Структура популяции штаммов возбудителя коклюша на территории России
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2016-15-4-22-28
Аннотация
Цель исследования - изучение с помощью мультилокусного антигенного сиквенс-типирования особенностей состава популяции B. pertussis, циркулирующей на территории России, в динамике эпидемического процесса коклюшной инфекции. Материалы и методы. В работе изучено 573 штамма B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в 1948 - 2015 годах. Генотипирование штаммов проводили по схеме MAST2 на основе секвенирования фрагментов генов ptxP-fim3-prn. Результаты секвенирования обрабатывали в программе CromasLite, идентификацию аллелей и сиквенс-типов осуществляли по EMBL/ GenBank. Результаты. Показано, что за более чем 50-летней период плановой иммунизации детского населения в клональном составе популяции штаммов возбудителя коклюша произошли существенные изменения. Формирование популяции штаммов B. pertussis шло по пути последовательной смены штаммов вакцинных генотипов на штаммы новых невакцинных генотипов. Современная популяция возбудителя коклюша представлена штаммами генотипа 322 и 329, обладающими высокой вирулентностью и вызывающими тяжелое клиническое течение болезни.
Об авторах
О. Ю. Борисова
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Н. Т. Гадуа
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
А. С. Пименова
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
М. С. Петрова
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
О. П. Попова
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
В. А. Алешкин
ФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Л. И. Кафарская
ГБОУ ВПО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова»
Россия
Россия
Е. Е. Донских
ГБОУ ВПО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова»
Россия
Россия
Е. В. Юсуф
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ханты-Мансийском автономном округе-Югре»
Россия
Россия
Н. А. Остапенко
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ханты-Мансийском автономном округе-Югре»
Россия
Россия
Т. И. Москвина
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Челябинской области»
Россия
Россия
Т. А. Щербакова
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Челябинской области»
Россия
Россия
Список литературы
1. Advani A., Van der Heide H.G.J., Hallander H.O., Mooi F.R. Analysis of Swedish Bordetella pertussis isolates with three typing methods: characterization of an epidemic lineage. J. of Microbiological Methods. 2009; 78: 297 - 301.
2. Brinig M.M., Cummings C.A., Sanden G.N. Significant gene order and expression differences in B. pertussis despite limited gene content variation. J. of Bacteriology. 2006; 188 (7): 2375 - 2382.
3. Cassiday P, Sanden G., Heuvelman K., Mooi F., Bisgard K. M., Popovic T. Polymorphism in Bordetella pertussis pertactin and pertussis toxin virulence factors in the United States, 1935 - 1999. J. Infect. Dis. 2000; 182: 1402 - 1408.
4. King A., van Gorkom T., van der Heide H., Advani A., van der Lee S. Changes in the genomic content of circulating B. pertussis strains isolated from the Netherlands, Sweden, Japan and Australia: adaptive evolution or drift? BMC Genomics. 2010; 11: 64.
5. Mooi F.R., van Loo I.H.M., van Gent M., He Q., Heuvelman C.J., Bart M.J. et al. Bordetella pertussis with increased pertussis toxin production associated with pertussis resurgence. Emerg. Infect. Dis. 2009; 15: 1206 - 1213.
6. Mooi F.R. Bordetella pertussis and vaccination: The persistence of a genetically monomorphic pathogen. J. Infection, genetics and evolution. 2009; 2: 1 - 14.
7. Schmidtke A., Boney K.O., Martin S.W., Skoff T.H., Tondella M.L., Tatti K.M. Population diversity among Bordetella pertussis isolates, United States, 1935 -2009. J. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18 (8): 1248 - 1255.
8. Xu Y., Grondahl-Yli-Hannuksila K., Tan Y., Felg L., Kallonen T. et all. Whole-genome sequencing reveal the effect of vaccination on the evolution of Bordetella pertussis. Sci. Rep. 2015; 5: 12888.
9. Онищенко Г.Г. Эпидемиологическое благополучие населения России. Журн. микробиол. 2012; 1: 42 - 51.
10. Селезнева Т.С., Титова Н.С., Заргарьянц А.И., Максимова Н.М., Маркина С.С. Влияние вакцинопрофилактики на эпидемический процесс управляемых инфекций в Российской Федерации. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2002; 2: 6 - 11.
11. Чистякова Г.Г., Борисова О.Ю., Лыткина И.Н., Мазурова И.К., Комбарова С.Ю., Петрова М.С. и др. Особенности эпидемического процесса коклюшной инфекции в Москве на современном этапе. Журн. микробиол. 2005; 5: 35 - 40.
12. Алешкин В.А, Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Мазурова И.К. Особенности генотипической изменчивости штаммов B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в России. Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2012; 5 (87): 177 - 183.
13. Борисова О.Ю., Мазурова И.К., Ивашинникова Г.А., Гадуа Н.Т., Рудакова И.А., Салова Н.Я. и др. Характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в г. Москве, с помощью мультилокусного секвенирования. Журнал микробиол. 2012; 2: 28 - 34.
