epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2017-16-1-22-25epidemiology-229Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYОсобенности экологии вируса клещевого энцефалита европейского субтипа на территории СибириThe Ecology Features of Tick-Borne Encephalitis Virus of European Subtype in SiberiaКозловаИ. В.KozlovaI. V.diwerhoz@rambler.ruТкачевС. Е.TkachevS. E.noemail@neicon.ruСавиноваЮ. С.SavinovaYu. S.noemail@neicon.ruДеминаТ. В.DeminaT. V.noemail@neicon.ruДорощенкоЕ. К.DoroshchenkoE. K.noemail@neicon.ruЛисакО. В.LisakO. V.noemail@neicon.ruДжиоевЮ. П.DzhioevYu. P.noemail@neicon.ruСунцоваО. В.SuntsovaO. V.noemail@neicon.ruВерхозинаМ. М.VerkhozinaM. M.noemail@neicon.ruПарамоновА. И.ParamonovA. I.noemail@neicon.ruЗлобинВ. И.ZlobinV. I.noemail@neicon.ruТикуноваН. В.TikunovaN. V.noemail@neicon.ruРужекД. .RuzekD. .ruzekd@paru.cas.czФГНБУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»РоссияScience Center of Family Health Problems and Human ReproductionRussian FederationИнститут химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RASRussian FederationИркутский государственный аграрный университет им. А.А. ЕжевскогоРоссияIrkutsk State Agrarian University named by A.A. EzhevskyRussian FederationФГНБУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»; Иркутский государственный медицинский университетРоссияScience Center of Family Health Problems and Human Reproduction; Irkutsk State Medical University of Ministry of Health of RussiaRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Иркутской областиРоссияCenter of Hygiene and Epidemiology in the Irkutsk regionRussian FederationИркутский государственный медицинский университетРоссияIrkutsk State Medical University of Ministry of Health of RussiaRussian FederationVeterinary Research InstituteРоссияVeterinary Research InstituteRussian Federation2017200220171612225Copyright © Козлова И.В., Ткачев С.Е., Савинова Ю.С., Демина Т.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Верхозина М.М., Парамонов А.И., Злобин В.И., Тикунова Н.В., Ружек Д..., 20172017Козлова И.В., Ткачев С.Е., Савинова Ю.С., Демина Т.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Верхозина М.М., Парамонов А.И., Злобин В.И., Тикунова Н.В., Ружек Д...Kozlova I.V., Tkachev S.E., Savinova Y.S., Demina T.V., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Dzhioev Y.P., Suntsova O.V., Verkhozina M.M., Paramonov A.I., Zlobin V.I., Tikunova N.V., Ruzek D...Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/229

Целью исследования являлось выявление особенностей экологии вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) европейского субтипа, циркулирующего на территории Сибири. Штаммы ВКЭ европейского субтипа из Сибири были изолированы на территориях с различным типом рельефа - от равнин до среднегорья. Районы изоляции штаммов отличались разнообразием ландшафтов, флоры и фауны, характеризовались наличием резко-континентального, в некоторых местах достаточно сурового климата. Состав основных переносчиков и резервуарных хозяев ВКЭ европейского субтипа в Сибири имеет свои особенности и существенно отличается от такового на территории Европы. Однако, несмотря на это, гомология штаммов ВКЭ европейского субтипа, изолированных в разных точках ареала вируса от скандинавских стран - на западе, до восточных границ ареала, гораздо выше, чем степень гомологии у штаммов дальневосточного и сибирского субтипов.

The aim of the study was to determine the ecology features of tick-borne encephalitis virus (TBEV) of European subtype circulating in Siberia. The strains of European subtype TBEV from Siberia were isolated in areas with different terrain types - from the plains to the midlands. The strains isolation areas differed in variety of landscapes, flora and fauna and were characterized by the presence of sharp-continental, or in some places - quite harsh climate. The composition of the main vectors and reservoir hosts of TBEV of European subtype in Siberia has its own features and is significantly different from that one in Europe. However, in spite of this, the homology of TBEV strains of European subtype isolated in different parts of habitat range of the virus from the Scandinavian countries in the West to its Eastern borders is much higher than the homology level degree of TBEV strains of FarEastern and Siberian subtypes.

