epidemiologyЭпидемиология и ВакцинопрофилактикаEpidemiology and Vaccinal Prevention2073-30462619-0494«Numicom» LLC10.31631/2073-3046-2020-19-1-14-23epidemiology-921Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESЭпидемиологический надзор за хроническими инфекциями легких, вызванными бактериями Burkholderia cepacia complex, бактериями рода Achromobacter, Pseudomonas аeruginosa и метициллинрезистентным Staphylococcus aureus, у больных муковисцидозомDirections of Epidemiological Surveillance of Chronic Lung Infections Caused by Burkholderia cepacia Complex, Achromobacter spp., Pseudomonas aeruginosa and Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in Patients with Cystic Fibrosishttps://orcid.org/0000-0002-9053-2515АветисянЛ. Р.AvetisyanL. R.

Лусине Ремуальдовна Аветисян - кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098 Москва, ул. Гамалеи 18,+7(903)1231611

Lusine R. Avetisyan - Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher at Laboratory of Molecular Epidemiology of Nosocomial Infections.

18, Gamalei st., Moscow, 123098, +7-903-1231611

lusavr@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2951-1755ШагинянИ. А.ShaginyanI. A.

Игорь Андроникович Шагинян - доктор медицинских наук, заведующий лабораторией молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098 Москва, ул. Гамалеи 18, +7(499)1936117

Igor A. Shaginyan - Dr. Sci. (Med.), head of Laboratory of Molecular Epidemiology of Nosocomial Infections.

Ga-maleya st. 18, Moscow, 123098,+7(499)193-61-17

shaginyan@gamaleya.orghttps://orcid.org/0000-0002-2349-8556ЧернухаМ. Ю.ChernukhaM. Yu.

Марина Юрьевна Чернуха - доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

Marina Yu. Chernukha - Dr. Sci. (Med.), leading researcher at Laboratory of Molecular Epidemiology of Nosocomial Infections.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098. +7 (499)193-55-94

chernukha@gamaleya.orgБурмистровЕ. М.BurmistrovE. M.

Егор Михайлович Бурмистров - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098 Москва, ул. Гамалеи 18, +7(499)1935594

Egor M. Burmistrov - junior researcher of Laboratory of Molecular Epidemiology.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098,+7(499)193-55-94

chetusha2006@gmail.comМедведеваО. С.MedvedevaO. S.

Ольга Сергеевна Медведева - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

123098 Москва, ул. Гамалеи 18, +7(499)1935594

Olga S. Medvedeva - junior researcher at Laboratory of Molecular Epidemiology.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098,+7(499)193-55-94

olgamedw@rambler.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3561-1499РусаковаЕ. В.RusakovaE. V.

Екатерина Владимировна Русакова - доктор медицинских наук, профессор, ведущий научный сотрудник научно-организационного отдела.

123098 Москва ул. Гамалеи 18. +7 (903) 2519610

Ekaterina V. Rusakova - Dr. Sci. (Med.), professor, leading researcher of Scientific and Department of National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician NF Gamaleya.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098,+7(903)2519610

rusakovaev5@yandex.ruСияноваЕ. А.SiyanovaE. A.

Екатерина Алексеевна Сиянова - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии госпитальных инфекций.

Ekaterina A. Siyanova - junior researcher at Laboratory of Molecular Epidemiology of Nosocomial Infections.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098,+7(499)1935594

hal-katy@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6395-0407КондратьеваЕ. И.KondratevaЕ. I.

Елена Ивановна Кондратьева - доктор медицинских наук, профессор, руководитель научно-консультативного отдела муковисцидоза.

115478 Москва, Москворечье, стр. 1, +7(495) 111-03-03

Elena I. Kondrateva - Dr. Sci. (Med.), professor, head of Scientific Department of Cystic Fibrosis of MGSC.

115478 Moscow, 1 Moskvorechie, +7(499)1370197

elenafpk@mail.ruЧучалинА. ГChuchlinA. G.

Александр Григорьевич Чучалин - доктор медицинских наук, академик РАН, заведующий кафедрой госпитальной терапии РНИМУ им. Н. И. Пирогова.

117997 Москва, ул. Островитянова, д. 1. +7 (495) 434-36-90

Alexandr G. Chuchalin - Dr. Sci. (Med.), Academic of RAS, head of department of Hospital Therapy of Pirogov RNRMU.

