 12F/A/B/44/46 dominated among the adults.

Conclusion

Conclusion. The study of unimmunized pediatric and immunized adult populations of Sverdlovsk Region confirmed a trend toward an increase in the circulation of nontypable S. pneumoniae strains in the Russian Federation, which sets the agenda to improve the monitoring system and optimize molecular genetic techniques for identification of the pathogens and upgrade the present specific and nonspecific preventive remedies, including the current antimicrobial ones and locally­-produced vaccine.

Streptococcus рneumoniaeсеротипы/серогруппымониторинг циркуляцииСвердловская областьStreptococcus рneumoniaeserotypes/serogroupsmonitoring of circulationSverdlovsk RegionРабота выполнена за счет гранта Российского научного фонда (проект № 22­25­20129)ReferencesБаранов А. А., Брико Н. И., Намазова-Баранова Л.С. и др. Стрептококки и пневмококки: Руководство для врачей. М.: Феникс; 2013.Baranov A.A, Briko N.I., Namazova-Baranova L.S., et al. Streptococci and pneumococci: Manual for doctors. Moscow: Feniks; 2013 (In Russ).Ceyhan M., Ozsurekci Y., Gürler N., et al. Serotype distribution of Streptococcus pneumoniae in children 102 with invasive diseases in Turkey: 2008–2014 // Human Vaccines Immunotherapeutics. 2016. Vol. 12, N2. P. 308–313.Ceyhan M., Ozsurekci Y., Gürler N., et al. Serotype distribution of Streptococcus pneumoniae in children 102 with invasive diseases in Turkey: 2008–2014. Human Vaccines Immunotherapeutics. 2016. Vol. 12, N2. P. 308–313. doi: 10.1080/21645515.2015.1078952Messaoudi M., Milenkov M., Albrich W.C., et al. The Relevance of a Novel Quantitative Assay to Detect up to 40 Major Streptococcus pneumoniae Serotypes Directly in Clinical Nasopharyngeal and Blood Specimens // PLoS ONE. 2016. Vol. 11, N3.Messaoudi M., Milenkov M., Albrich WC., et al. The Relevance of a Novel Quantitative Assay to Detect up to 40 Major Streptococcus pneumoniae Serotypes Directly in Clinical Nasopharyngeal and Blood Specimens. PLoS ONE. 2016. Vol. 11, N3.DOI:10.1371/journal.pone.0151428Зарипова А. З., Баязитова Л. Т., Тюпкина О. Ф. и др. Фенотипические и генотипические свойства Streptococcus pneumoniae при бактерионосительстве // Практическая медицина. 2018. Т. 16, №9. С. 106-112.Zaripova A.Z., Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., et al. Fenotipicheskiye I genotipicheskiye svoistva Streptococcus pneumoniae pri bakterionositel’stve. Prakticheskaya meditsina. 2018;16 (9):106–112 (In Russ).Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the pneumococcus. F1000Research. 2016. Vol. 5. 2320.Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the pneumococcus. F1000Research. 2016. Vol. 5. 2320. DOI:10.12688/f1000research.9283.1Зайцев А. А., Акимкин В. Г., Брико Н. И. Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций: в фокусе взрослые из организованных коллективов // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018. №4. С.72–81.Zaytsev A.A., Akimkin V.G., Briko N.I. Vaktsinoprofilaktika phevmokokkovyh infektsiy: v fokuse vzrosliye is organizovannyh kollektivov. Epidemiologija I infektsionniye bolezni. Aktual’niye voprosy. 2018; (4):72–81 (In Russ). DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2018.4.72–81Протасова И. Н., Бахарева Н.В., Перьянова О.В., и др. Смена серотипов Streptococcus pneumoniae у детей, вакцинированных 7-валентной конъюгированной вакциной. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2014. №5 (78). С. 67–71.Protasova I.N., Bahareva N.V., Per’yanova O.V., et al. Smena serotipov Streptococcus pneumoniae u detey, vaktsinirovannyh 7-valentnoi konjugirovannoy vaktsinoy. Epidemioligiya I vaktsinoprofilaktika; 2014. No. 5 (78). P. 67–71. (In Russ).Намазова-Баранова Л. С., Федосеенко М. В., Вишнёва Е. А. и др. Теоретические основы и реальные результаты: обзор материалов по вакцинопрофилактике пневмококковой инфекции в мире // Педиатрическая фармакология. 2018. Т. 15, №1. С. 58–74.Namazova-Baranova L.S., Fedoseienko M.V, Vishneva E.A., et al. Teoreticheskiye osnovy i real’niye rezul’taty: obzor materialov po vaktsinoprofilaktike pnevmokokkovoy infektsiyi v mire. Pediatricheskaya farmakologiya. 