epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073304620262548191epidemiology-2494Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESСибирский субтип вируса клещевого энцефалита: молекулярная эпидемиология, особенности клинической картины и современные парадигмы специфической профилактикиSiberian Subtype of Tick-Borne Encephalitis Virus: Molecular Epidemiology, Clinical Features, and Modern Paradigms of Specific Preventionhttps://orcid.org/0000-0002-6058-0997Конькова-РейдманА. Б.Konkova-ReidmanA. B.

Конькова-Рейдман Алена Борисовна — доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой инфекционных болезней

Тел.: +7 951 230 59 73

454141, Челябинская область, г. Челябинск, ул. Воровского, 64

Alena B. Konkova-Reidman — Dr. Sci. (Med.), Professor, Head of the Department of Infectious Diseases

Tel.: +7 951 230 59 73

64 Vorovskogo St., Chelyabinsk, Chelyabinsk Oblast, 454141

konkova-reidman@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0008-8887-4218ДубовиковС. В.DubovikovS. V.

Дубовиков Сергей Вячеславович — ассистент кафедры инфекционных болезней

г. Челябинск

Sergei V. Dubovikov — Assistant of the Department of Infectious Diseases

Chelyabinsk

dubovikov74@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-4280-283XМищенкоВ. А.MishchenkoV. O.

Мищенко Владимир Алексеевич — научный сотрудник лаборатории трансмиссивных вирусных инфекций и клещевого энцефалита

г. Екатеринбург

Vladimir A. Mishchenko — Research Associate of the Laboratory for VectorBorne Viral Infections and Tick-Borne Encephalitis

Yekaterinburg

mischenko_va@niivirom.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3123-8359ВялыхИ. В.VyalykhI. V.

Вялых Иван Владимирович — кандидат ветеринарных наук, ведущий научный сотрудник, заведующий лабораторией трансмиссивных вирусных инфекций и клещевого энцефалита

г. Екатеринбург

Ivan V. Vyalykh — Cand. Sci. (Vet.), Leading Researcher, Head of the Laboratory of Vector-Borne Viral Infections and Tick-Borne Encephalitis

Yekaterinburg

vyalykh_iv@niivirom.ruФГБОУ ВО «ЮжноУральский государственный медицинский университет» Минздрава России, кафедра инфекционных болезнейРоссияSouth Ural State Medical University of the Ministry of Health of the Russian Federation, Department of Infectious DiseasesRussian FederationГАУЗ «Городская клиническая больница №8»РоссияState Autonomous Healthcare Institution «City Clinical Hospital No. 8»Russian FederationФБУН «Федеральный научноисследовательский институт вирусных инфекций «Виром» РоспотребнадзораРоссияFederal Budgetary Institution of Science «Federal Scientific Research Institute of Viral Infections «Virome»» of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human WellbeingRussian Federation2026090920262548191Copyright © Конькова-Рейдман А.Б., Дубовиков С.В., Мищенко В.А., Вялых И.В., 20262026Конькова-Рейдман А.Б., Дубовиков С.В., Мищенко В.А., Вялых И.В.Konkova-Reidman A.B., Dubovikov S.V., Mishchenko V.O., Vyalykh I.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2494

Актуальность. Южный Урал – эндемичный регион по клещевому энцефалиту (КЭ), где исторически доминировал сибирский субтип вируса, представленный линией Заусаев. В 2025 г. впервые выделена балтийская линия, что меняет устоявшуюся эпидемиологическую парадигму. Цель. Изучить молекулярную эпидемиологию сибирского генотипа вируса клещевого энцефалита на территории Южного Урала, клинический полиморфизм заболевания и эффективность различных стратегий профилактики в условиях выявленного генетического разнообразия возбудителя. Материалы и методы. Проведено сплошное лонгитюдное исследование серии верифицированных случаев клещевого энцефалита (КЭ) среди пациентов, госпитализированных в инфекционное отделение Городской клинической больницы № 8 г. Челябинска с 2024 по 30.06.2026. Для генетической характеристики возбудителя выполнено секвенирование фрагмента гена белка Е вируса КЭ с последующим филогенетическим анализом. Результаты и обсуждение.  Доля очаговых форм КЭ составила 11,3 %, летальность – 5,0 %. Среди 4 умерших 3 получали постконтактный иммуноглобулин. У одного умершего обнаружена балтийская линия сибирского субтипа вируса КЭ. Среди вакцинированных не было очаговых форм инфекции и летальных исходов КЭ. Заключение. Выявлена экспансия балтийской линии в регионе. Экстренная серопрофилактика не предотвращает тяжелое течение и летальный исход при инфицировании высоковирулентными штаммами, тогда как вакцинопрофилактика обеспечивает надежную защиту.