вирус клещевого энцефалитаевропейский субтип\генотипэкологияtick-borne encephalitis virusEuropean subtype\genotypeecologyReferencesKing A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.J. Lefkowitz E.B. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier Academic Press; 2012.King A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.J. Lefkowitz E.B. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier Academic Press; 2012.Kim S.Y., Yun S.M., Han M.G., Lee I.Y., Lee N.Y. et al. Isolation of tick-borne encephalitis viruses from wild rodents, South Korea. Vector Borne Zoonotic Dis. 2008; 8 (1): 7 - 13.Kim S.Y., Yun S.M., Han M.G., Lee I.Y., Lee N.Y. et al. Isolation of tick-borne encephalitis viruses from wild rodents, South Korea. Vector Borne Zoonotic Dis. 2008; 8 (1): 7 – 13.Yun S.M., Kim S.Y., Han M.G., Jeong Y.E., Yong T.S., Lee C.H. et al. Analysis of the envelope (E) protein gene of tick-borne encephalitis viruses isolated in South Korea. Vector Borne Zoonotic Dis. 2009; 9 (3): 287 - 293.Yun S.M., Kim S.Y., Han M.G., Jeong Y.E., Yong T.S., Lee C.H. et al. Analysis of the envelope (E) protein gene of tick-borne encephalitis viruses isolated in South Korea . Vector Borne Zoonotic. Dis. 2009; 9 (3): 287 – 293.Верхозина М.М., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П. Молекулярно-эпидемиологическая и эколого-географическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири. В кн.: Инфекции, передаваемые иксодовыми клещами в Сибирском регионе. Новосибирск: СО РАН; 2011; 30: 84 - 107.Verhozina M.M., Kozlova I.V., Demina T.V., Dzhioev Yu.P. Molecular epidemiological and ecological and geographical characteristics of viral encephalitis in eastern Siberia. In: Infections transmitted by ticks in the Siberian region. Novosibirsk, SB RAS . 2011; (30): 84 – 107 (in Russian).Adelshin R.V., Melnikova O.V., Karan L.S., Andaev E.I., Balakhonov S.V. Complete genome sequences of four european subtype strains of tick-borne encephalitis virus from Eastern Siberia, Russia. Genome Announc. 2015; 3 (3). pii: e00609-15. doi: 10.1128/genomeA.00609-15.Adelshin R.V., Melnikova O.V., Karan L.S., Andaev E.I., Balakhonov S.V. Complete Genome Sequences of Four European Subtype Strains of Tick-Borne Encephalitis Virus from Eastern Siberia, Russia. Genome Announc. 2015; 3 (3). pii: e00609-15. doi: 10.1128/genomeA.00609-15.Якименко В.В., Ткачев С.Е., Макенов М.Т., Малькова М.Г., Любенко А.Ф., Рудакова С.А. и др. О распространении вируса клещевого энцефалита европейского субтипа в Западной Сибири и на Алтае. Дальневосточный журнал инфекц. патологии. 2015; 27: 29 - 35.Yakimenko V.V., Tkachev S.E., Makenov M.T., Mal’kova M.G., Lyubenko A.F., Rudakova S.A. et al. On the propagation of the virus encephalitis European subtype in Western Siberia and Altai. Dalnevostochnyiy zhurnal infekcionnoy patologii [Far Eastern Infectious Disease Journal]. 2015; 27: 29 – 35 (in Russian).Ткачев С.Е., Козлова И.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Сунцова О.В. и др. Особенности штаммов вируса клещевого энцефалита европейского генотипа, выявленных на территории Сибири. Здоровье населения и среда обитания. 2014; 12 (261): 51 - 53.Tkachev S.E., Kozlova I.V., Dzhioev YU.P., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Suncova O.V. et al. Features of the strains of the virus of tick-borne encephalitis of the European genotype revealed in the territory of Siberia. Zdorov’e naseleniya i sreda obitaniya [Public Health and Environment]. 2014; 12 (261): 51 – 53 (in Russian).Suss J. Epidemiology and ecology of TBE relevant to the production of effective vaccines. Vaccine. 2003; 21 (1): 19 - 35.Suss J. Epidemiology and ecology of TBE relevant to the production of effective vaccines. Vaccine. 2003; 21 (1): 19–35.Wojcik-Fatla A., Cisak E., Zajac V., Zwolinski J., Dutkiewicz J. Prevalence of tick-borne encephalitis virus in Ixodes ricinus and Dermacentor reticulatus ticks collected from the Lublin region (eastern Poland). Ticks Tick Borne Dis. 2011; 2 (1): 16 - 19.Wojcik-Fatla A., Cisak E., Zajac V., Zwolinski J., Dutkiewicz J. Prevalence of tick-borne encephalitis virus in Ixodes ricinus and Dermacentor reticulatus ticks collected from the Lublin region (eastern Poland). Ticks Tick Borne Dis. 2011; 2 (1): 16 – 19.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Козлова И.В. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. 272.Zlobin V.I., Belikov S.I., Dzhioev Yu.P., Demina T.V., Kozlova I.V. Molecular epidemiology of tick-borne encephalitis. Irkutsk: RIO VSNC SO RAMN. 2003 (in Russian).Jaaskelainen A.E., Tonteri E., Sironen T., Pakarinen L., Vaheri A., Vapalahti O. European subtype tick-borne encephalitis virus in Ixodes persulcatus ticks. Emerg. Infect. Dis. 2011; 17 (2): 323 - 325.Jaaskelainen A.E., Tonteri E., Sironen T., Pakarinen L., Vaheri A., Vapalahti O. European subtype tick-borne encephalitis virus in Ixodes persulcatus ticks. Emerg. Infect. Dis. 2011; 17 (2): 323 – 325.Kozuch O., Nosek J., Chmela E., Uvizl M., Bolek S. The ecology if the virus of tick-borne encephalitis in the natural foci in the Olomouc district (author' s transl). Cesk. Epidemiol. Mikrobiol. Immnol. 1976; 25 (2): 88 - 96.Kozuch O., Nosek J., Chmela E., Uvizl M., Bolek S. The ecology if the virus of tick-borne encephalitis in the natural foci in the Olomouc district (author’ s transl). Cesk. Epidemiol. Mikrobiol. Immnol. 1976; 25 (2): 88 – 96.International Catalogue of Arboviruses. 3rd Edition. Karabatsos N (Eds). American Society of Tropical Medicine and Hygiene, San Antonio, TX, USA (1985).International Catalogue of Arboviruses. 3rd Edition. Karabatsos N (Eds). American Society of Tropical Medicine and Hygiene, San Antonio, TX, USA (1985).Achazi K., R ek D., Donoso-Mantke O., Schlegel M., Ali Hanan Sheikh, Wenk M. et al. Rodents as Sentinels for the Prevalence of Tick-Borne Encephalitis Virus. Vector-borne and zoonotic diseases. 2011; 11 (6): 641 - 64.Achazi K., Růžek D., Donoso-Mantke O., Schlegel M., Ali Hanan Sheikh, Wenk M. et al. Rodents as Sentinels for the Prevalence of Tick-Borne Encephalitis Virus. Vector-borne and zoonotic diseases. 2011; 11 (6): 641 – 64

The authors declare that there are no conflicts of interest present.