Ostrovitianov str. 1, Moscow 117997, +7 (495) 43436-90

rsmu@rsmu.ruhttps://orcid.org/0000-0002-6182-3866ГинцбургА. Л.GinzburgA. L.

Александр Леонидович Гинцбург- доктор биологических наук, академик РАН, директор НИЦЭМ им. почетного академика Н. Ф. Гамалеи.

 123098 Москва ул. Гамалеи 18, +7 (499) 1933001

Alexandr L.Ginzburg - Dr. Sci. (Biol.), Academic of RAS, head NRCEM named after the honorary academician N.F. Gamaleya.

Gamaleya st. 18, Moscow, 123098, +7 (499) 1933001

gintsburg@gamaleya.orgФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н. Ф. Гамалеи» Минздрава РоссииРоссияNational Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the honorary academician NF GamaleyaRussian FederationФГБНУ Медико-генетический научный центр, РАНРоссияResearch Centre of Medical GeneticsRussian FederationФГБОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова Минздрава РоссииРоссияPirogov Russian National Research Medical UniversityRussian Federation2020130320201911423Copyright © Аветисян Л.Р., Шагинян И.А., Чернуха М.Ю., Бурмистров Е.М., Медведева О.С., Русакова Е.В., Сиянова Е.А., Кондратьева Е.И., Чучалин А.Г., Гинцбург А.Л., 20202020Аветисян Л.Р., Шагинян И.А., Чернуха М.Ю., Бурмистров Е.М., Медведева О.С., Русакова Е.В., Сиянова Е.А., Кондратьева Е.И., Чучалин А.Г., Гинцбург А.Л.Avetisyan L.R., Shaginyan I.A., Chernukha M.Y., Burmistrov E.M., Medvedeva O.S., Rusakova E.V., Siyanova E.A., Kondrateva Е.I., Chuchlin A.G., Ginzburg A.L.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/921Актуальность

Актуальность. Отсутствие системы эпидемиологического надзора за хронической инфекцией легких (ХИЛ) у больных муковисцидозом (МВ) сделало бесконтрольным распространение возбудителей ХИЛ среди больных МВ в стационарах, о чем свидетельствовали многочисленные случаи инфицирования больных МВ, лечившихся в различных клиниках России.

Цель исследования - определить направления эпидемиологического надзора (ЭН) за ХИЛ у больных муковисцидозом и профилактических мероприятий, необходимых для противодействия перекрестному инфицированию больных МВ и распространению доминирующих возбудителей хронической инфекции легких в стационаре.

Материалы и методы

Материалы и методы. В статье проанализированы данные, полученные нами в результате исследований эпидемиологических и микробиологических особенностей ХИЛ у больных муковисцидозом. Использовали эпидемиологические, бактериологические и молекулярно-генетические (ПЦР, мультилокусное секвенирование, секвенирование полного генома) методы исследования.

Результаты и обсуждение

Результаты и обсуждение. Основываясь на результатах исследований эпидемиологических и микробиологических особенностей инфекций, вызванных вышеуказанными возбудителями, были определены направления ЭН и профилактических мероприятий при МВ. Обоснованы задачи информационно-аналитического блока, включающего мониторинг заболеваемости и микробиологический мониторинг. Установлено, что в рамках микробиологического мониторинга необходимо проводить бактериологическое исследование биоматериала из дыхательных путей больных МВ не реже чем 1 раз в квартал, а также при каждом амбулаторном посещении и госпитализации. Показана необходимость: исследования фенотипических свойств возбудителей, способствующих длительной персистенции в организме больного МВ; определения и мониторинга антибиотикочувствительности микроорганизмов, выделенных от больного в динамике; исследования гипермутабельности. Одной из основных задач мониторинга является молекулярно-генетический анализ возбудителей методом ПЦР с целью внутривидовой идентификации, типирования возбудителей и выявления эпидемических маркеров и клонов (в том числе и международных), идентификации генов детерминант антибиотикорезистентности.

Выводы

Выводы. Внедрение ЭН за хронической инфекцией легких позволит улучшить качество этиологической диагностики, своевременно выявлять источники инфекций и предупреждать распространение возбудителей ХИЛ среди больных МВ как в стационарах, так и во вне госпитальных условий, а также оптимизировать тактику антимикробной терапии ХИЛ. Основными направлениями предупреждения распространения возбудителей ХИЛ должны быть разделение потоков больных с разными инфекциями при амбулаторном обследовании и госпитализации.