Relevance. The Southern Urals is an endemic region for tick-borne encephalitis (TBE), where the Siberian subtype of the virus has historically been dominant, represented by the Zausaev lineage. The 2025 identification of the Baltic lineage marks a shift in the established epidemiological paradigm. Aim. To investigate the molecular epidemiology of the Siberian genotype of TBE virus in the Southern Urals, the clinical polymorphism of the disease, and the effectiveness of various prevention strategies in the context of the identified genetic diversity of the pathogen. Materials and Methods. A continuous longitudinal study was conducted on a series of verified TBE cases among patients hospitalized in the Infectious Diseases Department of City Clinical Hospital No. 8 in Chelyabinsk between 2024 and June 30, 2026. To genetically characterize the agent, sequencing of a fragment of the viral protein E gene was performed, followed by phylogenetic analysis. Results and Discussion. The proportion of focal forms was 11.3 %, and the case fatality rate was 5.0 %. Among the 4 deceased patients, 3 received post-exposure immunoglobulin. The Baltic lineage of the Siberian subtype was detected in one fatal case. In the vaccinated, there were no focal forms of tick-borne encephalitis or fatal outcomes. Conclusion. The study revealed an expansion of the Baltic lineage in the region. While emergency post-exposure prophylaxis with immunoglobulin did not prevent severe disease and fatal outcome upon infection with highly virulent strains, vaccination was found to provide reliable protection.

