epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2017-16-3-39-49epidemiology-275Research ArticleОФИЦИАЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯOFFICIAL INFORMATIONСеротиповая характеристика пневмококков, выявленных у больных менингитом в ряде стран европейского и азиатского регионовSerotype Characterization of Streptococcus pneumoniae Identified in Meningitis Cases in Sevral Asian and European CountriesОганесянА. Н.OganesyanA. N.oganesyan.ayk@gmail.comВоропаеваЕ. А.VoropaevaE. A.anaerob.lab@mail.ruМельниковаА. А.Mel'nikovaA. A.noemail@neicon.ruУрбанЮ. Н.UrbanYu. N.yuliaurban1978@gmail.comЕгороваЕ. А.EgorovaE. A.yegorovaea@gmail.comАлёшкинВ. А.AleshkinV. A.noemail@neicon.ruФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» им. Г.Н. Габричевского», РоспотребнадзораРоссияFederal State Institution of Science «Gabrichevsky Moscow Research Institute of Epidemiology and Microbiology», of Federal Service of Surveillance on Consumer Rights Protection and Human WellbeingRussian FederationФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» им. Г.Н. Габричевского», РоспотребнадзораРоссияFederal State Institution of Science «Gabrichevsky Moscow Research Institute of Epidemiology and Microbiology», of Federal Service of Surveillance on Consumer, Rights Protection and Human WellbeingRussian FederationРоспотребнадзорРоссияFederal Service of Surveillance on Consumer, Rights Protection and Human WellbeingRussian Federation2017200620171633949Copyright © Оганесян А.Н., Воропаева Е.А., Мельникова А.А., Урбан Ю.Н., Егорова Е.А., Алёшкин В.А., 20172017Оганесян А.Н., Воропаева Е.А., Мельникова А.А., Урбан Ю.Н., Егорова Е.А., Алёшкин В.А.Oganesyan A.N., Voropaeva E.A., Mel'nikova A.A., Urban Y.N., Egorova E.A., Aleshkin V.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/275

Введение. В настоящее время эпидемиология пневмококкового менингита (ПМ) в странах СНГ, а также на Украине и в Грузии является недостаточно изученной. Данное исследование было осуществлено с целью обоснования целесообразности применяемой стратегии вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции в указанных странах. Была проведена оценка серотипового состава пневмококков, выявленных у больных пневмококковым менингитом в следующих регионах: Европейском (Украина, Беларусь), Закавказском (Азербайджан, Армения, Грузия) и Азиатском (Узбекистан, Кыргызстан, Казахстан). Настоящая работа осуществлялась в рамках «Программы по дозорному эпиднадзору за инвазивными бактериальными заболеваниями (ИБЗ)», осуществляемой Европейским региональным бюро ВОЗ. Методы. Проводился забор образцов спинномозговой жидкости (СМЖ) у пациентов с подозрением на менингит в дозорных стационарах, расположенных в исследуемых регионах в течение 2007 - 2016 годов. Идентификацию S. pneumoniae, а также определение серогрупп и серотипов в положительных образцах СМЖ выполняли методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПРЦРВ) и мультиплексной ПЦР (мПЦР), В общей сложности было проанализировано 3013 образцов СМЖ: 2764 (91,7%) из них было получено от пациентов в возрасте до 5 лет, 128 (4,2%) от детей в возрасте от 5 до 18 лет и 121 (4,1%) от взрослых. Результаты. В 6% (188) проанализированных образцов СМЖ были выявлены пневмококки. Применявшаяся схема реакций ПЦР дала возможность определить серогруппы и серотипы для 82% (n = 154) идентифицированных S. pneumoniae, в 16% случаев серотипы определить не удалось, для 2% образцов серотипирование не проводилось. Всего было идентифицировано 26 различных серотипов и серогрупп. Превалирующими оказались следующие: 6A/B (21%), 14 (15%), 19F (10%), 23F (7%), 18 (A/B/C) (4%), 9V/9A (3%) и 4 (3%). Также был определен ряд других серотипов и серогрупп, встречавших в 2% и менее случаев (6C/6D, 24(A/B/F), 19A, 5, 3,1,23A,20,2,13,31, 8, 7F/7A, 7C/7B/40, 22F/22A, 21, 15B/15C, 12F/12A/12B/44/46, 11A/11D). Заключение. Таким образом, доли так называемых «вакцинных» серотипов в исследованных пробах от больных ПМ, то есть покрытия пневмококковыми конъюгированными вакцинами выявленных серотипов, составили 67% для ПКВ 10 и 71% для ПКВ 13 во всех 3-х регионах, что указывает на целесообразность и перспективность введения вакцинации против пневмококковой инфекции с применением ПКВ10 и ПКВ13 в национальные программы иммунизации. Дальнейшее осуществление эпиднадзора за ИБЗ, мониторинга изменений серотипового состава штаммов S. pneumoniae, ответственных за развитие инвазивных форм пневмококковой инфекции, а также встречающихся у здоровых носителей, безусловно, является необходимым для проведения оценки эффективности вакцинации, ее популяционного эффекта, а также влияния на серотиповой пейзаж S. pneumoniae.

