epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2016-15-4-29-36epidemiology-177Research ArticleИНФОРМАЦИЯ ВОЗWHO INFORMATIONМолекулярная эпидемиология туберкулезной инфекции в Омской областиMolecular Epidemiology of Tuberculosis Infection in Omsk RegionПасечникО. А.PasechnikO. A.opasechnik@mail.ruДымоваМ. А.DymovaM. A.noemail@neicon.ruФилипенкоМ. Л.FilipenkoM. L.noemail@neicon.ruСтасенкоВ. Л.StasenkoV. L.noemail@neicon.ruТатаринцеваМ. П.TatarintsevaM. P.noemail@neicon.ruПавликА. А.PavlikA. A.noemail@neicon.ruГБОУ ВПО «Омский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииRussian FederationФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАНRussian FederationКУЗОО «Клинический противотуберкулезный диспансер»Russian Federation2016200820161542936Copyright © Пасечник О.А., Дымова М.А., Филипенко М.Л., Стасенко В.Л., Татаринцева М.П., Павлик А.А., 20162016Пасечник О.А., Дымова М.А., Филипенко М.Л., Стасенко В.Л., Татаринцева М.П., Павлик А.А.Pasechnik O.A., Dymova M.A., Filipenko M.L., Stasenko V.L., Tatarintseva M.P., Pavlik A.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/177

В Омской области в 2005 - 2014 годах наблюдалась тенденция к снижению заболеваемости населения туберкулезом (ТБ). Вместе с тем динамика распространенности ТБ с множественной лекарственной устойчивостью характеризовалась умеренной тенденцией к росту с 29,6 до 38,3 на 100 тыс. населения (Р < 0,05). С целью изучения молекулярно-генетических особенностей основных генотипов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Омской области, было проведено VNTR-типирование ДНК изолятов M. tuberculosis, полученных от 100 больных туберкулезом органов дыхания. В результате типирования было идентифицировано 36 генетических типов. В состав 10 кластеров различного размера вошли 74 изолята. К генетическому семейству Beijing относились 77,0% кластеризующихся изолятов (ОШ = 25,7, ДИ 6,87 * 96,17). Среди уникальных изолятов преобладали М. tuberculosis неустановленных генотипов, не относящихся к семейству Beijing (ОШ = 0,11, 95% ДИ 0,04 * 0,30), а также редко встречающихся генотипов Uganda I, Haarlem, S. Частота кластеризации в данном исследовании составила 64%, что указывает на значительную долю случаев туберкулеза, связанных с активной передачей микобактерий ТБ. Полученные данные представляют интерес для оценки и выбора наиболее эффективных мер предупреждения распространения штаммов с множественной лекарственной устойчивостью на территории Омской области.

Relevance. In the Omsk region in 2005 - 2014 tended to decrease morbidity of tuberculosis infection. However, the dynamics of tuberculosis with multidrug resistance was characterized by a moderate upward trend from 29.6 to 38.3 per 100 thousand population (P < 0.05). Goal. Characteristics of the epidemic process of tuberculosis in the Omsk region for 10 years, molecular genetic features of leading genotypes of M. tuberculosis, circulating in the area to evaluate and select the most effective measures to prevent the spread of multidrug-resistant tuberculosis. Materials and methods. Studied with MIRU-VNTR-typing M. tuberculosis isolates from patients with active pulmonary tuberculosis (n = 100). All patients were inhabitants of Omsk region and treated in health organizations of TB in 2013 - 2014. Results. 36 genetic types have been identified in the result of typing. The composition of the 10 clusters of various sizes included 74 isolates. For genetic family Beijing treated 77.0% of isolates clustered (OR = 25.7, CI 6.87 * 96.17). Among the unique isolates of M. tuberculosis was dominated by unidentified genotypes, non-family Beijing (OR = 0.11, 95% CI 0,04 * 0,30), as well as rare genotypes Uganda I, Haarlem, S. Frequency clustering in this study was 64%, indicating that a significant proportion of cases of tuberculosis associated with active Mycobacterium tuberculosis transmission. Conclusions. The data obtained are of interest for the evaluation and selection of the most effective measures to prevent the spread of strains of multi-drug resistance in the Omsk region.

