Молекулярная эпидемиология туберкулезной инфекции в Омской области

В Омской области в 2005 - 2014 годах наблюдалась тенденция к снижению заболеваемости населения туберкулезом (ТБ). Вместе с тем динамика распространенности ТБ с множественной лекарственной устойчивостью характеризовалась умеренной тенденцией к росту с 29,6 до 38,3 на 100 тыс. населения (Р < 0,05). С целью изучения молекулярно-генетических особенностей основных генотипов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Омской области, было проведено VNTR-типирование ДНК изолятов M. tuberculosis, полученных от 100 больных туберкулезом органов дыхания. В результате типирования было идентифицировано 36 генетических типов. В состав 10 кластеров различного размера вошли 74 изолята. К генетическому семейству Beijing относились 77,0% кластеризующихся изолятов (ОШ = 25,7, ДИ 6,87 * 96,17). Среди уникальных изолятов преобладали М. tuberculosis неустановленных генотипов, не относящихся к семейству Beijing (ОШ = 0,11, 95% ДИ 0,04 * 0,30), а также редко встречающихся генотипов Uganda I, Haarlem, S. Частота кластеризации в данном исследовании составила 64%, что указывает на значительную долю случаев туберкулеза, связанных с активной передачей микобактерий ТБ. Полученные данные представляют интерес для оценки и выбора наиболее эффективных мер предупреждения распространения штаммов с множественной лекарственной устойчивостью на территории Омской области.

эпидемиология, распространенность, MIRU-VNTR-типирование, кластеры, генотипы, генотип Beijing, epidemiology, prevalence, MIRU-VNTR-typing, clusters, genotypes, genotype Beijing

1. Пасечник О.А., Стасенко В.Л., Блох А.И. Эпидемиологические проявления туберкулезной инфекции в регионах Сибири с различной распространенностью ВИЧ-инфекции. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2015; 5 (84): 31 - 35.

2. Пасечник О.А., Астафурова Е.Д, Бокарева Р.В., Кортусова Л.Н. Особенности спектра лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза у впервые выявленных больных. Современные проблемы науки и образования.2014; 6: 1024.

3. Мокроусов И.В. Методологические подходы к генотипированию Mycobacterium tuberculosis для эволюционных и эпидемиологических исследований. Инфекция и иммунитет. 2012; 2 (3); 603 - 614.

4. Ribeiro F.K., Pan W., Bertolde A.,Vinhas S. A., Peres R.L., Riley L.Genotypic and spatial analysis of Mycobacterium tuberculosis transmission in a high-incidence urban setting. Clin. Infect. Dis.2015; 61 (5): 758 - 66. DOI: 10,1093/CID/civ365.

5. Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Вязовая А.А., Лялина Л.В., Шульгина М.В., Мясникова Е.Б. и др. Молекулярно-генетические исследования возбудителя в системе эпидемиологического надзора за туберкулезом. Медицинский альянс. 2014; 1: 75 - 78.

6. Embden J.D.van, Cave M.D., Crawford J.T., Dale J.W., Eisenach K.D., Giequel B. et al. Strainidentification of Mycobacterium tuberculosis by DNA Fingerprinting: Recommendations for a Standartized Methodology. J. Clin. Microbiol. 1993; 31 (2): 406 - 409.

7. Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., R sch-Gerdes S., Willery E. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 2006; 44 (12): 4498 - 4510.

8. Дымова М.А., Альховик О.И., Чередниченко А.Г., Храпов Е.А., Петренко Т.И., Филипенко М.Л. Генотипирование изолятов Mycobacterium tuberculosis, характеризующихся широкой лекарственной устойчивостью. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина. 2013; 11 (1): 110 - 117.

9. Nava-Aguilera E., Andersson N., Harris E., Mitchell S., Hamel C., Shea B. et al. Risk factors associated with recent transmission of tuberculosis: systematic review and meta-analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2009; 13: 17 - 26.

10. Munch Z., VanLill S.W., Booysen C.N., Zietsman H.L., Enarson D.A., Beyers N. Tuberculosis transmission patterns in a higt-incidence area: a spatial analysis. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2003; 7: 271 - 277.

11. Концевая И.С., Николаевский В.В. Роль генетической группы Beijing Mycobacterium tuberculosis в эпидемиологии туберкулеза в Российской Федерации. Биомика. 2014; 6 (1): 13 - 23.

12. Ляшенко А.А. Генетические варианты микобактерий туберкулеза и их эпидемиологическая значимость. Science Rise. 2015; 3/4 (8): 13 - 18.

13. Огарков О.Б., Жданова С.Н., Мокроусов И.В., Винокурова М.К., Алексеева Г.И., Баранова Ю.А., и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика штаммов M. tuberculosis семейства S Cаха (Якутия). Сибирский медицинский журнал. 2014; 6: 109 - 111.

14. Fok A., Numata Y., Schultzer M., FitzGerald M.J. Risk factors for clustering of tuberculosis cases: a systematic review of population-based molecular epidemiology studies. Int. J. Tuberc. lung Dis. 2008. 12 (5): 480 - 492.

15. Андреевская С.Н., Черноусова Л.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., Кузьмин А.В. Трансмиссия штаммов микобактерий туберкулеза, обусловленная миграционными процессами в Российской Федерации. Туберкулез и болезни легких. 2006; 1: 29 - 35.