Background. The current epidemiology of pneumococcal meningitis in Ukraine, Georgia and countries of CIS is poorly studied. In order to ensure an effective vaccination strategy and post-vaccination surveillance, we examined the serotype distribution patterns of pneumococcal meningitis in the following regions: European (Ukraine, Belarus), Transcaucasian (Azerbaijan, Armenia, Georgia), and Asian (Uzbekistan, Kyrgyzstan, Kazakhstan). The study was performed within the program for Invasive Bacterial Diseases Sentinel Surveillance implemented in the region by WHO Regional Office for Europe. Methods. Cerebrospinal fluid (CSFs) samples were collected from patients with suspected meningitis at sentinel hospitals throughout all the regions within the period 2007 - 2016. Determination of S. pneumoniae and serogroups/serotypes in positive CSFs was performed using qPCR and mPCR. In total 3013 CSFs were tested: 2764 (91.7%) of them were collected from patients aged under 5 years, 128 (4.2%) from children aged 5 - 18 years and 121 (4.1%) from adults. Results. 6% (188) of CSFs analyzed were positive for S. pneumoniae, The PCR assay used could predict the S. pneumoniae serotypes/ serogroups for 82% (n = 154) of positive CSFs, 16% were not-typeable in our PCR scheme and for 2% serotyping was not performed. In total, 26 different serotypes/serogroups were identified. Serotypes 6A/B (21%), 14 (15%), 19F (10%), 23F (7%), 18 (A/B/C) (4%), 9V/9A (3%) and 4 (3%) were found to be the most prevalent, followed by others with a prevalence of 2% and less(6C/6D, 24(A/B/F), 19A, 5, 3,1,23A,20,2,13,31, 8, 7F/7A, 7C/7B/40, 22F/22A, 21, 15B/15C, 12F/12A/12B/44/46, 11A/11D). Conclusions. The proportion of vaccine serotypes in pneumococcal meningitis cases (vaccine coverage) amounts to 67% for PCV10 and 71% for PCV13 in all the regions, suggesting that the introduction of conjugate vaccines (PCV10 and 13) into National Immunization Programs is feasible. Post-vaccine introduction surveillance supported will be essential. Post-vaccine introduction surveillance and monitoring of changes in serotype S. pneumoniae distribution in cases with invasive pneumococcal disease and in healthy carriers is essential to assess the vaccination effectiveness and to provide a comprehensive picture of the vaccination impact on pneumococcal serotype distribution in the region.

Streptococcus pneumoniaeсеротипывакцинацияменингитВОЗПКВStreptococcus pneumoniaeserotypesvaccinationmeningitisWHO PCVReferencesLaboratory Methods for the Diagnosis of Meningitis caused by Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae: WHO manual, 2nd edition; WH0/IVB.11.09; 2011.Laboratory Methods for the Diagnosis of Meningitis caused by Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae: WHO manual, 2nd edition; WHO/IVB.11.09; 2011.Королева М.А. Эпидемиологический мониторинг за гнойными бактериальными менингитами в Российской Федерации: Автореф. дис.. канд. мед. наук. Москва; 2014: 24.Koroleva M.A. Epidemiological monitoring of purulent bacterial meningitis in Russian Federation. Doctorate of med. sci. diss. Moscow; 2014: 24 (in Russian).Briand C., Levy C., Baumie F., Joao L., B chet S., Carbonnelle E. et al. Outcomes of bacterial meningitis in children. Lancet. 2010; 10: 317 - 328.Briand C., Levy C., Baumie F., Joao L., Béchet S., Carbonnelle E., et al. Outcomes of bacterial meningitis in children. Lancet. 2010; 10: 317 – 328.stergaard C., Konradsen H.B., Samuelsson S. Clinical presentation and prognostic factors of Streptococcus pneumoniae meningitis according to the focus of infection. BMC Infect Dis. 2005; 5: 93.stergaard C., Konradsen H.B., Samuelsson S. Clinical presentation and prognostic factors of Streptococcus pneumoniae meningitis according to the focus of infection. BMC Infect. Dis. 2005; 5: 93.Brouwer M.C., Tunkel A.R., van de Beek D. Epidemiology, diagnosis, and antimicrobial treatment of acute bacterial meningitis. Clinical microbiology reviews. 