epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2019-18-5-33-41epidemiology-833Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОсобенности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Сахалинской области на современном этапеAspects of Enterovirus Infection Molecular Epidemiology in Sakhalin Region (during years 2016–2018)https://orcid.org/0000-0003-4438-6913СапегаЕ. Ю.SapegaE. Yu.

Сапега Елена Юрьевна – кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник, руководитель  Дальневосточного  регионального научно-методического  центра по изучению энтеровирусных  инфекций.

Хабаровск, ул. Шевченко 2, 680610.

+7 (421)246-18-52, +7-909-804-33-14.

Elena  Yu. Sapega  – Cand. Sci. (Med), leading  research  associate, head  of the Far Eastern Regional Scientific Research Methodological  Center for Surveillance on Enterovirus Infection of Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology.

Shevchenko  str., 2, Khabarovsk, 680610.

+7 (421)246-18-52, +7-909-804-33-14.

evi.khv@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7238-3691БутаковаЛ. В.ButakovaL. V.

Бутакова Людмила Васильевна – научный сотрудник Дальневосточного регионального научно-методического  центра по изучению энтеровирусных инфекций.

Хабаровск, ул. Шевченко 2, 680610.

+7 (421)246-18-52, +7-914-203-67-31.

Liudmila  V. Butakova  – research associate of the Far Eastern Regional Scientific Research Methodological  Center  for Surveillance on Enterovirus Infection of Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology.

Shevchenko str., 2, Khabarovsk, 680610.

+7 (421)246-18-52, +7-914-203-67-31.

evi.khv@mail.ruТроценкоО. Е.TrotsenkoO. E.

Троценко Ольга Eвгеньевна – доктор медицинских наук, директор.

 Хабаровск, ул. Шевченко 2, 680610.

+7 (421) 232-52-28.

Olga E. Trotsenko – Dr. Sci. (Med.), of Khabarovsk Research Institute of Epidemiology  and  Microbiology.

Shevchenko  str., 2, Khabarovsk, 680610.

+7 (421)232-52-28.

trotsenko_oe@hniiem.ruФунтусоваО. А.FuntusovaO. A.

Фунтусова Ольга Алексеевна – руководитель.

693020, Южно-Сахалинск,  ул. Чехова, 30А.

+7 (424)249-52-00.

Olga A. Funtusova  – head  of the  Regional Rospotrebnadzor office in the Sakhalin region.

Chekhova str., 30A, Yuzhno-Sakhalinsk, 693020.

+7 (424)249-52-00.

info@sakhnadzor.ruКовтонюкГ. П.KovtoniukG. P.

Ковтонюк Галина  Петровна    – заместитель  руководителя  Управления Роспотребнадзора по Сахалинской области.

693020, Южно-Сахалинск, ул. Чехова 30А.

+7 (424)249-52-00.

Galina P. Kovtoniuk – head associate of the Regional Rospotrebnadzor office in the Sakhalin region.

Chekhova str., 30A, Yuzhno-Sakhalinsk, 693020.

+7 (424)249-52-00.

info@sakhnadzor.ruХабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии РоспотребнадзораРоссияKhabarovsk research institute of epidemiology and microbiologyRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Сахалинской областиРоссияRegional Rospotrebnadzor office in the Sakhalin regionRussian Federation2019031120191853341Copyright © Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Фунтусова О.А., Ковтонюк Г.П., 20192019Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Фунтусова О.А., Ковтонюк Г.П.Sapega E.Y., Butakova L.V., Trotsenko O.E., Funtusova O.A., Kovtoniuk G.P.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/833

