<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">epidemiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Эпидемиология и Вакцинопрофилактика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Epidemiology and Vaccinal Prevention</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2073-3046</issn><issn pub-type="epub">2619-0494</issn><publisher><publisher-name>«Numicom» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.31631/2073-3046-2015-14-2-6-9</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">epidemiology-28</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>МАТЕРИАЛЫ ОМСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Алгоритмы выявления риккетсий и лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки в России</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Algorithms of Rickettsiae’s Detection and Laboratory Diagnosis of Rickettsioses of Spotted Fever Group in Russia</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рудаков</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rudakov</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">rickettsia@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Самойленко</surname><given-names>И. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Samoylenko</surname><given-names>I. E.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кумпан</surname><given-names>Л. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kumpan</surname><given-names>L. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора; ГБОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия» Минздрава России<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Federal Budgetary Institution of Science «Omsk Research Institute of Natural Foci Infections» of Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Well-Being Surveillance<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru">ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">State Budgetary Educational Institution of Higher Professional Training «Omsk State Medical Academy»of Ministry of Healthcare of the Russian Federation<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2015</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>20</day><month>04</month><year>2015</year></pub-date><volume>14</volume><issue>2</issue><fpage>6</fpage><lpage>9</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Кумпан Л.В., 2015</copyright-statement><copyright-year>2015</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Кумпан Л.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Rudakov N.V., Samoylenko I.E., Kumpan L.V.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/28">https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/28</self-uri><abstract><p>Представлен анализ современных тенденций выявления риккетсий и лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки. В связи с резким сокращением номенклатуры выпускаемых препаратов и увеличением спектра выявленных на территории России видов риккетсий необходимы новые подходы к лабораторной верификации диагнозов. Для выявления антител к риккетсиям группы КПЛ могут быть рекомендованы РНИФ и ИФА с антигенами риккетсий соответствующих видов. Для выявления и идентификации риккетсий группы КПЛ наиболее приемлемы ПЦР-рестрикционный анализ и ПЦР-секвенирование, для изучения патогенных видов риккетсий оптимальны биологические методы исследования.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>An analysis of modern trends of Rickettsiae’s detection and laboratory diagnostics for spotted fever group rickettsioses is present. Due to the sharp decline in the range of manufactured products and increase the spectrum of rickettsial species identified in Russia, new approaches required to laboratory verification of diagnoses. IFA and ELISA with antigens of relevant species of Rickettsia can be recommended to detect antibodies to the SFG rickettsiae. PCR-restriction analysis and sequencing of PCR products most appropriate for the detection and identification of SFG Rickettsia, biological methods are necessary for studying of pathogenic species of Rickettsia.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>риккетсии и риккетсиозы</kwd><kwd>группа клещевой пятнистой лихорадки</kwd><kwd>лабораторная диагностика</kwd><kwd>rickettsiae and rickettsioses</kwd><kwd>laboratory diagnostics</kwd><kwd>spotted fever group</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шпынов С.Н., Рудаков Н.В., Гранитов В.М., Арсеньева И.В., Тарасевич И.В., Fournier P.-E. и др. Выявление альфа1-протеобактерий в иксодовых клещах и образцах от больных в России. Омский научный вестник. 2006; 3 (37): 32 - 37.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shpynov S.N., Rudakov N.V., Granitov V.M., Arsenyeva I.V., Tarasevich I.V., Fournier P.-E. et al. Identification of alpha 1-proteobacteriae in Ixodes ticks and samples from patients in Russia. Omsk Scientific Bulletin. 2006; 3 (37): 32 – 37 (in  Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mediannikov O.Yu., Sidel’nikov Yu., Ivanov L., Mokretsova E., Fournier P.-E., Tarasevich I. Acute tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis in Russian Far East. Emerg. Infect. Dis. 2004; 10 (5): 810 - 817.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mediannikov O.Yu., Sidelnikov Yu., Ivanov L., Mokretsova E., Fournier P.-E., Tarasevich I. Acute tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis in Russian Far East. Emerg. Infect. Dis. 2004; 10 (5): 810 – 817.