2010; 23 (3): 467 - 492.Brouwer M.C., Tunkel A.R., van de Beek D. Epidemiology, diagnosis, and antimicrobial treatment of acute bacterial meningitis. Clinical microbiology reviews. 2010; 23 (3): 467 – 492.Сидоренко С.В., Лобзин Ю.В., Харит С.М., Королева И.С., Таточенко В.К. Пневмококковая инфекция и современные возможности ее профилактики -эпидемиологический обзор ситуации в мире и в России. Вопросы современной терапии. 2010. 9 (1): 54 - 61;Sidorenko S.V., Lobzin Yu.V., Kharit S.M., Koroleva I.S., Tatochenko V.K. Pneumococcal infection and modern possibilities of prevention – an epidemiological review of the situation in the world and Russia. Voprosy sovremennoy terapii. [Questions of modern pediatrics]. 2010; 9 (1): 54 – 61 (in Russian).Sheley J., Willman D., Downen J., Bergman S. Investigation of the selection and timing of pharmacological therapy in community-acquired bacterial meningitis. pharmacy and therapeutics. 2016; 41 (7): 437 - 441.Sheley J., Willman D., Downen J., Bergman S. Investigation of the Selection and Timing of Pharmacological Therapy in Community-Acquired Bacterial Meningitis. Pharmacy and Therapeutics. 2016; 41 (7): 437 – 441.Butler J. Pneumococcal disease. In: Tuomanen E, Mitchell T, Morrison D., Spratt B. eds. The Pneumococcus. (1st ed.) Washington, DC: American Society for Microbiology; 2004: 148 - 168.Butler J. Pneumococcal disease. In: Tuomanen E, Mitchell T, Morrison D., Spratt B. eds. The Pneumococcus. (1st ed.) Washington, DC: American Society for Microbiology; 2004: 148 – 168.Баранов А.А., Намазова-Баранова Л.С., Брико Н.И., Чучалин А.Г., Таточенко В.К., Харит С.Р, и др. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции. Федеральные клинические рекомендации. Москва. 2015: 24.Baranov A.A., Namazova-Baranova L.S., Briko N.I., Chuchalin A.G., Tatochenko V.K., Kharit S.R., et al. Vaccinal prevention of pneumococcal infection. Federal clinical guidelines. Moscow. 2015: 24 (in Russian).Козлов Р.С. Пневмококки: прошлое, настоящее и будущее. Смоленск. Смоленская государственная медицинская академия; 2005: 128.Kozlov R.S. Pneumococcus: past, present and future. Smolensk: Smolensk State Medical Academy; 2005: 128 (in Russian).Баранов А.А., Намазова Л.С., Таточенко В.К. Пневмококковая инфекция и связанные с ней заболевания - серьезная проблема современного здравоохранения. Педиатрическая фармакология. 2008; 5 (1): 28 - 33.Baranov A.A., Namazova L.S., Tatochenko V.K. Pneumococcal infection and related diseases - a major problem of modern health care. Pediatricheskaya farmakologiya. [Pediatric Pharmacology]. 2008; 5 (1): 28 – 33 (in Russian).Венгеров Ю.Я., Нагибина М.В., Михалинова Е.П., Раздобарина С.Е., Молотилова Т.Н., Пархоменко Ю.Г. и др. Пневмококковый менингит. Проблема высокой летальности. Лечащий врач. 2015; 5: 14 - 18.Vengerov Yu.Ya., M.V. Nagibina, E. P. Mikhalinova, S. E. Razdobarina, T. N. Molotilova, Yu. G. Parkhomenko, et al. Pneumococcal meningitis. The problem of high mortality. Lechashchiy vrach. [Therapist]. 2015; 5: 14 – 18 (in Russian).Backhaus E., Berg S., Andersson R., Ockborn G., Malmstr m P., Dahl M. et al. Epidemiology of invasive pneumococcal infections: manifestations, incidence and case fatality rate correlated to age, gender and risk factors. BMC Infectious Diseases. 2016; 16: 367.Backhaus E., Berg S., Andersson R., Ockborn G., Malmström P., Dahl M., et al. Epidemiology of invasive pneumococcal infections: manifestations, incidence and case fatality rate correlated to age, gender and risk factors. BMC Infectious Diseases. 