<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">epidemiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Эпидемиология и Вакцинопрофилактика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Epidemiology and Vaccinal Prevention</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2073-3046</issn><issn pub-type="epub">2619-0494</issn><publisher><publisher-name>«Numicom» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.31631/2073-3046-2020-19-1-24-34</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">epidemiology-922</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Вирус гонконгского гриппа: штрихи к портрету 50 лет спустя и будущая пандемия гриппа</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>The Hong Kong Influenza Virus: Treats to the Portrait after 50 Years and the Future Influenza Pandemic</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Харченко</surname><given-names>Е. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kharchenko</surname><given-names>E. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Харченко Евгений Петрович - доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник.</p><p>194223, Санкт-Петербург, пр. Тореза, 44. +7(812) 552-70-31</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Eugene P. Kharchenko - leader researcher.</p><p>St. Petersburg, +7 904 338-22-80</p></bio><email xlink:type="simple">neuro.children@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУН Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И. М. Сеченова, РАН</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Sechenov Institute of Evolutionary Physiology and Biochemistry</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>13</day><month>03</month><year>2020</year></pub-date><volume>19</volume><issue>1</issue><fpage>24</fpage><lpage>34</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Харченко Е.П., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Харченко Е.П.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Kharchenko E.P.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/922">https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/922</self-uri><abstract><sec><title>Актуальность</title><p>Актуальность. Вирусы подтипа H3N2 отличаются от других типов вирусов гриппа более высокой изменчивостью и патогенностью, часто превалируя в эпидсезонах и вызывая высокую смертность, превышающую ее показатели даже в период пандемий.</p></sec><sec><title>Цель</title><p>Цель. Выявить особенности некоторых молекулярных характеристик H3N2, которые потенциально могли бы обусловливать высокую изменчивость H3N2 и его доминирование над другими подтипами в эпидсезонах, и обсудить возможную природу будущей пандемии гриппа.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Для компьютерного анализа были использованы доступные в Интернете базы данных первичных структур гемагглютининов (НА) и нуклеопротеинов.у штаммов H3N2, H1N1, В\Yamagata(B\yam) и В\Victoria (B\vic), выделенных у человека в эпидсезон гриппа 2009-2019 гг. На основе первичных структур генов гемагглютининов и нуклеопротеинов определяли трансляционный код каждого гемагглютини-на и нуклеопротеина и существующие в них запреты. Для прослеживания траектории эволюции подтипа H3N2 в последнем десятилетии сравнивали доминантные последовательности смежных эпидсезонов, выявляя произошедшие в них замены. Результаты. Выявлено, что H3, по сравнению с Н1 и НА у B\yam и B\vic, обладает большим содержанием цистеина, у птиц продолжает еще циркулировать и близкородственный вирусу гонконгского гриппа штамм. Трансляционный код Н3 гена содержит наименьшее количество запретов. За последнее десятилетие доминантная последовательность Н3 эпидсезонов эволюционировала быстрее, чем доминантная последовательность Н1. Нуклеопротеин у вирусов подтипа H3N2 отличался более высоким содержанием лизина и меньшим содержанием аргинина.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Из проведенного сравнения H3N2, H1N1, B\yam и B\vic, можно заключить, что природа менее всего ограничила H3N2 в возможностях изменяться и соответственно лучше адаптироваться изменениям окружающей среды. Вероятно, что последующая пандемия гриппа будет порождена подтипом H1N1, а не подтипом H3N2 , и будет также умеренной по количеству инфицированных людей, как и пандемия 2009 г.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Relevance</title><p>Relevance. Of the different subtypes, H3N2 influenza virus subtype has the highest variability and pathogenicity, often dominates in epidemiological seasons and induces high mortality exceeding its rate in pandemic. Aim is to identify some features of H3N2 molecular characteristics which could determine its high variability and domination over other subtypes in epidemiological seasons and discuss possible nature of the future influenza pandemic.</p></sec><sec><title>Materials and method</title><p>Materials and method. For the computer analysis, the database of the hemagglutinin (HA) and nucleoprotein primary structures of the H3N2, H1N1, В\Yamagata and В\Victoria strains isolated in the influenza epidemiological seasons 2009-2019 were used from the Internet. From the primary structure of their genes it were defined their translational codes. To trace the H3N2 subtype evolution in the last decade we compared the H3 dominant sequences of adjacent seasons to establish their changes.