epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2024-23-1-51-56epidemiology-1939Research ArticleПРАКТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ЭПИДЕМИОЛОГИИ И ВАКЦИНОПРОФИЛАКТИКИPRACTICAL ASPECTS OF EPIDEMIOLOGY AND VACCINE PREVENTIONЭтиологическая структура внебольничных пневмоний в период эпидемии COVID-19Etiological Structure of Community-Acquired Pneumonia in the period of COVID-19 epidemichttps://orcid.org/0000-0002-2729-2248СергевнинВ. И.SergevninV. I.

Виктор Иванович Сергевнин – д. м. н., профессор кафедры эпидемиологии и гигиены,

Пермь,

тел. +7 (912) 592-91-40.

Victor I. Sergevnin– Dr. Sci. (Med.), Professor of the Department of Hygiene and Epidemiology,

Perm,

tel. +7 (912) 592-91-40.

viktor-sergevnin@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1113-1001РожковаМ. В.RozhkovaM. V.

Марина Владимировна Рожкова – заведующая организационно-методическим отделом,

Пермь,

тел.+7 (950) 458-47- 02.

Marina V. Rozhkova – Head of the Organizational and Methodological Department,

Perm,

tel.+7 (950) 458-47-02.

RozhkovaMary@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9677-6935ОвчинниковК. В.OvchinnikovK. V.

Кирилл Вячеславович Овчинников – главный врач,

Пермь,

тел.+7 (992) 214-17-50.

Kirill V. Ovchinnikov – Chief Medical Officer, 

Perm,

tel.+7 (992) 214-17-50.

okv-ac@mail.ruКузовниковаЕ. Ж.KuzovnikovaE. Zh.

Елена Жернольдовна Кузовникова – заместитель главного врача,

Пермь,

тел.+7 (912) 98-96-814.

Elena Zh. Kuzovnikova – Deputy Chief Physician,

Perm,

tel.+7 (912) 98- 96-814

antroponoz@yandex.ruФГБОУ ВО «Пермский государственный медицинский университет имени академика Е. А. Вагнера» Минздрава РоссииРоссияPerm State Medical University named after Academician E.A. WagnerRussian FederationГКУЗ ПК «Пермский краевой центр по борьбе и профилактике со СПИД и инфекционными заболеваниями»РоссияPerm Regional Center for Control and Prevention of AIDS and Infectious DiseasesRussian FederationГКУЗ ПК «Пермский краевой центр по борьбе и профилактике со СПИД и инфекционными заболеваниями»РоссияPerm Regional Center for Control and Prevention of AIDS and Infectious Diseases, Perm, Russia. +7 (992) 214-17-50Russian FederationФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Пермском крае» РоспотребнадзораРоссияPerm Center of Hygiene and Epidemiology in Perm Region of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human WellbeingRussian Federation2024010320242315156Copyright © Сергевнин В.И., Рожкова М.В., Овчинников К.В., Кузовникова Е.Ж., 20242024Сергевнин В.И., Рожкова М.В., Овчинников К.В., Кузовникова Е.Ж.Sergevnin V.I., Rozhkova M.V., Ovchinnikov K.V., Kuzovnikova E.Z.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1939

Актуальность. Изучение этиологической структуры внебольничных пневмоний (ВП) на фоне широкой циркуляции SARS-CoV-2 представляет практический интерес для оперативного выбора тактики лечения. Цель. Оценка возможного влияния новой коронавирусной инфекции на спектр возбудителей внебольничной пневмонии для эмпирического выбора антибактериальной терапии. Материалы и методы. Этиологию ВП оценивали по результатам бактериологических и молекулярно-генетических исследований проб мокроты и смывов с задней стенки глотки 142 детей и 190 взрослых пациентов в первые 2 дня от момента госпитализированных в две медицинские организации г. Перми в 2021–2022 гг. с первичным диагнозом «внебольничная пневмония». У 131 ребенка SARS-CoV-2 не был обнаружен, у 11 – выявлен, у 84 взрослых отрицательный результат тестирования, у 106 – положительный. Результаты. У больных ВП при наличии COVID-19 по сравнению с SARS-CoV-2-негативными пациентами достоверно установлено более частое выделение K. pneumoniaе, S. aureus, S. haemolyticus и ДНК H. influenzaе, а также микробных ассоциаций бактериальной этиологии. Заключение. Результаты исследования могут быть использованы при выборе тактики лечения сочетанной инфекции.

Relevance. The etiological structure of community-acquired pneumonia (CAP) with the widespread COVID-19 as backdrop is poorly studied. Aim. Comparative study of community-acquired pneumonia etiological structure in patients with and without a new coronavirus infection. Materials and methods. The etiology of CAP was estimated on the base of the results of bacteriological and molecular genetic studies of sputum samples and swabs from the posterior pharyngeal wall in 142 children and 190 adults in 1- 2 days from the moment they were hospitalized to two medical organizations of Perm in the period of 2021-2022 with a primary diagnosis of CAP. There were 131 negative and 11 positive for SARS-CoV-2 among pediatric patients. There were 84 negative and 106 – positive for SARS-CoV-2 among the adults. Results. It was found that in patients with CAP in the presence of COVID19, compared with SARS-CoV-2-negative patients, a more frequent isolation of K. pneumoniae, S. aureus, S. haemolyticus and H. influenzae DNA, as well as microbial associations of bacterial etiology. Conclusion. The results of the study can be used when choosing treatment tactics for combined infections.