14. Борисова О.Ю., Мазурова И.К., Ивашинникова Г.А., Гадуа Н.Т., Рудакова И.А., Салова Н.Я. и др. Генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в России. Медицинский альманах. 2012; 2 (21): 30 - 34.
15. Курова Н.Н. Молекулярно-биологическая характеристика Bordetella pertussis, циркулирующих в период подъема заболеваемости, и совершенствование лабораторной диагностики коклюша: Автореф. дис.. к-та мед. наук. С.-Петербург; 2004.
16. Шинкарев А.С, Мерцалова Н.У, Мазурова И.К., Борисова О.Ю., Захарова Н.С., Озерецковская М.Н. и др. Современные штаммы Bordetella pertussis: молекулярная и иммунобиологическая характеристика. Журн. микробиол. 2007; 4: 20 - 25.
17. Ивашинникова Г.А., Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Рудакова И.А., Мазурова И.К. Применение метода мультилокусного секвенирования для наблюдения за циркулирующими штаммами B. pertussis. Здоровье населения и среда обитания. 2012; 9: 28 - 30.
18. Kourova N., Njamkepo E, Brun D. Monitoring of Bordetella isolates circulating in Saint Petersburg, Russia between 2001 and 2009. Res. Microbiol. 2010; 161 (10): 810 - 815.
19. Litt D.J., Neal S.E., Fry N.K. Changes in Genetic Diversity of the Bordetella parapertussis Population in the United Kingdom between 1920 and 2006 reflect vaccination coverage and emergence of a single dominant clonal type. J. Clin. Microbiol. 2009; 47 (3): 680 - 688.
20. van Amersfoorth S.C.M., Schouls L.M., van der Heide H.G.J., Advani A., Hallander H.O., Bondeson K. et al. Analysis of Bordetella pertussis populations in european countries with different vaccination policies. J. Clin. Microbiol. 2005; 43: 2837 - 2843.
21. van Loo I.H.M., Heuvelman K.J., King A.J., Mooi F.R. Multilocus sequence typing of Bordetella pertussis based on surface protein genes. J. Clin. Microbiology. 2002; 40: 1994 - 2001.
22. Попова О.П., Борисова О.Ю., Петрова М.С., Грачева Н.М., Абрамова Е.Н., Пименова А.С., Гадуа Н.Т. Клинико-микробиологические сопоставления при коклюше у детей в современных условиях. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 19 (5): 13 - 18.
23. Emsley P., Charles I.G., Fairweather N.F., Isaacs of the N.W. Structure Bordetella pertussis virulence factor P 69 pertactin. Nature. 1996; 381: 90 - 92.
24. Hellwing S.M., Rodriguez M.E., Berbers G.A., van de Wilkel J.G, Mooi F.R. Crucial role of antibodies to pertactin in Bordetella pertussis immunity. J. Infect. Dis. 2004; 189 (2): 354.
25. Leininger E., Ewanowich C.A., Bhargava A., Peppler M.S., Kenimer J.G., Brennan M.J. Comparative roles of the Arg-Gly-Asp sequence present in the Bordetella pertussis adhesions pertactin and filamentous hemagglutinin. J. Infect. Immunity. 1992; 60: 2380 - 2385.
26. Mkinen J., Berbers G., Mooi F.R., Viljanen M.K., Arvilommi H., Mertsola J. Bordetella pertussis protein pertactin induces type-specific antibodies: one possible explanation for the emergence of antigenic variants? J. Infect. Dis. 2003; 187 (8): 1200 - 1205.
27. Martin S.W., Pawloski L., Williams M., Weening K., DeBolt C., Qin X. et al. Pertactin-negative Bordetella pertussis strains: evidence for a possible selective advantage. Clin. Infectious Dis. 2015; 60: 223 - 227.
28. Pawloski L.C., Queenan A.M., Cassiday P.K., Lynch A.S., Harrison M.J., Shang W. et all Prevalence and molecular characterization of pertactin-deficient Bordetella pertussis in United States. Clin. And Vaccine Immunology: CVI. 2014; 21: 119 - 125.
Рецензия
Для цитирования:
Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Пименова А.С., Петрова М.С., Попова О.П., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Донских Е.Е., Юсуф Е.В., Остапенко Н.А., Москвина Т.И., Щербакова Т.А. Структура популяции штаммов возбудителя коклюша на территории России. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2016;15(4):22-28. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2016-15-4-22-28
For citation:
Borisova O.Yu., Gadya N.T., Pimenova A.S., Petrova M.S., Popova O.P., Aleshkin V.A., Kafarskia L.I., Donskikh E.E., Usuf E.V., Ostapenko N.A., Moskvina T.I., Tcherbakova T.A. Structure of Population of Strains of the Bordetella pertussis in the Russia. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2016;15(4):22-28. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2016-15-4-22-28
Просмотров:
847
Послать статью по эл. почте 