epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2025-24-1-10-17epidemiology-2164Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESГенетическое разнообразие вируса эпидемического паротита в Российской ФедерацииGenetic Diversity of Mumps Virus in Russian Federationhttps://orcid.org/0000-0003-0838-7353РубальскаяТ. С.RubalskaiaT. S.

Татьяна Сергеевна Рубальская – руководитель лаборатории прикладной иммунохимии

Москва

+7 (495) 452-28-26

Tatiana S. Rubalskaia – head of laboratory of applied biochemistry

Moscow

+7 (495) 452-28-26

rubalskaia@gabrich.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7163-7840ЕроховД. В.ErokhovD. V.

Денис Вадимович Ерохов – научный сотрудник лаборатории прикладной иммунохимии

Москва

+7 (495) 452-28-26

Denis V. Erokhov – researcher of laboratory of applied biochemistry

Moscow

+7 (495) 452-28-26

erokhov@gabrich.ruЦвиркунО. В.TsvirkunO. V.

Ольга Валентиновна Цвиркун – руководитель эпидемиологического отдела; доцент кафедры инфекционных болезней

Москва

+7 (495) 452-28-26

Olga V. Tsvirkun – head of epidemiology department; associate professor

Moscow

+7 (495) 452-28-26

o.tsvirkun@gabrich.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3338-9679МизаеваИ. Э.MizaevaI. E.

Иман Эдалбековна Мизаева – младший научный сотрудник лаборатории прикладной иммунохимии

Москва

+7 (495) 452-28-26

Iman E. Mizaeva – junior researcher of laboratory of applied biochemistry

Moscow

+7 (495) 452-28-26

imaanii@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7657-4631ТураеваН. В.TuraevaN. V.

Наталья Викторовна Тураева – руководитель лаборатории профилактики вирусных инфекций

Москва

+7 (495) 452-28-26

Natalia V. Turaeva – head of laboratory for the prevention of viral infections

Moscow

+7 (495) 452-28-26

turaeva@gabrich.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8762-4355ТихоноваН. Т.TikhonovaN. T.

Нина Тимофеевна Тихонова – главный научный сотрудник лаборатории цитокинов

Москва

+7 (495) 452-28-26

Nina T. Tikhonova – senior scientist of laboratory of cytokines

Moscow

+7 (495) 452-28-26

tikhmail@mail.ruФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им Г. Н. Габричевского» РоспотребнадзораРоссияG.N. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им Г. Н. Габричевского» Роспотребнадзора; ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов им. П. Лумумбы»РоссияG.N. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and Microbiology; Peoples' Friendship University of RussiaRussian Federation2025080320252411017Copyright © Рубальская Т.С., Ерохов Д.В., Цвиркун О.В., Мизаева И.Э., Тураева Н.В., Тихонова Н.Т., 20252025Рубальская Т.С., Ерохов Д.В., Цвиркун О.В., Мизаева И.Э., Тураева Н.В., Тихонова Н.Т.Rubalskaia T.S., Erokhov D.V., Tsvirkun O.V., Mizaeva I.E., Turaeva N.V., Tikhonova N.T.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2164

