Оценка распространенности и эпидемического потенциала штаммов древних и современных сублиний генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Омской области

Актуальность. Распространение эпидемических и резистентных генотипов Mycobacterium tuberculosis представляет серьезную угрозу реализации национальной программы по борьбе с туберкулезом в России. Цель исследования – оценка тенденций развития эпидемического процесса туберкулеза и распространенности штаммов различных сублиний и кластеров генотипа Beijing М. tuberculosis в Омской области. Материалы и методы. В соответствии с общепринятым алгоритмом описательно-оценочного эпидемиологического исследования изучена заболеваемость, распространенность и смертность от туберкулеза в Омской области за период 2009–2019 годов. Изучена структура популяции M. tuberculosis в Омской области (n = 483). Культивирование M. tuberculosis, определение лекарственной чувствительности, выделение ДНК проведено стандартными методами. Принадлежность штаммов M. tuberculosis к генотипу Beijing, его сублиниям и кластерам B0/W148 и 94-32 определяли на основе анализа специфических маркеров с помощью ПЦР. Результаты. Заболеваемость туберкулезом сократилась в 1,9 раза и составила в 2019 г. 67,3 на 100 тыс. населения. Динамика распространенности туберкулеза и смертности также характеризовалась выраженной тенденцией к снижению. Более половины (n = 317, 65,6%) изолятов принадлежали к генотипу Beijing, в том числе к его древней (n = 44,13,9%) и современной (n = 273, 86,1%) сублинии. Современная сублиния Beijing включала штаммы кластеров В0/W148 (n = 94, 29,6%) и 94-32 (n = 178, 56,2%). Почти все древние штаммы Beijing были МЛУ (97,7%) и характеризовались предширокой и широкой ЛУ (52,2% против 19,4% среди современных сублиний (PR = 0,59; [95% ДИ 0,35–0,99]). Высокий уровень кластеризации резистентных штаммов древней сублинии (CR = 0,84) позволяет рассматривать их в качестве потенциально эпидемических для Омской области. Выводы. На фоне улучшения эпидемиологической ситуации по туберкулезу в Омской области в целом циркуляция мультирезистентных штаммов кластера Beijing B0/W148 и штаммов древних сублиний генотипа Beijing, ассоциированных с предширокой и широкой лекарственной устойчивостью, указывает на эпидемический потенциал этих геновариантов M. tuberculosis и подчеркивает необходимость их тщательного мониторинга в системе эпидемиологического надзора.

туберкулез, заболеваемость, распространенность, M. tuberculosis, генотип Beijing, древние сублинии

1. Lytras T., Kalkouni O. The global tuberculosis epidemic: turning political will into concrete action. // Journal of Thoracic disease.2018. Vol.10, (suppl 26). P. 3149–3152.

2. Sharma A., Hill A., Kurbatova E., et al. Estimating the future burden of multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis in India, the Philippines, Russia, and South Africa: a mathematical modelling study// Lancet Infectious diseases. 2017. Vol. 17, № 7. P. 707–715.

3. Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen’s pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. // Tuberculosis. 2015. Vol. 95, (suppl 1). P. 167–176.

4. Ribeiro S.C., Gomes L.L., Amaral E.P, et al. Mycobacterium tuberculosis strains of the modern sublineage of the Beijing family are more likely to display increased virulence than strains of the ancient sublineage. // Journal of Clinical Microbiology. 2014. Vol. 52, № 7. P. 2615–2624.

5. Wiens K.E., Woyczynski L.P., Ledesma J.R., et al. Global variation in bacterial strains that cause tuberculosis disease: a systematic review and meta-analysis. // BMC Medicine. 2018. Vol.16, №1. P.196.

6. Hanekom M., van der Spuy G.D., Gey van Pittius N.C., et al. Evidence that the spread of Mycobacterium tuberculosis strains with the Beijing genotype is human population dependent. Journal of Clinical Microbiology. 2007. Vol. 45. P. 2263–2266.

7. de Keijzer J., de Haas P.E., de Ru A.H., et al. Disclosure of selective advantages in the «modern» sublineage of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype family by quantitative proteomics // Molecular and Cellular Proteomics. 2014. Vol. 13, № 10. P. 2632–45.

8. Wada T., Iwamoto T., Maeda S. Genetic diversity of the Mycobacterium tuberculosis Beijing family in East Asia revealed through refined population structure analysis. // FEMS Microbiology Letters. 2009. Vol. 291, №1. P.35–43.

9. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., et al. Phylogenetic reconstruction within mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Northwestern Russia. // Research in Microbiology. 2002. Vol. 153, № 10. P. 629–637.

10. Пасечник О.А., Вязовая А.А., Дымова М.А., и др. Исходы заболевания туберкулезом в зависимости от генотипа Mycobacterium tuberculosis. // Инфекция и иммунитет. 2019. Т. 9, № 3–4. С. 531–538.

11. Mokrousov I., Chernyaeva E., Vyazovaya A., et al. Rapid Assay for Detection of the Epidemiologically Important Central Asian/Russian Strain of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype//Journal of Clinical Microbiology. 2018. Vol. 56, № 2. e01551–17.

12. Shitikov E., Kolchenko S., Mokrousov I., et al. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis. // Scientific Reports. 2017. Vol.7. P. 9227.

13. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., et al. Russian «successful» clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: multiplex PCR assay for rapid detection and global screening. // Journal of Clinical Microbiology. 2012. Vol. 50. P. 3757–3759.

14. Mokrousov I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis. // Clinical Microbiology Reviews. 2013. Vol. 26, № 2. P. 342–60.

15. Вязовая А.А., Ветров В.В., Лялина Л.В., и др. Характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis (по материалам 15-летнего наблюдения в Ленинградской области). // Инфекция и иммунитет. 2017. Т.7, №1. С. 34–40.

16. Skiba Y., Mokrousov I., Ismagulova G., et al. Molecular snapshot of Mycobacterium tuberculosis population in Kazakhstan: a country-wide study. // Tuberculosis (Edinb). 2015. Vol. 95, № 5. P. 538–546.

17. Engström, A., Antonenka, U., Kadyrov, A. et al. Population structure of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis in Central Asia// BMC Infectious Diseases. 2019. Vol. 19. P. 908.

18. Shamputa I.C., Lee J., Allix-Béguec C., et al. Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from a tertiary care tuberculosis hospital in South Korea. // Journal of Clinical Microbiology. 2010. Vol. 48. P. 387–94.

19. Luo T., Comas I., Luo D., et al. Southern East Asian origin and coexpansion of Mycobacterium tuberculosis Beijing family with Han Chinese. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015. Vol. 112, № 26. P. 8136–8141.

20. Maeda S., Hang N.T., Lien L.T., et al. Mycobacterium tuberculosis strains spreading in Hanoi, Vietnam: Beijing sublineages, genotypes, drug susceptibility patterns, and host factors. // Tuberculosis (Edinb). 2014. Vol. 94, № 6. P. 649–656.