клещевой энцефалитсибирский субтипбалтийская линиялиния Заусаевмолекулярная эпидемиологияпостконтактная профилактикавакцинацияTick-borne encephalitisSiberian subtypeBaltic lineageZausaev lineagemolecular epidemiologypost-exposure prophylaxisРаздел по молекулярногенетическому анализу изолятов выполнен в рамках НИОКТР Рег. № 1260212171890The molecular genetic analysis of the isolates was performed within the framework of an R&D project, Reg. No. 1260212171890.ReferencesНикитин А.Я., Толмачёва М.И., Яцменко Е.В. и др. Эпидемиологическая ситуация по клещевому вирусному энцефалиту в Российской Федерации в условиях меняющегося климата (2016–2025 гг.) и прогноз заболеваемости на 2026 г. // Проблемы особо опасных инфекций. 2026. № 2. С. 6–17. DOI: 10.21055/0370-1069-2026-2-6-17.Nikitin A.Ya., Tolmacheva M.I., Yatsmenko E.V., et al. Epidemiological Situation on Tick-Borne Viral Encephalitis in the Russian Federation in the Context of a Changing Climate (2016–2025) and Incidence Forecast for 2026 // Problems of Particularly Dangerous Infections. 2026. № 2. P. 6–17. (In Russ.). DOI: 10.21055/0370-1069-2026-2-6-17.Злобин В.И., редактор. Клещевой энцефалит в XXI веке. М.: Наука, 2021. 471 с. ISBN 978-5-02-040852-4.Zlobin V.I., editor. Tick-Borne Encephalitis in the 21st Century. Moscow: Nauka, 2021. 471 p. (In Russ.). ISBN 978-5-02-040852-4.Ткачев С.Е., Бабкин И.В., Чичерина Г.С. и др. Генетическое разнообразие и географическое распространение сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита // Ticks and Tick-borne Diseases. 2020. Vol. 11, № 2. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2019.101327.Tkachev S.E., Babkin I.V., Chicherina G.S., et al. Genetic diversity and geographical distribution of the Siberian subtype of the tick-borne encephalitis virus // Ticks and Tickborne Diseases. 2020. Vol. 11, № 2. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2019.101327.Kovalev S.Yu., Chernykh D.N., Kokorev V.S., et al. Origin and distribution of tick-borne encephalitis virus strains of the Siberian subtype in the Middle Urals, the north-west of Russia and the Baltic countries // J. Gen. Virol. 2009. Vol. 90, № 12. P. 2884–2892. DOI: 10.1099/vir.0.012419-0.Kovalev S.Yu., Chernykh D.N., Kokorev V.S., et al. Origin and distribution of tick-borne encephalitis virus strains of the Siberian subtype in the Middle Urals, the north-west of Russia and the Baltic countries // J. Gen. Virol. 2009. Vol. 90, № 12. P. 2884–2892. DOI: 10.1099/vir.0.012419-0.Deviatkin A.A., Kholodilov I.S., Belova O.A., et al. Baltic Group Tick-Borne Encephalitis Virus Phylogeography: Systemic Inconsistency Pattern between Genetic and Geographic Distances // Microorganisms. 2020. Vol. 8, № 10. P. 1589. DOI: 10.3390/microorganisms8101589.Deviatkin A.A., Kholodilov I.S., Belova O.A., et al. Baltic Group Tick-Borne Encephalitis Virus Phylogeography: Systemic Inconsistency Pattern between Genetic and Geographic Distances // Microorganisms. 2020. Vol. 8, № 10. P. 1589. DOI: 10.3390/microorganisms8101589.Bondaryuk A.N., Adelshin R.V., Lopatovskaya K.V., et al. Phylogenetic Analysis of European Subtype Strains of Tick-Borne Encephalitis Virus Isolated in the Territory of Siberia (Russia) // Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2021. Vol. 36. P. 152–158. DOI: 10.3103/S0891416821030022.Bondaryuk A.N., Adelshin R.V., Lopatovskaya K.V., et al. Phylogenetic Analysis of European Subtype Strains of Tick-Borne Encephalitis Virus Isolated in the Territory of Siberia (Russia) // Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2021. Vol. 36. P. 152–158. DOI: 10.3103/S0891416821030022.Погодина В.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М. и др. Эволюция клещевого энцефалита и проблема эволюции возбудителя // Вопросы вирусологии. 2007. Т. 52, № 5. С. 16–21.Pogodina V.V., Karan L.S., Kolyasnikova N.M., et al. Evolution of tick-borne encephalitis and a problem of evolution of its causative agent // Problems of Virology. 