COVID 19внебольничные пневмониивиды бактерийреспираторные вирусыCOVID 19community-acquired pneumoniabacterial speciesrespiratory virusesReferencesПопова А. Ю., Ежлова Е. Б., Демина Ю. В. и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 4:99–105. doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105.Popova A. Yu., Yezhova E. B., Demina Yu. V., et al. Features of the etiology of community-acquired pneumonia associated with COVID-19. Problems of particularly dangerous infections. 2020; 4:99–105. doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105 (In Russ.).Стулова М.В., Кудряшева И.А., Полунина О.С., и др. Сравнительный клинико-лабораторный анализ COVID-19 ассоциированной пневмонии с внебольничной пневмонией бактериальной этиологии. Современные проблемы науки и образования, 2020; 3: 134. doi: 10.17513/spno.29905.Stulova M. V., Kudryasheva I. A., Polunina O. S., et al. Comparative clinical and laboratory analysis of COVID-19 associated pneumonia with community-acquired pneumo- nia of bacterial etiology. Modern Problems of Science and Education, 2020; 3:134. doi: 10.17513/spno.29905 (In Russ.).Lai CC., Wang CY., Hsueh PR. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020; 53(4): 505–12. doi: 10.1016/j.jmii.2020.05.013.Lai CC., Wang CY., Hsueh PR. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020; 53(4): 505–12. doi: 10.1016/j.jmii.2020.05.013.Lucien MAB, Canarie MF, Kilgore PE, et al. Antibiotics and antimicrobial resistance n the COVID-19 era: Perspective from resourcelimited settings. Int J Infect Dis. 2021; 104: 250–4. doi: 10.1016/j.ijid.2020.12.087.Lucien MAB, Canarie MF, Kilgore PE, et al. Antibiotics and antimicrobial resistance n the COVID-19 era: Perspective from resourcelimited settings. IntJInfectDis. 2021; 104: 250–4. doi: 10.1016/j.ijid.2020.12.087.Портенко С. А., Казакова Е. С., Найденова Е. В. и др. Этиологическая структура внебольничных пневмоний в условиях пандемии новой коронавирусной инфекции в Саратовской области. Инфекция и иммунитет. 2022;12 (1):95–104. doi: 10.15789/2220-7619-AEO-1747.Portenko S. A., Kazakova E. S., Naidenova E. V., et al. Etiological pattern of community-acquired pneumonia related to the new coronavirus infection covid-19 pandemic in the Saratov region. Infection and immunity. 2022;12 (1): 95–104. doi: 10.15789/2220-7619-AEO-1747 (In Russ.).Di Mitri C, Arcoleo G, Mazzuca E, et al. COVID-19 and non–COVID-19 pneumonia: a comparison. Pulmonary Medicine. 2021. Pages 2321-2331 | Received, Accepted 19 Nov 2021, Published online: 02 Dec 2021. doi: 10.1080/07853890.2021.2010797.Di Mitri C, Arcoleo G, Mazzuca E, et al. COVID-19 and non–COVID-19 pneumonia: a comparison. Pulmonary Medicine. 2021.Pages 2321-2331 | Received, Accepted 19 Nov 2021, Published online: 02 Dec 2021. doi: 10.1080/07853890.2021.2010797.Getahun H, Smith I, Trivedi K, et al. Tackling antimicrobial resistance in the COVID-19 pandemic. Bull World Health Organ. 2020; 98(7): 442–442A. doi: 10.2471/BLT.20.268573.Getahun H, Smith I, Trivedi K, et al. Tackling antimicrobial resistance in the COVID-19 pandemic. Bull World Health Organ. 2020; 98(7): 442–442A. doi: 10.2471/BLT.20.268573.Lansbury L, Lim B, Baskaran V, Lim WS. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J Infect. 2020; 81(2): 266–75. doi: 10.1016/j.jinf.2020.05.046.Lansbury L, Lim B, Baskaran V, Lim WS. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J Infect. 2020; 81(2): 266–75. doi: 10.1016/j.jinf.2020.05.046.Катаева Л. В., Вакарина А. А., Степанова Т. Ф., Степанова К. Б. Микробиота нижних дыхательных путей при внебольничных пневмониях, в том числе ассоциированных c SARS-CoV-2. Журнал микробиологии, эпидемиологиии и ммунобиологии. 2021;98(5):528–537. doi: 10.36233/0372-9311-10.7.Kataeva L.V., Vakorina A.A., Stepanova T.F., Stepanova K.B. Microbiota of the lower respiratory tract in community-acquired pneumonia, including associated with SARSCoV-2. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2021;98(5):528–537. doi: 10.36233/0372-9311-10.7 (In Russ.).Howard ML. Is There an Association Between Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and Streptococcus pneumoniae? Clinical Infectious Diseases, 2021; 72(5):76–78. doi: 10.1093/cid/ciaa1812.Howard ML. Is There an Association Between Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and Streptococcus pneumoniae? Clinical Infectious Diseases, 2021; 72 (5):76–78. doi: 10.1093/cid/ciaa1812.Du Toit A. Measles increases the risk of other infections. Nat Rev Microbiol. 2019; 18(1):2. doi: 10.1038/s41579-019-0301-7.Du Toit A. Measles increases the risk of other infections. Nat Rev Microbiol. 2019; 18(1):2. doi: 10.1038/s41579-019-0301-7.Zhou Y, Guo S, He Y, et al. COVID-19 is distinct from SARS-CoV-2-negative community-acquired pneumonia .Front Cell Infect Microbiol. 2020; 10:322. doi: 10.3389/fcimb.2020.00322.Zhou Y, Guo S, He Y, et al. COVID-19 is distinct from SARS-CoV-2-negative community-acquired pneumonia.FrontCellInfectMicrobiol. 2020; 10:322. doi: 10.3389/fcimb.2020.00322.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.