Серотиповой состав, клональность и распространенность генов вирулентности у изолятов Streptococcus agalactiae, выделенных в РФ в 2021–2024 гг.

Актуальность. Streptococcus agalactiae (стрептококк группы В (СГВ)) является одним из ведущих возбудителей тяжелых перинатальных инфекций. В настоящее время основные характеристики популяции штаммов Streptococcus agalactiae в РФ остаются недостаточно изученными, что указывает на необходимость молекулярно-генетического мониторинга ее состава.

Цель. Провести комплексное исследование распространенности генетических детерминант вирулентности, а также серотипового и клонального составов изолятов S. agalactiae, выделенных в Российской Федерации в 2021–2024 гг.

Материалы и методы. Исследовано 72 неинвазивных изолята S. agalactiae, выделенных у 30 мужчин и 42 женщин в возрасте от 18 до 55 лет в Северо-Западном федеральном округе. Изоляты были выделены из различных видов биологического материала: вагинальных мазков, мазков из цервикального канала, уретры, секрета предстательной железы, мочи, спермы. Идентификация изолятов проводилась бактериологическими методами, а также с использованием латексагглютинации и ПЦР. Для определения серотипов, сиквенс-типов (ST), клональных комплексов (СС) и генов вирулентности применялось полногеномное секвенирование (WGS) с последующим биоинформатическим анализом.

Результаты и обсуждение. Установлено, что преобладающими серотипами являются V (34,7 %), Ia (22,2%) и III (22,2 %), что в совокупности составляет 79,1 % изолятов. Выявлено 22 сиквенс-типа (ST), объединенных в 7 клональных комплексов (CC). Доминирующими являлись CC1 (29,2 %), CC23 (23,6 %), CC19 (19,4 %) и CC17 (12,5 %). Наиболее распространенным генотипом пилей был PI-1+PI-2A1 (36%). Гены поверхностного белка srr1 и альфа-подобных белков (Alph) выявлялись у 80,6% и 58% изолятов соответственно. Высоковирулентный комплекс CC17 характеризовался наличием генов hvgA, srr2 и rib.

Заключение. Популяция S. agalactiae в РФ характеризуется значительным генетическим разнообразием при доминировании серотипов V, Ia, III и клональных комплексов CC1, CC23, CC19 и CC17. Выявление гипервирулентного клона CC17 (12,5 % изолятов) указывает на циркуляцию штаммов высокого риска, ассоциированных с неонатальными инвазивными инфекциями. Полученные результаты указывают на то, что шестивалентная конъюгированная вакцина потенциально может охватывать большую часть циркулирующих штаммов. Установленные профили генов вирулентности (пили, поверхностные белки) и их ассоциация с определенными клональными комплексами подтверждают их перспективность в качестве мишеней для разработки серотипнезависимых вакцин.

1. Coggins SA, Puopolo KM. Neonatal Group B Streptococcus Disease Pediatrics in Review. 2024. Vol. 45, N2. P. 63–73.

2. Gonçalves BP, Procter SR, Paul P, et al. Group B streptococcus infection during pregnancy and infancy: estimates of regional and global burden The Lancet Global Health. 2022. Vol. 10, N6. P. e807–e819.

3. Stephens K, Charnock-Jones DS, Smith GCS. Group B Streptococcus and the risk of perinatal morbidity and mortality following term labor American Journal of Obstetrics and Gynecology. 2023. Vol. 228, N5. P. S1305–S1312.

4. Paul P, Gonçalves BP, Le Doare K, Lawn JE. 20 million pregnant women with group B streptococcus carriage: consequences, challenges, and opportunities for prevention Current Opinion in Pediatrics. 2023. Vol. 35, N2. P. 223–230.

5. Russell NJ, Seale AC, O’Driscoll M, et al. Maternal Colonization With Group B Streptococcus and Serotype Distribution Worldwide: Systematic Review and Meta-analyses Clinical Infectious Diseases. 2017. Vol. 65, Suppl. 2. P. S100–S111.

6. Садова Н. В., Заплатников А. Л., Шипулина О. Ю. и др. Частота носительства Streptococcus agalactiae среди женщин детородного возраста и его роль в развитии врожденных инфекций: предварительные результаты пилотного исследования Медицинский совет. 2016. №16. С. 164–166.

7. Васильева В. А., Шипицына Е. В., Шалепо К. В, и др. Молекулярная эпидемиология инфекций, вызываемых стрептококками группы В у беременных и новорожденных, и разработка профилактических вакцин Журнал акушерства и женских болезней. 2018. Т. 67, №5. С. 62–73.

8. Чучукина О. А., Славнов Н. Н., Шураева С. А., Бочков И. А. Распространение стрептококков серогруппы В среди амбулаторных пациентов в Москве Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016. №4. С. 23–26.

9. Замарина Т. В., Алексеева В. В., Меркулова С. В. и др. Оценка спектра чувствительности к антибактериальным препаратам изолятов Streptococcus agalactiae, выделенных у женщин репродуктивного возраста на территории Волгоградской области Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024. Т. 26, № S1. С. 28–29. EDN XXNKCT.

10. Pena JMS, Lannes-Costa PS, Nagao PE. Vaccines for Streptococcus agalactiae: current status and future perspectives Frontiers in Immunology. 2024. Vol. 15. P. 1430901.

11. Absalon J, Segall N, Block SL, et al. Safety and immunogenicity of a novel hexavalent group B streptococcus conjugate vaccine in healthy, non-pregnant adults: a phase 1/2, randomised, placebo-controlled, observer-blinded, dose-escalation trial The Lancet Infectious Diseases. 2021. Vol. 21, N2. P. 263–274.