2007. Vol. 52, № 5. P. 16–21. (In Russ.).Labuda M., Nuttall P.A. Tick-borne viruses // Parasitology. 2004. Vol. 129, № S1. P. S221–S245. DOI: 10.1017/S0031182004005220.Labuda M., Nuttall P.A. Tick-borne viruses // Parasitology. 2004. Vol. 129, № S1. P. S221–S245. DOI: 10.1017/S0031182004005220.Kovalenko A.I., Rubis L.V., Ekimova O.V., et al. Natural foci infections in Republic of Karelia // EpiNorth. 2003. № 4. P. 3–4.Kovalenko A.I., Rubis L.V., Ekimova O.V., et al. Natural foci infections in Republic of Karelia // EpiNorth. 2003. № 4. P. 3–4.Bugmyrin S.V., Bespyatova L.A., Korotkov Yu.S. Long-term dynamics of Ixodes persulcatus (Acari: Ixodidae) abundance in the north-west of its range (Karelia, Russia) // Exp. Appl. Acarol. 2019. Vol. 77. P. 229–240. DOI: 10.1007/s10493-019-00342-y.Bugmyrin S.V., Bespyatova L.A., Korotkov Yu.S. Long-term dynamics of Ixodes persulcatus (Acari: Ixodidae) abundance in the north-west of its range (Karelia, Russia) // Exp. Appl. Acarol. 2019. Vol. 77. P. 229–240. DOI: 10.1007/s10493-019-00342-y.Bugmyrin S.V., Bespyatova L.A., Korotkov Yu.S., et al. Distribution of Ixodes ricinus and I. persulcatus ticks in southern Karelia (Russia) // Ticks Tick Borne Dis. 2013. Vol. 4. P. 57–62. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2012.07.004.Bugmyrin S.V., Bespyatova L.A., Korotkov Yu.S., et al. Distribution of Ixodes ricinus and I. persulcatus ticks in southern Karelia (Russia) // Ticks Tick Borne Dis. 2013. Vol. 4. P. 57–62. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2012.07.004.Laaksonen M., Sajanti E., Sormunen J.J., et al. Crowdsourcing-based nationwide tick collection reveals the distribution of Ixodes ricinus and I. persulcatus and associated pathogens in Finland // Emerg. Microbes Infect. 2017. Vol. 6, № 1. P. 1–7. DOI: 10.1038/emi.2017.17.Laaksonen M., Sajanti E., Sormunen J.J., et al. Crowdsourcing-based nationwide tick collection reveals the distribution of Ixodes ricinus and I. persulcatus and associated pathogens in Finland // Emerg. Microbes Infect. 2017. Vol. 6, № 1. P. 1–7. DOI: 10.1038/emi.2017.17.Sormunen J.J., Andersson T., Aspi J., et al. Monitoring of ticks and tick-borne pathogens through a nationwide research station network in Finland // Ticks Tick Borne Dis. 2020. Vol. 11, № 5. P. 101449. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2020.101449.Sormunen J.J., Andersson T., Aspi J., et al. Monitoring of ticks and tick-borne pathogens through a nationwide research station network in Finland // Ticks Tick Borne Dis. 2020. Vol. 11, № 5. P. 101449. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2020.101449.Пеньевская Н.А., Рудаков Н.В. Оценка эффективности профилактики клещевых трансмиссивных инфекций: проблемы теории и практики. Омск: ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора; ИЦ «Омский научный вестник», 2020. 416 с. ISBN 978-5-91306-108-9.Penyevskaya N.A., Rudakov N.V. Evaluation of tick-borne infections prevention effectiveness: problems of theory and practice. Omsk: Omsk Research Institute of Natural Focal Infections; Omsk Scientific Bulletin Publishing Center, 2020. 416 p. (In Russ.). ISBN 978-5-91306-108-9.Морозова О.В., Исаева Е.И. Врожденный и адаптивный иммунитет при инфекции и иммунизации инактивированной вакциной против клещевого энцефалита // Молекулярная медицина. 2021. Т. 19, № 6. С. 43–48. DOI: 10.29296/24999490-2021-06-07.Morozova O.V., Isaeva E.I. Innate and adaptive immunity during infection and immunization with inactivated tick-borne encephalitis vaccine // Molecular Medicine. 2021. Vol. 19, № 6. P. 43–48. (In Russ.). DOI: 10.29296/24999490-2021-06-07.Клинические рекомендации «Клещевой вирусный энцефалит у взрослых» / Минздрав РФ. М., 2025. [Электронный ресурс]. URL: клинические рекомендации на MedElement.Clinical Recommendations «Tick-Borne Viral Encephalitis in Adults» / Ministry of Health of the Russian Federation. Moscow, 2025. (In Russ.). [Electronic resource]. URL: Clinical Recommendations on MedElement.Хаснатинов М.