Актуальность. Ежегодные подъемы заболеваемости  энтеровирусной инфекцией в Российской Федерации, в том числе в Сахалинской  области,  определяют  необходимость  постоянного  мониторинга с применением молекулярно-генетических методов и  филогенетического анализа.  Цель  исследования –  выявить  эпидемиологические  и молекулярно-генетические особенности энтеровирусной  инфекции  в Сахалинской  области  в 2016–2018  гг. Материалы и методы.  Анализ  заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Сахалинской  области  проведён на основании статистических форм отчетности. Типовой состав циркулирующих энтеровирусов  определён  с использованием  молекулярно-генетических методов  с последующим филогенетическим анализом. Результаты и обсуждение. С 2016 г. в Сахалинской области отмечено ухудшение эпидемической обстановки по энтеровирусной инфекции, проявившееся ростом заболеваемости  и регистрацией  эпидемических очагов в детских учреждениях.  Молекулярно-генетическими методами исследования  установлено,  что в циркуляции  преобладали Коксаки А-6 (2016 г.), Коксаки А-10 (2017 г.), Коксаки А-16 и ЕСНО-9 (2018 г.). Филогенетический  анализ показал принадлежность нуклеотидных последовательностей вирусов Коксаки А-16 к двум геновариантам геногруппы В (В1а и В1b), длительно  циркулирующим в России и Китайской Народной Республике.  Кроме того, вирус ЕСНО-9 в 2018 г. обусловил  не только спышечные очаги, но и спорадическую заболеваемость  в Сахалинской области. Выводы. Неблагополучная  эпидемическая ситуация в отношении энтеровирусной инфекции, сложившаяся в Сахалинской области в последние три года наблюдения, скорее всего, обусловлена появлением и дальнейшим широким распространением среди населения энтеровирусов Коксаки А 6, 10, 16 типов и эховируса 9 типа, имеющих российское или зарубежное происхождение.

Relevance.  Annual elevation of enterovirus infection (EVI) incidence in the Russian Federation  as well as in the Sakhalin region determine  a necessity  of continuous  surveillance  involving molecular-genetic  methods  and  phylogenetic  analysis.  Objective:  to highlight epidemiological and molecular-genetic  peculiarities of EVI in the Sakhalin region during 2016-2018 years. Materials and methods.  Analysis of enterovirus incidence were based on official statistical reporting forms. The structure of enterovirus types was evaluated by means of molecular methods and followed by phylogenetic analysis. Results and discussion. A deterioration of epidemic situation concerning EVI that began in 2016 in the Sakhalin region included elevation of incidence and registration of enterovirus outbreaks in childcare facilities triggered by introduction of new enterovirus types or those that were not circulating for a long time suchas Coxsackievirus A-6, Coxsackievirus A-10, Coxsackievirus A-16, ECHO-9. The phylogenetic analysis of Coxsackievirus A-16 detected in the Sakhalin region revealed their similarities with two genovariants of B genogroup (В1а и В1b) that were continuously circulating in Russia and China. In addition, enterovirus ECHO-9 that was also circulating in other constituent entities of the Russian Federation was isolated in Sakhalin region from patients suffering from viral meningitis including two children from two different infection cites of EVI group incidence. Conclusion. An unfavorable epidemic situation concerning EVI was revealed in the Sakhalin region during the last three years of surveillance. It was caused by introduction and further spread among population of Coxsackieviruses A-6, 10, 16 and ECHO-9 that presumably have Russian or foreign origin.