эпидемиологияраспространенностьMIRU-VNTR-типированиекластерыгенотипыгенотип BeijingepidemiologyprevalenceMIRU-VNTR-typingclustersgenotypesgenotype BeijingReferencesПасечник О.А., Стасенко В.Л., Блох А.И. Эпидемиологические проявления туберкулезной инфекции в регионах Сибири с различной распространенностью ВИЧ-инфекции. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2015; 5 (84): 31 - 35.Pasechnik O.A., Stasenko V.L., Bloh A.I. Epidemic Manifestations of Tuberculosis in Regions of Siberia with Various Prevalence of HIV Infection. Epidemiologiya i Vakcinoprofilaktika [Epidemiology and Vaccinal Prevention]. 2015; 5 (84): 31 – 35 (in Russian).Пасечник О.А., Астафурова Е.Д, Бокарева Р.В., Кортусова Л.Н. Особенности спектра лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза у впервые выявленных больных. Современные проблемы науки и образования.2014; 6: 1024.Pasechnik O.A., Astafurova E.D., Bokareva R.V., Kortusova L.N. Characteristics of the Spectrum of drug resistance of Mycobacterium tuberculosis among new cases. Sovremennye problemy nauki i obrazovaniya [Modern problems of science and education]. 2014; 6: 1024 (in Russian).Мокроусов И.В. Методологические подходы к генотипированию Mycobacterium tuberculosis для эволюционных и эпидемиологических исследований. Инфекция и иммунитет. 2012; 2 (3); 603 - 614.Mokrousov I.V. Methodological approaches to Mycobacterium tuberculosis genotyping for Evolutionary and Epidemiological research. Infeksiya i immunitet. [Infection and Immunity]. 2012; 3: 603 – 614 (in Russian).Ribeiro F.K., Pan W., Bertolde A.,Vinhas S. A., Peres R.L., Riley L.Genotypic and spatial analysis of Mycobacterium tuberculosis transmission in a high-incidence urban setting. Clin. Infect. Dis.2015; 61 (5): 758 - 66. DOI: 10,1093/CID/civ365.Ribeiro F.K., Pan W., Bertolde A.,Vinhas S. A., Peres R.L., Riley L. Genotypic and spatial analysis of Mycobacterium tuberculosis transmission in a highincidence urban setting. Clin. Infect. Dis. 2015; 61 (5): 758-66. DOI: 10,1093/CID/civ365.Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Вязовая А.А., Лялина Л.В., Шульгина М.В., Мясникова Е.Б. и др. Молекулярно-генетические исследования возбудителя в системе эпидемиологического надзора за туберкулезом. Медицинский альянс. 2014; 1: 75 - 78.Narvskaya O.V., Mokrousov I.V.,Vyazovaya A.A., Lyalina L.V., Shulgina M.V., MyasnikovaE.B. et al. Causing agent molecular-genetic analysis in TB epidemiological surveillance. Medicinskij al›yans [Medical alliance]. 2014; 1:75 – 78 (in Russian).Embden J.D.van, Cave M.D., Crawford J.T., Dale J.W., Eisenach K.D., Giequel B. et al. Strainidentification of Mycobacterium tuberculosis by DNA Fingerprinting: Recommendations for a Standartized Methodology. J. Clin. Microbiol. 1993; 31 (2): 406 - 409.Embden J.D. van, Cave M.D., Crawford J.T., Dale J.W., Eisenach K.D., Giequel B. et al. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA Fingerprinting: Recommendations for a Standartized Methodology. J. Clin. Microbiol.1993; 31 (2): 406 – 409.Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., R sch-Gerdes S., Willery E. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 2006; 44 (12): 4498 - 4510.Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rüsch-Gerdes S., Willery E. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 2006; 44 (12): 4498 – 4510.Дымова М.А., Альховик О.И., Чередниченко А.Г., Храпов Е.А., Петренко Т.И., Филипенко М.Л. Генотипирование изолятов Mycobacterium tuberculosis, характеризующихся широкой лекарственной устойчивостью. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина. 2013; 11 (1): 110 - 117.Dymova M. A., Alkhovik O. I., Cherednichenko A. G., Khrapov E. A., Petrenko T. I., Filipenko M. L. Genotyping of isolates of Mycobacterium tuberculosis,characterized by extensively drug resistance.Vestnik NSU. Vestnik NGU. Seriya: Biologiya, klinicheskayamedicina [Herald of NSU. Series: biology, clinical medicine. 2013; 1: 110 – 117 (in Russian).Nava-Aguilera E., Andersson N., Harris E., Mitchell S., Hamel C., Shea B. et al. Risk factors associated with recent transmission of tuberculosis: systematic review and meta-analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2009; 13: 17 - 26.Nava-Aguilera E., Andersson N., Harris E. Mitchell S., Hamel C., Shea B. et al. Risk factors associated with recent transmission of tuberculosis: systematic review and meta-analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2009; 13: 17 – 26.Munch Z., VanLill S.W., Booysen C.N., Zietsman H.L., Enarson D.A., Beyers N. Tuberculosis transmission patterns in a higt-incidence area: a spatial analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2003; 7: 271 - 277.Munch Z., Van Lill S.W., Booysen C.N., Zietsman H.L., Enarson D.A., Beyers N. Tuberculosis transmission patterns in a higt-incidence area: a spatial analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis.2003;7: 271-7.Концевая И.С., Николаевский В.В. Роль генетической группы Beijing Mycobacterium tuberculosis в эпидемиологии туберкулеза в Российской Федерации. Биомика. 2014; 6 (1): 13 - 23.Kontsevaya I.S., Nikolayevskyy V.V. The role of Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage in tuberculosis epidemiology in Russian Federation. Biomika [Biomics]. 2014; 1: 13 – 23 (in Russian).Ляшенко А.А. Генетические варианты микобактерий туберкулеза и их эпидемиологическая значимость. Science Rise. 2015; 3/4 (8): 13 - 18.Lyashenko A.A. Genetic variants of Mycobacterium tuberculosis and their epidemiological importance. ScienceRise. 2015; 3/4 (8): 13 – 18 (in Russian).Огарков О.Б., Жданова С.Н., Мокроусов И.В., Винокурова М.К., Алексеева Г.И., Баранова Ю.А., и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика штаммов M. tuberculosis семейства S Cаха (Якутия). Сибирский медицинский журнал. 2014; 6: 109 - 111.Ogarkov O.B., Zhdanova S.N., Mokrousov I.V., Vinokurova M.K., Alekseeva G.I., Baranova Y.A. et al. Molecular epidemiological features of M. tuberculosis family S in Sakha (Yakutia). Sibirskij Medicinskij Zurnal [Siberian Medical Journal]. 2014; (6):109 – 111 (in Russian).Fok A., Numata Y., Schultzer M., FitzGerald M.J. Risk factors for clustering of tuberculosis cases: a systematic review of population-based molecular epidemiology studies. Int. J. Tuberc. lung Dis. 2008. 12 (5): 480 - 492.Fok A., Numata Y., Schultzer M., Fitzgerald M.J. Risk factors for clustering of tuberculosis cases: a systematic review of population-based molecular epidemiology studies. Int. J. Tuberc. lung Dis. 2008. 12 (5): 480 – 492.Андреевская С.Н., Черноусова Л.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., Кузьмин А.В. Трансмиссия штаммов микобактерий туберкулеза, обусловленная миграционными процессами в Российской Федерации. Туберкулез и болезни легких. 2006; 1: 29 - 35.Andreevskaya S.N., Chernousova L.N., Smirnova T.G., Larionova E.E., KuzminA.V. Transmission of Mycobacterium tuberculosis strains, due to migration processes in the Russian Federation. Tuberkulez i bolezni legkih [Tuberculosis and Lung Disease]. 2006; 1: 29 – 35 (in Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.