А. Роль генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита и других клещевых патогенов в обеспечении устойчивого существования их эпидемиологически значимых природных очагов в Восточной Сибири и Монголии: дис. … д-ра биол. наук: 03.02.02: защищ. 26.12.2019. Иркутск, 2019. 255 с.Khasnatinov M.A. The Role of Genetic Diversity of Tick-Borne Encephalitis Virus and Other Tick-Borne Pathogens in Ensuring the Sustainable Existence of Their Epidemiologically Significant Natural Foci in Eastern Siberia and Mongolia: Dissertation for the Degree of Doctor of Biological Sciences, specialty 03.02.02; defended 26.12.2019. Irkutsk, 2019. 255 p. (In Russ.).Вялых И.В., Мищенко В.А. Генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита в различных регионах Уральского федерального округа // Национальные приоритеты России. 2021. № 3(42). С. 130–133.Vyalykh I.V., Mishchenko V.A. Genetic Diversity of Tick-Borne Encephalitis Virus in Various Regions of the Ural Federal District // National Priorities of Russia. 2021. № 3(42). P. 130–133. (In Russ.).Конькова-Рейдман А.Б., Барсукова Д.Н., Дубовиков С.В., Рейдман П.А. Клещевой энцефалит: клинико-эпидемиологические, патогенетические и профилактические аспекты проблемы // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2025. Т. 14, № 2. С. 122–130. DOI: 10.33029/2305-3496-2025-14-2-122-130.Konkova-Reidman A.B., Barsukova D.N., Dubovikov S.V., Reidman P.A. Tick-Borne Encephalitis: Clinical and Epidemiological, Pathogenetic, and Preventive Aspects of the Problem // Infectious Diseases: News, Opinions, Training. 2025. Vol. 14, № 2. P. 122–130. (In Russ.). DOI: 10.33029/2305-3496-2025-14-2-122-130.Девяткин А.А., Бугмырин С.В., Вакуленко Ю.А., Лукашёв А.Н., Карганова Г.Г. Разнообразие и распространение вирусов клещевого энцефалита балтийской группы // Природа. 2021. № 6. С. 3–12. DOI: 10.7868/S0032874X21060016.Deviatkin A.A., Bugmyrin S.V., Vakulenko Y.A., Lukashev A.N., Karganova G.G. Diversity and Distribution of Baltic Group Tick-Borne Encephalitis Viruses // Priroda. 2021. № 6. P. 3–12. (In Russ.). DOI: 10.7868/S0032874X21060016.Конькова-Рейдман А.Б., Злобин В.И., Тер-Багдасарян Л.В. Особенности патоморфоза клещевого энцефалита на Южном Урале // Инфекционные болезни. 2014. Т. 12, № 3. С. 24–31.Konkova-Reidman A.B., Zlobin V.I., Ter-Bagdasaryan L.V. Features of Pathomorphosis of Tick-Borne Encephalitis in the Southern Urals // Infectious Diseases. 2014. Vol. 12, № 3. P. 24–31. (In Russ.).Леонова Г.Н. Влияние специфической профилактики на инфекционную активность вируса клещевого энцефалита (обзор собственных исследований) // Журнал инфектологии. 2022. Т. 14, № 1. С. 43–52. DOI: 10.22625/2072-6732-2022-14-1-43-52.Leonova G.N. Influence of specific prevention on the infectious activity of the tick-borne encephalitis virus (review of own research) // Journal Infectology. 2022. Vol. 14, № 1. P. 43–52. (In Russ.). DOI: 10.22625/2072-6732-2022-14-1-43-52.Афонина О.С., Терехина Л.Л., Бархалева О.А. и др. Экспериментальное изучение перекрестного иммунного ответа на антигены штаммов вируса клещевого энцефалита разных генотипов у мышей Balb/с, иммунизированных различными вариантами вакцины клещевого энцефалита // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2014. № 5(78).Afonina O.S., Terekhina L.L., Barkhaleva O.A., et al. Experimental Study of the Cross-Reactive Immune Response to Antigens of Tick-Borne Encephalitis Virus Strains of Different Genotypes in BALB/c Mice Immunized with Different Tick-Borne Encephalitis Vaccine Formulations // Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2014. № 5(78). (In Russ.).Ильченко Т.Э., Билалова Г.П., Ставицкая Н.Х. и др. Вакцина «ЭнцеВир» — современный препарат для профилактики клещевого энцефалита // Сибирский медицинский журнал. 2009. № 2-2.Ilchenko T.E., Bilalova G.P., Stavitskaya N.Kh., et al. EnceVir Vaccine: A Modern Preparation for the Prevention of Tick-Borne Encephalitis // Siberian Medical Journal. 2009. № 2-2. (In Russ.).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.