Актуальность. Одним из компонентов эпидемиологического надзора за корью, краснухой и эпидемическим паротитом является вирусологический мониторинг циркуляции возбудителей этих инфекций. Если в рамках реализации Программы элиминации кори и краснухи единые методы мониторинга циркуляции вирусов кори и краснухи и интерпретации полученных данных рекомендованы ВОЗ и применяются во всем мире, то в отношении вируса эпидемического паротита такой практики нет. Настоящая работа посвящена изучению генетического разнообразия вируса эпидемического паротита в России с применением ранее апробированных авторами методов молекулярно-эпидемиологических исследований.Цель. Изучить генетическое разнообразие вируса эпидемического паротита в России в 2022–2023 гг.Материалы и методы. Образцы биологического материала от 25 больных с диагнозом «Эпидемический паротит» были получены с территорий страны с высокой и низкой заболеваемостью паротитом в 2022–2023 гг. Проведена экстракция вирусной РНК, ОТ-ПЦР, секвенирование по Сэнгеру, биоинформатический анализ данных. Выделенные нуклеотидные последовательности депонированы в базы данных GenBank.Результаты. По результатам исследования установлено, что в России в 2022–2023 гг. циркулировали вирусы эпидемического паротита генотипа G. Выявлена трансмиссия двух генетических групп – G1 и G2. Геногруппа G1 относится к генетической линии MuVi/Sheffield.GBR/1.05, геногруппа G2 – MuVi/Gloucester.GBR/32.96. Для каждой генетической группы определен ареал циркуляции.Заключение. Несмотря на то, что обе геногруппы были представлены преимущественно вирусами, выделенными в России, отсутствие значимой корреляции между матрицами расстояний не позволяет сделать заключение об эндемичной трансмиссии геногрупп G1 и G2 в стране на основании имеющихся молекулярных данных. В рамках реализации Национальной программы «Элиминация кори и краснухи, достижение устойчивой спорадической заболеваемости эпидемическим паротитом» изучение циркулирующих генотипов вируса ЭП является актуальным и будет продолжено.

Relevance. In the establishment of a unified epidemiological surveillance system for measles, rubella, and mumps, virological monitoring of the circulation of these pathogens is essential. While standardized methods for monitoring the circulation of measles and rubella viruses and interpreting the obtained data are recommended by the WHO and applied globally, no such practice exists for the mumps virus. This study focuses on examining the genetic diversity of the mumps virus in Russia using molecular epidemiological methods previously validated by the authors.Aim. To investigate the genetic diversity of the mumps virus in Russia in 2022–2023.Materials and methods. Biological material samples from 25 patients diagnosed with "Mumps" were obtained from regions with high and low mumps incidence in 2022–2023. Viral RNA extraction, RT-PCR, Sanger sequencing, and bioinformatic data analysis were conducted. The identified nucleotide sequences were deposited in the GenBank database.Results. The study found that mumps viruses of genotype G circulated in Russia in 2022–2023. Transmission of two genetic groups, G1 and G2, was identified. Genogroup G1 belongs to the genetic lineage MuVi/Sheffield.GBR/1.05, and genogroup G2 to MuVi/Gloucester.GBR/32.96. The circulation area for each genetic group was determined.Conclusions. Despite both genogroups being predominantly represented by viruses isolated in Russia, the lack of significant correlation between distance matrices does not allow for a conclusion about the endemic transmission of genogroups G1 and G2 in the country based on the available molecular data. Within the framework of the National Program "Elimination of Measles and Rubella, Achieving Sustainable Sporadic Incidence of Mumps," the study of circulating mumps virus genotypes is relevant and will be continued.