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. It has been indicated that H3, in comparison with H1 and В\Yamagata and В\Victoria hemagglutinins, contains more cysteine and the H3N2 strain very similar to the Hong Kong influenza virus continues to circulate in birds.The H3 gene translation code contains the least number of prohibitions. During last decade the H3 dominant sequence evolves faster than H1 one. The nucleoprotein of H3N2 strains is characterized by more content of lysine and less content of arginine.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion: H3N2, H1N1, В\Yamagata and В\Victoria strains one may conclude that least of all the nature restricts H3N2 to evolve and adapt to new hosts. It is likely that the following influenza pandemic will be generated by H1N1 subtype but H3N2 one and also be more mild than the 2019 pandemic.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>гонконгский грипп</kwd><kwd>гемагглютинин</kwd><kwd>нуклеопротеин</kwd><kwd>пандемия</kwd><kwd>прогнозирование</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Hong Kong’s influenza</kwd><kwd>hemagglutinin</kwd><kwd>nucleoprotein</kwd><kwd>pandemic</kwd><kwd>prediction No conflict of interest to declare</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">https://www.cdc.gov/flu/about/disease/burden.htm.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">https://www.cdc.gov/flu/about/disease/burden.htm.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харченко Е. П. Оптимизация прогнозирования вакцинных штаммов гриппа. //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2019; 18 (1): 4-17.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharchenko EP. Optimization of the Predicting of the Influenza Vaccine Strains. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2019;18 (1): 4-17 (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2019-18-1-4-17</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харченко Е. П.Три уровня прогнозирования штаммов вируса гриппа. //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2019; 18 (2): 4-17.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharchenko EP. Three Levels of the Predicting of the Influenza Vaccine Strains. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2019; 18 (2): 4-17 (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2019-18-2-4-17.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харченко Е. П. Инвариантные паттерны внутренних белков пандемических вирусов гриппа. //Инфекция и иммунитет. 2015;. 5 (4): 323-330.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharchenko EP. The invariant patterns of the internal proteins of pandemic influenza viruses. Infektsiya i immunitet [Russian Journal of Infection and Immunity]. 2015;5 (4): 323-330 (In Russ.). doi: 10.15789/2220-7619-2015-4-323-330.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bedford T, Riley S, Barr IG et al. Global circulation patterns of seasonal influenza viruses vary with antigenic drift. Nature. 2015; 523 (7559):217-20. doi: 10.1038/nature14460.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bedford T, Riley S, Barr IG et al. Global circulation patterns of seasonal influenza viruses vary with antigenic drift. Nature. 2015; 523 (7559):217-20. doi: 10.1038/nature14460.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харченко Е. П. Вирус испанского гриппа: штрихи к портрету спустя100 лет. // Инфекция и иммунитет. 2018; 8 (3): 325-334. doi: 10.15789/2220-7619-2018-3-325-334.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharchenko EP. The Spanish influenza virus: treats to the portrait after 100 years // Russian Journal of Infection and Immunity, 2018; 8 (3): 325-334 (In Russ.). doi: 10.15789/2220-7619-2018-3-325-334</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Palese P, Wang TT. Why do influenza virus subtypes die out? A hypothesis. MBio. 2011Aug 30; 2 (5). pii: e00150-11. doi: 10.1128/mBio.00150-11.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Palese P, Wang TT.Why do influenza virus subtypes die out? A hypothesis. MBio. 2011 Aug 30;2(5). pii: e00150-11. doi: 10.1128/mBio.00150-11.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Monto AS, Malosh RE, Petrie JG et al., The Doctrine of Original Antigenic Sin: Separating Good From Evil. J Infect Dis, 2017; 215 (12): 1782-1788.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Monto AS, Malosh RE, Petrie JG et al., The Doctrine of Original Antigenic Sin: Separating Good From Evil. J Infect Dis, 2017; 215 (12): 1782-1788.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харченко Е. П. Поиски универсальной противогриппозной вакцины: возможности и ограничения. //Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019; 18 (5): 4-17.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharchenko E. P. The search for a universal influenza vaccine: possibilities and limitations. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2019; 18 (2): 4-17 (In Russ.). doi:10.31631/2073-3046-2019-18-5-4-17.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Morens DM, Taubenberger JK. Pandemic influenza: certain uncertainties. Rev. Med. Virol., 2011;. 21:262-284. doi: 10.1002/rmv.689</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Morens D.M., Taubenberger J.K. Pandemic influenza: certain uncertainties. Rev. Med. Virol., 2011, vol. 21, pp. 262-284. doi: 10.1002/rmv.689</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Киселев О. И. Геном пандемического вируса гриппа A/H1N1V-2009. СПб.-М.: Компания «Димитрейд График Групп», 2011. 163 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kiselev OI. Genom pandemicheskogo virusa grippa A/H1N1V - 2009[The genome of pandemic influenza viruis A/H1N1V - 2009]. St. Petersburg-Moscow. Dimitrade Grafic Group, 2011:163 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