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Гранитов В.М., Арсеньева И.В., Бесхлебова О.В., Дедков В.Г., Карань Л.С., Васильева О.А., Шпынов С.Н. Первый клинический случай клещевого риккетсиоза, вызванного Rickettsia heilongjiangensis, на территории Сибири. Инфекционные болезни. 2014; 12 (3): 91 - 94.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Granitov V.M., Arsenyeva I.V., Beskhlebova O.V., Dedkov V.G., Karan’ L.S., Vasilyeva O.A., Shpynov S.N. The first clinical case of tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis, in Siberia. Infectious diseases. 2014; 12 (3): 91 – 94 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пеньевская Н.А., Рудаков Н.В., Абрамова Н.В., Рудакова С.А., Коломенский А.П. Клинико-эпидемиологический анализ результатов выявления антител к различным видам риккетсий у больных с подозрением на клещевую нейроинфекцию в северных районах Омской области. Национальные приоритеты России. Специальный выпуск «Актуальные проблемы природной очаговости болезней»: Матер. Всерос. конф. с междунар. участием, посвященной 70-летию теории академика Е.Н. Павловского о природной очаговости болезней. Омск; 2009; 2: 192 - 197.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pen’evskaja N.A., Rudakov N.V., Abramova N.V., Rudakova S.A., Kolomenskij A.P. Clinico-epidemiological analysis of the detection of antibodies to various types of  rickettsiae in patients with suspected tick-borne neuroinfection in the northern  districts of the Omsk region. Russian national priorities. Special Issue on «Actual problems of the natural foci of diseases»: Mater. All-Rusian conf. with international participation marking the 70th anniversary of theory of natural foci of diseases by academician E.N. Pavlovsky. 2009; 2: 192 – 197 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Jia N., Jiang J.F., Huo Q.B., Jiang B.G., Cao W.C. Rickettsia sibirica subspecies BJ-90 as a cause of human disease. N. Engl. J. Med. 2014; 369 (12): 1176 - 1178.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Jia J.F., Huo Q.B., Jiang B.G., Cao W.C. Rickettsia sibirica subspecies BJ-90 as a cause of human disease. N. Engl. J. Med. 2014; 369 (12): 1176 – 1178.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Решетникова Т.А., Пеньевская Н.А., Абрамова Н.В., Кумпан Л.В. Новые данные о патогенности Rickettsia sibirica subsp. BJ-90. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 5: 10 - 13.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov N.V., Shpynov S.N., Resetnikova T.A., Pen’evskaya N.A., Abramova N.V., Kumpan L.V. New data on the pathogenicity of Rickettsia sibirica subsp. BJ-90. Epidemiology and infectious diseases. 2014; 5: 10 – 13 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Самойленко И.Е., Ястребов В.К., Оберт А.С., Курепина Н.Ю. Риккетсии и риккетсиозы группы клещевой пятнистой лихорадки в Сибири: Омск: Издательский центр «Омский научный вестник»; 2012.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov N.V., Shpynov S.N., Samoylenko I.E., Yastrebov V.K., Obert A.S., Kurepina N.Yu. Rickettsia and spotted fever group rickettsiosis in Siberia. Omsk: Publishing Center Omsk Scientific Bulletin; 2012 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shpynov S.N., Fournier R-E., Rudakov N.V., Samoylenko I.E., Reshetnikova T.A., Yastrebov V.K. et al. Molecular identification of a collection of spotted fever group rickettsiae obtained from patients and ticks from Russia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2006; 74 (3): 440 - 443.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shpynov S.N., Fournier P.-E., Rudakov N.V., Samoylenko I.E., Reshetnikova T.A., Yastrebov V.K. et al. Molecular identification of a collection of spotted fever group rickettsiae obtained from patients and ticks from Russia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2006; 74 (3): 440 – 443.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Еремеева М.Е., Шпынов С.Н., Токаревич Н.К. Современные подходы к лабораторной диагностике риккетсиозов. Инфекция и иммунитет. 2014; 4 (2): 113 - 34.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Eremeeva M.E., Shpynov S.N., Tokarevich N.K. Modern approaches to laboratory diagnosis of rickettsial diseases. Infection and Immunity. 2014; 4 (2): 113 – 134 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудакова С.А., Коломеец А.Н., Самойленко И.Е., Кузьминов А.М., Рудаков Н.В. Экспресс-индикация трансмиссивных патогенов как основа дифференцированного подхода к профилактике инфекций, передающихся иксодовыми клещами. Бюллетень СО РАМН. 2007; 4: 116 - 119.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakova S.A., Kolomeetz A.N., Samoylenko I.E., Kuz’minov A.M., Rudakov N.V. Express indication of transmissible pathogens as the basis of the differentiated approach to the prevention of infections transmitted by Ixodes ticks. Bjulleten’ SO RAMN. 2007; 4: 116 – 119 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Методические рекомендации. Эпидемиологический надзор за клещевым риккетсиозом. Иммунодиагностика заболевания и методы выявления возбудителя, утв. Минздравом СССР 22.10.91.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Methodical recommendations. Epidemiological surveillance of tick-borne rickettsiosis, immunodiagnosis of the disease and methods of detection of pathogen. Approved by the Ministry of Health of the USSR 10/22/91 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Методические указания МУ 3.1.1755-03 «Организация эпидемиологического надзора за клещевым риккетсиозом». Москва: Федеральный центр госсанэпиднадзора России; 2004.