энтеровирусная инфекцияэнтеровирусэпидемиологический анализгрупповая заболеваемостьмолекулярно-генетические исследованияСахалинская областьEnterovirus infectionenterovirusepidemiological analysisoutbreakmolecular genetic studiesSakhalin regionReferencesЛукашев А.Н., Иванова О.Е., Худякова Л.В. Социально-экономическая значимость энтеровирусной инфекции и ее роль в структуре инфекционной патологии в мире // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2010. № 5. С. 113–120Lukashev AN, Ivanova OE, Khudyakova LV. Socio-economic significance of enterovirus infection and its role in the structure of infectious pathology in the world. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2010;5:113–120. (In Russ.).Морозова Н.С., Чернявская О.П., Михайлова Ю.М. и др. Энтеровирусная (неполио) инфекция в Российской Федерации в сезон 2013 года // Здоровье населения и среда обитания. 2014. № 10 (259). С. 34–37.Morozova NS, Chernyavskaya OP, Mikhailova YuM, et al. Enterovirus (non-polio) infection in the Russian Federation in the 2013 season. Population Health and Environment. 2014;10(259):34–37. (In Russ.).Троценко О.Е., Каравянская Т.Н., Отт В.А. и др. Многолетний анализ проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Хабаровском крае и основные факторы, определяющие ухудшение эпидемиологической ситуации в условиях наводнения // Проблемы особо опасных инфекций. 2014. № 1. С. 75–78.Trotsenko OE, Karavyanskaya TN, Ott VA, et al. Long-term analysis of the manifestations of the epidemic process of enterovirus infection in the Khabarovsk Territory and the main factors determining the deterioration of the epidemiological situation in flood conditions. Problems of especially dangerous infections. 2014;1:75–78. (In Russ.).Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2016 году» Доступно на: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=8345State report «On the state of the sanitary-epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2016» Available at: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=8345 Accessed: 25 May 2019. (In Russ.)Петрухина М.И., Старостина Н.В. Статистические методы в эпидемиологическом анализе. Москва; 2006.Petrukhina MI, Starostina NV. Statistical methods in epidemiological analysis. Moscow; 2006. (In Russ.).Nix W.A., Oberste M.S, Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // Journal of Clinical Microbiology. 2006. Vol. 44, N 8. P. 2698–2704.Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. Journal of Clinical Microbiology. 2006;44(8):2698–04. doi: 10.1128/JCM.00542-06/.Drummond A.J., Suchard M.A., Xie D., et al. Bayesian phylogenetics with BEAUTi and the BEAST 1.7. // Molecular Biology and Evolution. 2012. Vol. 29, N 8. P. 1969–1973.Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, et al. Bayesian phylogenetics with BEAUTi and the BEAST 1.7. Molecular Biology and Evolution. 2012;29(8):1969–73. doi: 10.1093/molbev/mss075.Shapiro B., Rambaut A., Drummond A.J. Choosing appropriate substitution models for the phylogenetic analysis of protein-coding sequences // Molecular Biology and Evolution. 2006. Vol. 23, N 1. P. 7–9.Shapiro B, Rambaut A, Drummond AJ. Choosing appropriate substitution models for the phylogenetic analysis of protein-coding sequences. Molecular Biology and Evolution. 2006;23(1):7–9. doi: 10.1093/molbev/.Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика групповой заболеваемости энтеровирусной инфекции, обусловленной вирусом Коксаки А6, среди населения Дальнего Востока Российской Федерации в 2016–2017 гг. // Тихоокеанский медицинский журнал. 2018. № 3. C. 92–97.Butakova LV, Sapega EYu, Trotsenko OE, et al. Molecular and epidemiological features of group incidence of enterovirus infection caused by the Coxsackie A6 virus among the population of the Russian Far East in 2016–2017. Pacific Medical Journal. 2018;3:92–96. doi: 10.17238/PmJ1609-1175.2018.3.92-96. (In Russ.).Голицына Л.Н., Зверев В.В., Парфенова О.В. и др. Эпидемические варианты неполиомиелитных энтеровирусов в России // Медицинский альманах. 2015. Т. 40, № 5. С. 136–140.Golitsyna LN, Zverev VV, Parfenova OV, et al. Epidemic variants of non-poliomyelitic enteroviruses in Russia. Medicinskij alʹmanah. 2015;40(5):136–40. (In Russ.).Hassel C., Mirand A., Farkas A., et al. Phylogeography of Coxsackievirus A16 Reveals Global Transmission Pathways and Recent Emergence and Spread of a Recombinant Genogroup // Journal of virology. 2017. Vol. 91, N 18. P. e00630–17.Hassel C, Mirand A, Farkas A, et al. Phylogeography of Coxsackievirus A16 Reveals Global Transmission Pathways and Recent Emergence and Spread of a Recombinant Genogroup. Journal of virology. 2017;91(18):e00630–17. doi: 10.1128/JVI.00630-17.Ji H., Fan H., Lu P.X., et al. Surveillance for severe hand, foot, and mouth disease from 2009 to 2015 in Jiangsu province: epidemiology, etiology, and disease burden // BMC Infectious Diseases. 2019. Vol. 19, N 1. P. 79.Ji H, Fan H, Lu PX, et al. Surveillance for severe hand, foot, and mouth disease from 2009 to 2015 in Jiangsu province: epidemiology, etiology, and disease burden. BMC Infectious Diseases. 2019;19(1):79. doi: 10.1186/s12879-018-3659-7.Голицына Л.Н., Фомина С.Г., Новикова Н.А. и др. Молекулярно-генетические варианты вируса ECHO 9, идентифицированные у больных серозным менингитом в России в 2007–2009 гг. // Вопросы вирусологии. 2011. Т. 56, № 6. С. 37–42.Golitsyna LN, Fomina SG, Novikova NA, et al. Molecular genetic echovirus 9 variants identified in patients with aseptic meningitis in Russia in 2007–2009. Voprosy virusologii. 2011;56(6):37–42. (In Russ.).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.