Preview

Эпидемиология и Вакцинопрофилактика

Расширенный поиск

Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена uge, детектированного в штаммах Klebsiella pneumoniae

https://doi.org/10.31631/2073-3046-2020-19-3-28-32

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. Штаммы Klebsiella pneumoniae могут обладать различными генами факторов вирулентности и вызывать такие нозологические формы, как пневмония, инфекция мочевыделительной системы, абсцесс печени, неонатальный сепсис. Цель работы - провести филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена uge, детектированного в штаммах K. pneumoniae. Материалы и методы. Всего исследовано 66 бактериальных культур K. pneumoniae, идентифицированных в 2019 г. Из них 45 -выделены из проб фекалий, 20 - из проб цервикального канала, 1 - из зева. Видовую идентификацию выделенных микроорганизмов проводили бактериологическим методом, детекцию гена uge осуществляли с помощью ПЦР в реальном времени. Результаты и обсуждение. При проведении скринингового исследования K. pneumoniae uge+ штаммы выявлены в 60,61%. Нуклеотидные последовательности являются гетерогенными, штаммы K. pneumoniae, проанализированные по нуклеотидной последовательности гена uge, имеют разное генетическое родство. Отсутствие кластеризации изолятов по времени выделения и принадлежности к стационару исключает наличие у них общих эпидемических связей. Выводы. Ген uge был детектирован в 60,6% штаммов K. pneumoniae, выделенных при проведении скринингового бактериологического исследования. Нуклеотидные последовательности гена uge, полученные в ходе настоящего исследования, отличаются от аналогичных, принадлежащих гипервирулентным штаммам, что может быть использовано для оценки патогенного потенциала выявляемых в стационарах изолятов и эпидемической ситуации в отделениях лечебного учреждения, а также разработки подходов к прогнозу уровня заболеваемости инфекций клебсиеллезной этиологии, основанных на методах молекулярной эпидемиологии.

Об авторах

А. В. Устюжанин
Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества Минздрава России
Россия

Устюжанин Александр Владимирович - кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник научного отделения иммунологии, микробиологии, патоморфологии и цитодиагностики.

Екатеринбург, ул. Репина 1.

+79089249419



Г. Н. Чистякова
Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества Минздрава России
Россия

Чистякова Гузель Нуховна - доктор медицинских наук, профессор, руководитель научного отделения иммунологии, микробиологии, патоморфологии и цитодиагностики.

Екатеринбург, ул. Репина, 1.



И. И. Ремизова
Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества Минздрава России
Россия

Ремизова Ирина Ивановна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник научного отделения иммунологии, микробиологии, патоморфологии и цитодиагностики.

Екатеринбург, ул. Репина, 1.



Список литературы

1. Козлова Н. С. Баранцевич Н. Е., Баранцевич Е. П. Чувствительность к антибиотикам штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных в многопрофильном стационаре/ // Инфекция и иммунитет. - 2018. - № 1 (8). - С. 79-84. doi: 10.15789/2220-7619-2018-1-79-84.

2. Schmiedecke SS, Napolitano PG, Estrada SM. Perinatal pyogenic liver abscess: a rare entity and first reported case of Klebsiella pneumoniae. AJP Rep. 2019;(3)6:251-255.

3. Guo Y, Wang S, Zhan L, et al. Microbiological and clinical characteristics of hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae isolates associated with invasive infections in China. // Front Cell Infect Microbiol. 2017;17: 24. doi: 10.3389/fcimb.2017.00024. eCollection 2017.

4. Mukherjee S, Bhattacharjee А, Naha S, et al. -Molecular characterization of NDM-1-producing Klebsiella pneumoniae ST29, ST347, ST1224, and ST2558 causing sepsis in neonates in a tertiary care hospital of North-East India. Infection, Genetics and Evolution. 2019;69:166-175.

5. Datta S, Roy S, Chatterjee S, et al. A five-year experience of carbapenem resistance in enterobacteriaceae causing neonatal septicaemia: predominance of NDM-1. PLoS ONE. 2014;9(11):e112101. doi:10.1371/journal.pone.0112101.

6. Cubero M, Marti S, Dominguez MA, et al. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae serotype K1 clinical isolates form robust biofilms at the air-liquid interface. PLoS One. 2019;18:14(9). doi: 10.1371/journal.pone.0222628. eCollection 2019.

7. Candan ED, Aksooz N. Klebsiella pneumoniae: characteristics of carbapenem resistance and virulence factors. Acta Biochim. 2015;62(4):867-874.

8. Datta S, Mitra S, Chattopadhyay P, et al. Spread and exchange of blaNDM-1 in hospitalized neonates: role of mobilizable genetic elements. Eur. J. Clin. Microbiol Infect. Dis. 2017;36:255-265.

9. Brisse S, Fevre C, Passet V, et al. Virulent clones of Klebsiella pneumoniae: identification and evolutionary scenario based on genomic and phenotypic characterization. PLoS One. 2009;4(3):e4982.doi:10.1371/journal.pone.0004982.

10. Comandatore F, Sassera D, Bayliss SC, et al. Gene composition as a potential barrier to large recombinations in the bacterial pathogen Klebsiella pneumoniae. Genome Biol Evol. 2019. doi: 10.1093/gbe/evz236.

11. Vargas JM, Moreno Mochi MP, Nunez JM, et al. Virulence factors and clinical patterns of multiple-clone hypermucoviscous KPC-2 producing K. pneumoniae. Heliyon. 2019. Jun 19;5(6):e01829.

12. Гончаров А. Е., Зуева Л. П., Колоджиева В.В. и др., Молекулярно-генетический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. // Федеральные клинические рекомендации. - 2014. - М. - 45 с.

13. Анганова Е.В., Духанина А. В., Савилов Е. Д. Бактерии рода Klebsiella в этиологической структуре бактериальных ОКИ: оценка их патогенности на уровне фено- и генотипа. // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2011. - № 6 (61). - с. 62-65.

14. Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011;28(10):2731-2739.

15. Ikeda M, Mizoguchi M, Oshida Y, et al. Clinical and microbiological characteristics and occurrence of Klebsiella pneumoniae infection in Japan. International Journal of General Medicine. 2018;13(11):293-299. doi: 10.2147/IJGM.S166940.

16. Zhang S, Zhang X. Wu Q, et al. Clinical, microbiological, and molecular epidemiological characteristics of Klebsiella pneumoniae-induced pyogenic liver abscess in southeastern China. Antimicrob Resist Infect Control. 2019;29(80:166. doi: 10.1186/s13756-019-0615-2. eCollection 2019.


Для цитирования:


Устюжанин А.В., Чистякова Г.Н., Ремизова И.И. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена uge, детектированного в штаммах Klebsiella pneumoniae. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2020;19(3):28-32. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2020-19-3-28-32

For citation:


Ustyuzhanin A.V., Chistyakova G.N., Remizova I.I. Phylogenetic Analysis of the Nucleotide Sequences of the Uge Gene Detected in Klebsiella pneumoniae Strains. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2020;19(3):28-32. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2020-19-3-28-32

Просмотров: 66


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-3046 (Print)
ISSN 2619-0494 (Online)