эпидемический паротитвирус эпидемического паротитагенотипгенетическое разнообразие Конфликт интересов не заявленАвторы выражают признательность Р. А. Арбухановой (Управление Роспотребнадзора по Республике Дагестан) и А. В. Милихиной и А. А. Гаджиевой (ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Республике Дагестан») за предоставление результатов эпидемиологических расследованийThe authors express their gratitude to R. A. Arbukhanova (Rospotrebnadzor Office for the Republic of Dagestan) and A. V. Milikhina and A. A. Gadzhieva (Center for Hygiene and Epidemiology in the Republic of Dagestan) for providing the results of epidemiological investigationsReferencesНациональная программа «Элиминация кори и краснухи, достижение устойчивой спорадической заболеваемости эпидемическим паротитом в Российской Федерации (2021–2025 гг.)»Natsional'naya programma «Eliminatsiya kori i krasnukhi, dostizheniye ustoychivoy sporadicheskoy zabolevayemosti epidemicheskim parotitom v Rossiyskoy Federatsii (2021–2025 gg.) »Manual for the Laboratory-based Surveillance of Measles, Rubella, and Congenital Rubella Syndrome. Third edition, June 2018. TechNet-21. Доступно на: https://www. technet-21.org/en/manual-introduction (18.04.2024)Manual for the Laboratory-based Surveillance of Measles, Rubella, and Congenital Rubella Syndrome. Third edition, June 2018. TechNet-21. Available at: https://www. technet-21.org/en/manual-introduction (18.04.2024)Mumps virus nomenclature update: 2012. Wkly Epidemiol. Rec. Institutional Repository for Information Sharing. Доступно на: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/241922/WER8722_217-224.PDF?sequence=1&isAllowed=y (18.04.2024)Mumps virus nomenclature update: 2012. Wkly Epidemiol. Rec. Institutional Repository for Information Sharing. Available at: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/241922/WER8722_217-224.PDF?sequence=1&isAllowed=y (18.04.2024)Рубальская Т. С., Ерохов Д. В., Жердева П. Е. и др. Генотипирование вируса эпидемического паротита (Paramyxoviridae: Orthorubulavirus: Mumps orthorubulavirus) как элемент лабораторного подтверждения инфекции. Вопросы вирусологии. 2023. Т. 68, No 1. C. 59–65. doi: 10.36233/0507-4088-157Rubalskaia TS, Erokhov DV, Zherdeva PE, et al. Mumps virus (Paramyxoviridae: Orthorubulavirus: Mumps orthorubulavirus) genotyping as a component of laboratory confirmation of infection. Problems of Virology. 2023;68(1):59–65. doi:10.36233/0507-4088-157.WMA Declaration оf Helsinki – Ethical Principles for Medical Research Involving Human Subjects. World Medical Association. Доступно на: https://www.wma.net/policies-post/wma-declaration-of-helsinki-ethical-principles-for-medical-research-involving-human-subjects/ (18.04.2024)WMA Declaration оf Helsinki – Ethical Principles for Medical Research Involving Human Subjects. World Medical Association. Available at: https://www.wma.net/policiespost/wma-declaration-of-helsinki-ethical-principles-for-medical-research-involving-human-subjects/ (18.04.2024)Tamura K, Nei M, Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method. Proc Natl Acad Sci USA. 2004;101(30):11030–11035. doi:10.1073/pnas.0404206101Tamura K, Nei M, Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method. Proc Natl Acad Sci USA. 2004;101(30):11030–11035. doi:10.1073/pnas.0404206101Peakall R, Smouse PE. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research--an update. Bioinformatics. 2012;28(19):2537-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts460Peakall R, Smouse PE. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research--an update. Bioinformatics. 2012;28(19):2537-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts460Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации в 2022 году»Gosudarstvennyy doklad «O sostoyanii sanitarno-epidemiologicheskogo blagopoluchiya naseleniya Rossiyskoy Federatsii v 2022 godu»Hiebert J, Saboui M, Frost JR, et al. Mumps resurgence in a highly vaccinated population: Insights gained from surveillance in Canada, 2002-2020. Vaccine. 2023;41(25):3728–3739. doi:10.1016/j.vaccine.2023.04.078Hiebert J, Saboui M, Frost JR, et al. Mumps resurgence in a highly vaccinated population: Insights gained from surveillance in Canada, 2002–2020. Vaccine. 2023;41(25):3728–3739. doi:10.1016/j.vaccine.2023.04.078Moncla LH, Black A, DeBolt C, et al. Repeated introductions and intensive community transmission fueled a mumps virus outbreak in Washington State. Elife. 2021;10:e66448. Published 2021 Apr 19. doi:10.7554/eLife.66448Moncla LH, Black A, DeBolt C, et al. Repeated introductions and intensive community transmission fueled a mumps virus outbreak in Washington State. Elife. 2021;10:e66448. Published 2021 Apr 19. doi:10.7554/eLife.66448Semeiko GV, Samoilovich EO, Yermalovich MA. Genotypes of mumps viruses imported from Russia to Belarus. Доступно на: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/OP965810.1 (18.04.2024)Semeiko GV, Samoilovich EO, Yermalovich MA. Genotypes of mumps viruses imported from Russia to Belarus. Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/OP965810.1 (18.04.2024)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.