2018;15(1): 58–74 (In Russ). doi: 10.15690/pf.v15i1.1844Брико Н. И., Коршунов В. А., Ломоносов К. С. Пневмококковая инфекция в Российской Федерации: состояние проблемы. Вестник РАМН. 2021. Т.76, №1. С. 28–42.Briko N.I., Korshunov V.A., Lomonosov K.S. Pneumokokkovaya infektsiya v Rossiyskoi Federatsiyi: sostoyaniye problemy. Vestnik RAMN. 2021; 76(1): 28–42 (In Russ). doi: https://doi.org/10.15690/vramn1404Белошицкий Г. В., Королева И. С. Серотиповой пейзаж пневмококков, выделенных при пневмококковом менингите, в Российской Федерации // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2015. №2 (81). С. 19–25.Beloshitskiy G.V., Korolyova I.S. Serotipovoy peizazh pnevmokokkov, vydelennyh pri pnevmokokkovom meningite, v Rossiiskoy Federatsiyi. Epidemioligija I vaktsinoprofilaktika;. 2015. No.2 (81). P. 19–25 (In Russ).Козлов Р. С., Чагарян А. Н., Козлова Л. В. и др. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. Т. 13, №2, С.177–187.Kozlov R.S, Chagarian А.N., Kozlova L.V., et al. Serologitcheskaya haraktersistika I chuvstvilel’nost k antibiotikam pnevmokokkov, vydelennyh u detey v vozraste do 5 let v otdel’nyh regionah Rossiiskoy Federatsii. Klinicheskaya mikrobioligiya I antimikrobnaya himioterapiya. 2001; 13(2):177–187 (In Russ).Голубкова А. А., Сомова А. В. Роль Streptococcus pneumoniae в этиологии внебольничных пневмоний в крупном промышленном регионе Российской Федерации. Тихоокеанский медицинский журнал. 2018. № 3. С. 29–33.Golubkova A.A., Somova A.V. Rol’ Streptococcus pneumoniae v etiologii vnebol’nychnyh pnevmoniy v krupnom promyshlennom regione Rossiiskoy Federatsiyi. Tihookeanskiy meditsinskiy zhurnal. 2018. No 3. P 29–33 (In Russ).van Gils E.J., Veenhoven R.H., Hak E., et al. Pneumococcal conjugate vaccination and nasopharyngeal acquisition of pneumococcal serotype 19A strains // JAMA. 2010. Vol. 304, N10. P. 1099–1106.van Gils E.J., Veenhoven R.H., Hak E., et al. Pneumococcal conjugate vaccination and nasopharyngeal acquisition of pneumococcal serotype 19A strains. JAMA. 2010. Vol. 304, N10. P. 1099–106. DOI:10.1001/jama.2010.1290Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae // Clin Microbiol Infect. 2009. Vol. 15, Suppl. 3. Р. 7–11.Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae. Clin Microbiol Infect. 2009. Vol. 15, Suppl. 3. Р. 7–11. DOI:10.1111/j.1469-0691.2009.02724.xФельдблюм И. В., Семериков В. В., Голоднова С. О. и др. Результаты серотипирования Str. pneumoniae, циркулирующих на территории г. Перми // Здоровье семьи – 21 век. 2013. Т. 2. №2. С. 200–210.Fel’dblum I.V., Semerikov V.V., Golodnova S.O., et al. Rezultaty serotipirovaniya Str. Pneumoniae, tsirkuliruyushchih na territoriyi g. Permi. Zdorov’ye sem’yi – 21 vek. 2013; 2(2): 200–210 (In Russ).Hausdorff W.P., Bryant J., Paradiso P.R., Siber G.R. Which pneumococcal serogroups cause the most invasive diseases: implications for conjugate vaccine formulation and use. Clin Infect Dis 2000. Vol. 30, N1. Р. 100–121.Hausdorff W.P., Bryant J., Paradiso P.R., Siber G.R. Which pneumococcal serogroups cause the most invasive diseases: implications for conjugate vaccine formulation and use. Clin Infect Dis 2000. Vol. 30, N1. Р. 100–121. DOI:10.1086/313608Маянский Н. А., Алябьева Н. М., Лазарева А. В. и др. Серотиповое разнообразие и резистентность пневмококков. Вестник Российской академии медицинских наук. 2014. Т.69, №7–8. С. 38–45.Mayanskiy N.A., Alyab’yeva N.M., Lazareva A.V., et al. Serotipovoye raznoobraziye I reziztentnost’ pnevmokokkov. Vestnik Rossiyskoy akademiyi meditsinskih nauk. 2014;69 (7–8): 38–45 (In Russ).Hausdorff WP, Feikin DR, Klugman KP. Epidemiological differences among pneumococcal serotypes. Lancet Infect Dis 2005. Vol. 5. P. 83–93.Hausdorff WP, Feikin DR, Klugman KP. Epidemiological differences among pneumococcal serotypes. Lancet Infect Dis 2005. Vol. 5. P. 83–93. DOI 10.1016/S1473-3099(05)70083-9

The authors declare that there are no conflicts of interest present.