2016; 16: 367.Song J.Y., Nahm M.H., Moseley M.A. Clinical implications of pneumococcal serotypes: invasive disease potential, clinical presentations, and antibiotic resistance. J. Korean Med. Sci. 2013; 28 (1): 4 - 15.Song J.Y., Nahm M.H., Moseley M.A. Clinical implications of pneumococcal serotypes: invasive disease potential, clinical presentations, and antibiotic resistance. J. Korean Med Sci. 2013; 28 (1): 4 – 15.Yildirim I., Kimberly M., Pelton S.I. Pneumococcal disease in the era of pneumococcal conjugate vaccine. Infect. Dis. Clin. North Am. 2015; 29 (4): 679 - 697.Yildirim I., Kimberly M., Pelton S.I. Pneumococcal disease in the era of pneumococcal conjugate vaccine. Infect. Dis. Clin. North Am. 2015; 29 (4): 679 – 697.Alari A., Chaussade H., De Cell s M.D., Le Fouler L., Varon E., Opatowski L. et al. Impact of pneumococcal conjugate vaccines on pneumococcal meningitis cases in France between 2001 and 2014: a time series analysis. BMC Medicine 2016; 14: 211.Alari A., Chaussade H., De Cellès M.D., Le Fouler L., Varon E., Opatowski L. et al. Impact of pneumococcal conjugate vaccines on pneumococcal meningitis cases in France between 2001 and 2014: a time series analysis. BMC Medicine 2016; 14: 211.И.С. Королева, Г.В. Белошицкий, М.А. Королева, А.А. Мельникова. Эпидемиологические аспекты пневмококкового менингита в Российской Федерации. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2016; 15 (5): 6 - 13.Koroleva I.S., Beloshitskiy G.V., Koroleva M.A., Mel’nikova A.A.. Epidemiological aspects of pneumococcal meningitis in the Russian Federation. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. [Epidemiology & Vaccinal Prevention]. 2016; 15 (5): 6 – 13 (in Russian).Королева И.С., Белошицкий Г.В., Миронов К.О. Серотиповая характеристика пневмококков, выделенных от больных пневмококковым менингитом. Вопросы современной педиатрии. 2012. 11 (4): 122 - 127.Koroleva I.S., Beloshitskiy G.V., Mironov K.O. Characteristics of pneumococcal serotypes isolated from patients with pneumococcal meningitis. Voprosy sovremennoy pediatrii. [Questions of modern pediatrics]. 2012. 11 (4): 122 – 127 (in Russian).del Amo E., Brotons Fi, Monsonis M., Trivi o M., I igo M., Selva L. High invasiveness of pneumococcal serotypes included in the new generation of conjugate vaccines. Clin. Microbiol. Infect. 2014; 20 (7): 684 - 689.del Amo E., Brotons P., Monsonis M., Triviño M., Iñigo M., Selva L. High invasiveness of pneumococcal serotypes included in the new generation of conjugate vaccines. Clin. Microbiol. Infect. 2014; 20 (7): 684 – 689.Pichon B., Ladhani S., Slack M., Segonds-Pichon A., Andrews N., Waight P, et al. Changes in molecular epidemiology of streptococcus pneumoniae causing meningitis following introduction of pneumococcal conjugate vaccination in England and Wales. Journal of clinical microbiology. 2013; 51 (3): 820 - 827.Pichon B., Ladhani S., Slack M., Segonds-Pichon A., Andrews N., Waight P. et al. Changes in molecular epidemiology of streptococcus pneumoniae causing meningitis following introduction of pneumococcal conjugate vaccination in England and Wales. Journal of clinical microbiology. 2013; 51 (3): 820 – 827.Tai S. Streptococcus pneumoniae serotype distribution and pneumococcal conjugate vaccine serotype coverage among pediatric patients in East and Southeast Asia, 2000 - 2014: a Pooled Data Analysis. Vaccines. 2016; 4 (1): 4.Tai S. Streptococcus pneumoniae serotype distribution and pneumococcal conjugate vaccine serotype coverage among pediatric patients in East and Southeast Asia, 2000 – 2014: a Pooled Data Analysis. Vaccines. 2016; 4 (1): 4.Ковтун О.П., Романенко В.В. Эффективность пневмококковых конъюгированных вакцин следующего поколения в разных регионах мира. Вопросы современной педиатрии. 2014; 13 (1): 18 - 25.Kovtun O.P., Romanenko V.V. The effectiveness of next generation pneumococcal conjugate vaccines in different parts of the world. Voprosy sovremennoy pediatrii. [Questions of modern pediatrics]. 2014; 13 (1): 18 – 25 (in Russian).Tatochenko V., Sidorenko S., Namazova-Baranova L., Mayanskiy N., Kulichenko T., Baranov A. et al. Streptococcus pneumoniae serotype distribution in children in the Russian Federation before the introduction of pneumococcal conjugate vaccines into the National Immunization Program. Expert Review of Vaccines. 