Relevance

Relevance. The absence of a system of epidemiological surveillance of chronic lung infection (CLI) in patients with cystic fibrosis (CF) led to the spread of Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia complex and Achromobacter spp. among patients with CF during hospitalizations, that is proved by numerous cases of infection in patients with CF treated in various Russian clinics.

Aims

Aims. Determine the directions of epidemiological surveillance (ES) for CLI in patients with CF and preventive measures necessary to counteract the cross-infections among patients with CF and the spread of the dominant pathogens of CLI in the hospital.

Materials and methods

Materials and methods. A complex of epidemiological, microbiological and molecular genetic methods was used.

Results and discussion

Results and discussion. Based on the results of studies of the epidemiological and microbiological features of infections caused by the above-mentioned pathogens, the directions of ES and preventive measures for CF were determined. The tasks of the information-analytical unit, including the monitoring of morbidity and microbiological monitoring, are substantiated. It has been established that in the framework of microbiological monitoring, it is necessary to conduct bacteriological examination of biomaterial from the respiratory tract of patients with CF not less than 1 time per quarter, as well as at each outpatient visit and at hospitalization. The necessity of studying the phenotypic properties of pathogens contributing to long-term persistence in the patient's body of the CF, the definition and monitoring of the antibiotic sensitivity of microorganisms isolated from the patient over time, and the study of hypermutability was shown. One of the main tasks of monitoring is molecular genetic analysis of pathogens by PCR for the purpose of intraspecies identification, typing of pathogens and detection of epidemic markers and clones (including international ones), identification of genetic determinants of antibiotic resistance.

Conclusion

Conclusion. The introduction of ES for chronic lung infection will improve the quality of etiological diagnosis, will contribute early identification of the sources of infections and prevent the spread of CLI pathogens among patients with CF in hospitals and in non-hospital conditions, as well as optimize the tactics of CLI antimicrobial therapy. The main directions of preventing the spread of CLI pathogens should be the separation of patients with various infections during outpatient examination and isolation during hospitalization.