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Guidelines 3.1.1755-03. Organization of epidemiological surveillance of tick- borne rickettsiosis. Moscow: Russian Federal Centre for Sanitary Inspection, 2004 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Brouqui R, Bacellar F., Baranton G., Birtles R.J., Bjodorff A., Blanco J.R. et al. Guidelines for the diagnosis of tick-borne bacterial diseases in Europe. Clin. Microbiol. Infect. 2004; 10: 1108 - 1132.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Brouqui P., Bacellar F., Baranton G., Birtles R.J., Bjorsdorff A., Blanco J.R.  et al. Guidelines for the diagnosis of tick-borne bacterial diseases in Europe. Clin. Microbiol. Infect. 2004; 10: 1108 – 1132.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Абрамова Н.В., Рудаков Н.В., Пеньевская Н.А., Седых Н.Н., Кумпан Л.В., Самойленко И.Е. и др. Апробация иммуноферментного анализа для серологической диагностики инфекций, вызываемых риккетсиями группы клещевой пятнистой лихорадки. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2010; 1 (50): 17 - 22.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Abramova N.V., Rudakov N.V., Pen’evskaja N.A., Sedyh N.N., Kumpan L.V., Samoylenko I.E. et al. The testing of immunoassay for serological diagnosis of infections caused by spotted fever group rickettsiae. Epidemiology and vaccinal  prevention. 2010; 1(50): 17 – 22 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рудаков Н.В., Абрамова Н.В., Пеньевская Н.А., Самойленко И.Е., Шпынов С.Н., Решетникова Т.А. Способ лабораторной диагностики клещевого риккетсиоза с использованием иммуноферментного анализа для определения антител к антигену Rickettsia sibirica. Патент РФ № 2477860 от 20.03.2013 г.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudakov N.V., Abramova N.V., Pen’evskaja N.A., Samoylenko I.E., Shpynov S.N., Reshetnikova T.A. The method of laboratory diagnosis of tick-borne rickettsiosis using an enzyme immunoassay for the detection of antibodies to the antigen of  Rickettsia sibirica. Patent RF № 2477860; 2013 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шпынов С.Н., Рудаков Н.В., Тарасов В.А., Rarola R, Raoult D. Генотипирование риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки в клещах рода Dermacentor на территориях Омской и Новосибирской областей. Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения: Материалы 2-й Регион. научно-практ. конф., посвящ. 80-летию ОГМА. Омск; 2001: 290 - 294.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shpynov S.N., Rudakov N.V., Tarasov V.A., Parola P., Raoult D. Genotyping of spotted fever group’s rickettsiae in ticks of the genus Dermacentor in Omsk and Novosibirsk regions. Actual problems of sanitary-epidemiological welfare of the  population: Materials of 2 Region. conference dedicated to the 80th anniversary of OSMA. Omsk; 2001: 290 – 294 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Иголкина Я.П., Фоменко Н.В., Ливанова Н.Н., Астанин В.Б., Гостеева Л.А., Черноусова Н.Я., Рар В.А. Выявление различных видов риккетсий у иксодовых клещей, в крови людей и мелких млекопитающих на юге Западной Сибири и на Урале. Бюллетень сибирской медицины. 2006; 5 (1): 121 - 125.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Igolkina J.P., Fomenko N.V., Livanov N.N., Astanin V.B., Gosteeva L.A., Chernousova N.Ya., Rar V.A. Identify the different species of Rickettsia in ticks, in the blood of people and small mammals in the south of Western Siberia and the  Urals. Bulletin of Siberian medicine. 2006; 5 (1): 121 – 125 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пуховская Н.М., Рар В.А., Иванов Л.И., Высочина Н.П., Иголкина Я.П., Фоменко Н.В. и др. Выявление методом ПЦР возбудителей природно-очаговых инфекций, переносимых клещами, на полуострове Камчатка. Мед. паразитол. и паразит. болезни. 2010; 4: 36 - 39.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pukhovskaya N.M., Rar V.A., Ivanov L.I., Visochina N.P., Igolkina Ya.P., Fomenko N.V. et al. Identification of tick-borne pathogens of natural focal infections by PCR on the Kamchatka Peninsula. Med. parazitol. and the parasit. diseases. 2010; 4: 36 – 39 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Григорьева Я.Е., Карань Л.С., Рудакова С.А., Федорова М.В., Журенкова О.Б., Скрынник С.М. и др. Разработка набора реагентов для дифференциальной детекции патогенных риккетсий РРВ-ПЦР. Молекулярная диагностика. 2014; 1: 518, 519.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Grigorieva Ya.E., Karan’ L.S., Rudakova S.A., Fedorova M.V., Zhurenkova O.B., Skrynnik S.M. et al. Develop of set reagents for differential detection of pathogenic rickettsiae by RTD-PCR. Molecular diagnostics. 2014; 1: 518, 519 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Нефедова В.В., Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В., Горелова И.Б., Воробьева И.Н. Микроорганизмы порядка Rickettsiales у таежного клеща {Ixodes persulcatus Sch.) в Предуралье. Вестник РАМН. 2008; 7: 47 - 50.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nefedova V.V., Korenberg E.I., Kovalevsky Yu.V., Gorelova I.B., Vorobyova I.N. Microorganisms of order Rickettsiales in the taiga tick (Ixodes persulcatus Sch.) in the Urals. Bulletin of Russian Academy of Medical Sciences. 2008; 7: 47 – 50 (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