12. Shipitsyna E, Shalepo K, Zatsiorskaya S, et al. Significant shifts in the distribution of vaccine capsular polysaccharide types and rates of antimicrobial resistance of perinatal group B streptococci within the last decade in St. Petersburg, Russia European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 2020. Vol. 39, N8. P. 1487–1493.

13. Колоусова К. А., Шипицына Е. В., Шалепо К. В., Савичева А. М. Virulence and pathogenicity factors of S. agalactiae strains isolated from pregnant women and newborns Журнал акушерства и женских болезней. 2021. Т. 70, №5. С. 15–22.

14. Шалепо К. С., Хуснутдинова Т. А., Будиловская О. В. и др. Молекулярно-генетические детерминанты вирулентности Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных и новорожденных Санкт-Петербурга и Ленинградской области в 2010–2023 годах Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101, №2. С. 217–226.

15. McGee L, Chochua S, Li Z, et al. Multistate, population-based distributions of candidate vaccine targets, clonal complexes, and resistance features of invasive Group B Streptococci within the US: 2015–2017 Clinical Infectious Diseases. 2021. Vol. 72, N6. P. 1004–1013.

16. Khan UB, Jauneikaite E, Andrews R, Chalker VJ, Spiller OB. Identifying large-scale recombination and capsular switching events in Streptococcus agalactiae strains causing disease in adults in the UK between 2014 and 2015 Microb Genom. 2022. Vol. 8, N3. P. 000783.

17. Кулешевич Е. В., Ильясов Ю. Я., Линник Д. С. и др. Распространенность островов патогенности PAI-A и PAI-A1 среди российских штаммов стрептококков группы В Журнал акушерства и женских болезней. 2021. Т. 70, №4. С. 65–72.

18. Lin SM, Jang AY, Zhi Y, et al. Vaccination With a Latch Peptide Provides Serotype-Independent Protection Against Group B Streptococcus Infection in Mice The Journal of Infectious Diseases. 2018. Vol. 217, N1. P. 93–102.

19. Santillan DA, Rai KK, Santillan MK, Krishnamachari Y, Salem AK, Hunter SK. Efficacy of polymeric encapsulated C5a peptidase–based group B streptococcus vaccines in a murine model American Journal of Obstetrics and Gynecology. 2011. Vol. 205, N3. P. 249.e1–249.e8.

20. De Zoysa A, Edwards K, Gharbia S, Underwood A, Charlett A, Efstratiou A. Non-culture detection of Streptococcus agalactiae (Lancefield group B Streptococcus) in clinical samples by real-time PCR Journal of Medical Microbiology. 2012. Vol. 61, Pt 8. P. 1086–1090.

21. Prjibelski A, Antipov D, Meleshko D, Lapidus A, Korobeynikov A. Using SPAdes De Novo Assembler Current Protocols in Bioinformatics. 2020. Vol. 70, N1. P. e102.

22. Gurevich A, Saveliev V, Vyahhi N, Tesler G. QUAST: quality assessment tool for genome assemblies Bioinformatics. 2013. Vol. 29, N8. P. 1072–1075.

23. Dyster V, Hung H. GBS-Typer-sanger-nf [Internet]. Доступно по: https: github.com/sanger-bentley-group/GBS-Typer-sanger-nf. Ссылка активна на 8 сентября 2025.

24. Jolley KA, Bray JE, Maiden MCJ. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.org website and their applications Wellcome Open Research. 2018. Vol. 3. P. 124.

25. Mangiola S, Papenfuss A. tidyHeatmap: an R package for modular heatmap production based on tidy principles Journal of Open Source Software. 2020. Vol. 5, N52. P. 2472.

26. Shabayek S, Vogel V, Jamrozy D, Bentley SD, Spellerberg B. Molecular Epidemiology of Group B Streptococcus Colonization in Egyptian Women Microorganisms. 2022. Vol. 11, N1. P. 38.

27. Campisi E, Rinaudo CD, Donati C, et al. Serotype IV Streptococcus agalactiae ST-452 has arisen from large genomic recombination events between CC23 and the hypervirulent CC17 lineages Scientific Reports. 2016. Vol. 6. P. 29799.

28. Tavares T, Pinho L, Bonifácio Andrade E. Group B Streptococcal Neonatal Meningitis Clin Microbiol Rev. 2022. Vol. 35, N2. P. e0007921.

29. Choi JH, Kim TH, Kim ET, Kim YR, Lee H. Molecular epidemiology and virulence factors of group B Streptococcus in South Korea according to the invasiveness BMC Infectious Diseases. 2024. Vol. 24, N1. P. 740.

30. Pinto TCA, Oliveira LMA, da Costa NS, et al. Group B Streptococcus awareness month: vaccine and challenges underway International Journal of Infectious Diseases. 2021. Vol. 110. P. 279–280.

31. Inventprise Inc. Phase I/II Study to a Assess the GBS-06 Vaccine Manufactured by Inventprise, Inc., in Healthy, Non-Pregnant, Adult Women of Childbearing Age. [Internet]. National Library of Medicine; 2025. Доступно по: https: clinicaltrials.gov/study/NCT06611371. Ссылка активна на 8 сентября 2025.

32. Gori A, Harrison OB, Mlia E, et al. Pan-GWAS of Streptococcus agalactiae Highlights Lineage-Specific Genes Associated with Virulence and Niche Adaptation mBio. 2020. Vol. 11, N3. P. e00728–20.

33. Maeda T, Takayama Y, Fujita T, et al. Comparison between Invasive and Non-Invasive Streptococcus agalactiae Isolates from Human Adults, Based on Virulence Gene Profiles, Capsular Genotypes, Sequence Types, and Antimicrobial Resistance Patterns Japanese Journal of Infectious Diseases. 2021. Vol. 74, N4. P. 316–324.