муковисцидозхроническая инфекция легкихэпидемиологический надзормикробиологический мониторингпрофилактические мероприятияcystic fibrosischronic lung infectionepidemiological surveillancemicrobiological monitoringpreventive measures No conflict of interest to declareReferencesЧернуха М. Ю., Шагинян И. А. Микробиология хронической инфекции легких у больных муковисцидозом. // В книге «Муковисцидоз». МЕДПРАКТИКА - М. Москва. 2014; Глава 4.2. с. 116-148.Chernukha M Yu, Shaginyan IA. M icrobiology of chronic lung infection in patients with cystic fibrosis. In book Cystic Fibrosis (Mucoviscidosis). MEDPRACTIKA-M, 2014; Chapter 4.2:116-48 (In Russ.).Аветисян Л. Р., Чернуха М. Ю., Шагинян И. А. и др. Антибиотикочувствительность Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa и бактерий Burkholderia cepacia complex, персистирующих в легких больных муковисцидозом. //Журнал эпидемиологии, микробиологии и иммунологии. 2015, № 6, C. 3-10.Avetisyan LR, Chernukha MYu, Shaginyan IA et al. Antibiotics sensitivity of Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa and Burkholderia cepacia complex, persisting in lungs of patients with in cystic fibrosis. Journal of microbiology epidemiology and immunobiology. 2015; 6:3-10 (In Russ.).Покровский В. И., Пак С. Г., Брико Н. И. и др. Инфекционные болезни и эпидемиология. // Учебник, 2-е изд. - М.: ГЭОТАР-Медиа. 2007,816 с.Pokrovsky VI, Pak SG, Briko Ni et al. Infectious Diseases and Epidemiology: A Textbook for High Schools., V. 2. Moscow: GEOtAr Media. 2007:816 (In Russ.).Шагинян И. А., Чернуха М. Ю., Аветисян Л. Р. и др. Эпидемиологические особенности хронической инфекции легких у больных муковисцидозом // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2017; 6 (97): 5-13.Shaginyan IA, Chernukha MY, Avetisyan LR et al. Epidemiological Features of Chronic Lung Infection in Patients with Cystic Fibrosis. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2017;16 (6): 5-13 (In Russ.).Чернуха М. Ю., Аветисян Л. Р., Шагинян И. А. и др. Фенотипические и генотипические особенности штаммов бактерий Burkholderia cepacia complex, выделенных от больных муковисцидозом. // Педиатрия. 2014; 93 (4): 24 -31.Chernukha MY, Avetisyan LR, Shaginyan IA et al. Phenotypic and genotypic characteristics of strains of the bacterium Burkholderia cepacia complex isolated from cystic fibrosis patients. Pediatrija. 2014; 93 (4): 24-31 (In Russ.).Красовский С. А., Амелина Е. Л., Кондратьева Е. И. и др. Респираторная инфекция нижних дыхательных путей у больных муковисцидозом в Российской Федерации по данным Национального регистра (2014)//Пульмонология. 2016, T. 28, № 4, C. 421-435.Krasovskiy SA, Amelina El, Kondrat'eva EI et al. Lower respiratory infection in patients with cystic fibrosis in Russian Federation according to the National Register, 2014. Russian Pulmonology. 2016; 26 (4): 421-435 (In Russ.).Кондратьева Е. И., Красовский С. А, Воронкова А. Ю. и др., ред. Регистр больных муковисцидозом в Российской Федерации. М.: ИД «МЕДПРАКТИКА-М»; 2016.Kondratieva EI, Krasovskiy SA, Voronkova AYu et al. The Russian Federation Cystic Fibrosis Patient Registry for 2017, ed. Moscow: «MEDPRACTICA-M». 2016:72 (In Russ.).Bittar F, Richet H, Dubus JC et al. Molecular detection of multiple emerging pathogens in sputa from cystic fibrosis patients. // PLoS ONE. 2008, Vol. 3, N. 8, P. e2908. doi: 10.1371/journal.pone.0002908.Bittar F, Richet H, Dubus JC et al. Molecular detection of multiple emerging pathogens in sputa from cystic fibrosis patients. PLoS ONE. 2008; 3 (8): e2908. doi: 10.1371/journal.pone.0002908.Kahl B, Herrmann M, Everding AS et al. Persistent infection with small colony variant strains of Staphylococcus aureus in patients with cystic fibrosis. // J Infect Dis. 1998, Vol. 177, P 1023-1029. DOI: 10.1086/515238.Kahl B, Herrmann M, Everding AS et al. Persistent infection with small colony variant strains of Staphylococcus aureus in patients with cystic fibrosis. J Infect Dis. 1998; 177: 1023-1029. DOI: 10.1086/515238.Miller MB, Gilligan PH. Laboratory aspects of management of chronic pulmonary infections in patients with cystic fibrosis. //J Clin Microbiol. 2003, Vol. 41, P. 4009-4015.Miller MB, Gilligan PH. Laboratory aspects of management of chronic pulmonary infections in patients with cystic fibrosis. J Clin Microbiol. 2003, Vol.41, P.4009-4015. DOI: 10.1128/jcm.41.9.4009-4015.2003.Kidd TJ, Ramsay KA, Hu H et al. Low rates of Pseudomonas aeruginosa misidentification in isolates from cystic fibrosis patients.//J Clin Microbiol. 2009, Vol. 47, P. 1503-1509. DOI: 10.1128/JCM.00014-09.Kidd TJ, Ramsay KA, Hu H et al. Low rates of Pseudomonas aeruginosa misidentification in isolates from cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 2009; 47: 1503-1509. DOI: 10.1128/JCM.00014-09.Чернуха М. Ю., Аветисян Л. Р., Шагинян И. А. и др. Алгоритм микробиологической диагностики хроническойинфекции легких у больных муковисцидозом. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014; 16 (4): 312-324.Chernukha MYu, Avetisyan LR, Shaginyan IA et al. Microbiological Diagnosis Algorithm for Chronic Lung Infection in Patients with Cystic Fibrosis. Journal of clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2014; 16 (4): 312-324. (in Russ).Humphreys H, Peckham D, Patel P et al. Airborne dissemination of Burkholderia (Pseudomonas) cepacia from adult patients with cystic fibrosis. Thorax. 1994, Vol.49, P.1157. doi: 10.1136/thx.49.11.1157.Humphreys H, Peckham D, Patel P et al. Airborne dissemination of Burkholderia (Pseudomonas) cepacia from adult patients with cystic fibrosis. Thorax. 1994;.49:1157. doi: 10.1136/thx.49.11.1157.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.