2014; 13 (2): 257 - 264.Tatochenko V., Sidorenko S., Namazova-Baranova L., Mayanskiy N., Kulichenko T., Baranov A., et al. Streptococcus pneumoniae serotype distribution in children in the Russian Federation before the introduction of pneumococcal conjugate vaccines into the National Immunization Program. Expert Review of Vaccines. 2014; 13 (2): 257 – 264 (in Russian).Blumental S., Mo si J.C., Roalfe L., Zancolli M., Johnson M., Burbidge P. et al. Streptococcus pneumoniae serotype 1 burden in the African meningitis belt: exploration of functionality in specific antibodies. Clinical and vaccine immunology. 2015; 22 (4): 404 - 412.Blumental S., Moïsi JC., Roalfe L., Zancolli M., Johnson M., Burbidge P. et al. Streptococcus pneumoniae serotype 1 burden in the African meningitis belt: exploration of functionality in specific antibodies. Clinical and vaccine immunology. 2015; 22 (4): 404 – 412.Ceyhan M., Dagan R., Sayiner A., Chernyshova L., Dinleyici E., Hryniewicz W., et al. Surveillance of pneumococcal diseases in Central and Eastern Europe. Hum. Vaccin. Immunother. 2016; 12 (8): 2124 - 2134.Ceyhan M., Dagan R., Sayiner A., Chernyshova L., Dinleyici E.Ç., Hryniewicz W., et al. Surveillance of pneumococcal diseases in Central and Eastern Europe. Hum. Vaccin. Immunother. 2016; 12 (8): 2124 – 2134.Таджиева Н.У Совершенствование диагностики, лечения и профилактики пневмококковой инфекции у детей: Автореферат дис.. д-ра мед. наук. Ташкент; 2016.Tadzhieva N.U. Improving the diagnosis, treatment and prevention of pneumococcal disease in children. PhD of med. sci. diss. Tashkent; 2016 (in Russian).Давыдов А.В., Титов Л.П., Клюйко Н.Л., Гуринович В.В. Серотиповая характеристика штаммов Streptococcus Pneumoniae, выделенных у детей с острыми средними отитами и синуситами. Здравоохранение. Минск. 2016; 3: 12 - 21.Davydov A.V., Titov L.P., Klyuyko N.L., Gurinovich V.V. Characteristics of pneumococcal serotypes, isolated from children with acute otitis media and sinusitis. Zdravookhranenie. Minsk. 2016; 3: 12 – 21 (in Russian).Мирнов К.О., Платонов А.Е., Козлов Р.С. Идентификация и серотипирование российских штаммов Streptococcus pneumoniae с применением методик, основанных на ПЦР. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2011; 13 (4): 304 - 319.Mirnov K.O., Platonov A.E., Kozlov R.S. Identification and serotyping Russian strains of Streptococcus pneumoniae with the methods based on PCR. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. [Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy]. 2011; 13 (4): 304 – 319 (in Russian).Cohen C., Naidoo N., Meiring S., de Gouveia L., von Mollendorf C., Walaza S. Streptococcus pneumoniae serotypes and mortality in adults and adolescents in South Africa: Analysis of National Surveillance Data, 2003 - 2008. EID. 2016; 22 (2).Cohen C., Naidoo N., Meiring S., de Gouveia L., von Mollendorf C., Walaza S.. Streptococcus pneumoniae serotypes and mortality in adults and adolescents in South Africa: Analysis of National Surveillance Data, 2003 – 2008. EID. 2016; 22 (2).СП 1.2.036-95 «Порядок учета, хранения, передачи и транспортировки микроорганизмов I - IV групп патогенности».SR 1.2.036-95. The treatment, storage, transfer and transport of microorganisms I – IV pathogenicity groups (in Russian).Pimenta F.C., Roundtree A., Soysal A., Bakir M., du Plessis M., Wolte N. et al. Sequential triplex real-time pcr assay for detecting 21 pneumococcal capsular serotypes that account for a high global disease burden. J. Clin. Microbiol. 2013; 51 (2): 647 - 652.Pimenta F.C., Roundtree A., Soysal A., Bakir M., du Plessis M., Wolte N. et al. Sequential triplex real-time pcr assay for detecting 21 pneumococcal capsular serotypes that account for a high global disease burden. J. Clin. Microbiol. 2013; 51 (2): 647 – 652.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.