Молекулярная эпидемиология вируса бешенства на территории Российской Федерации
Аннотация
Определена нуклеотидная последовательность N-гена 81 штамма вируса бешенства, изолированных на территории Российской Федерации в период с 2008 по 2016 гг. Для реконструкции филогенетических событий были проанализированы 100 последовательностей N-генов вируса бешенства. Также была проведена временная датировка появления геновариантов вируса бешенства. Установлено, что вирусы-«космополиты» степного типа подразделяются на две филогенетически дискретные подгруппы с характерной географической локализацией. В работе впервые описана циркуляция вирусов подгруппы А2 (Канада, Аляска, Якутия) на территории севера Европейской части Российской Федерации и архипелага Земля Франца-Иосифа. Присутствие геноварианта вируса бешенства степного типа было зарегистрировано на территории Приморского края и, по всей видимости, является результатом антропогенного переноса вируса.
Об авторах
А. А. Девяткин
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора; ФГБНУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»; ФГБНУ «НИИ медицины труда»
Россия
Россия
А. Н. Лукашев
ФГБНУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»
Россия
Россия
Е. М. Полещук
ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора
Россия
Россия
С. Е. Ткачёв
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Россия
Россия
В. Г. Дедков
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора; ФГБНУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»
Россия
Россия
Г. Н. Сидоров
ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора; ФГБОУ ВПО «Омский государственный педагогический университет»
Россия
Россия
М. Ю. Щелканов
ГАОУ ВПО «Дальневосточный федеральный университет»
Россия
Россия
И. В. Галкина
ГАОУ ВПО «Дальневосточный федеральный университет»
Россия
Россия
Г. Г. Карганова
ФГБНУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова»
Россия
Россия
М. В. Гаврило
ФГБУ «Национальный парк «Русская Арктика»
Россия
Россия
Г. А. Шипулин
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Список литературы
1. Knobel D.L., Cleaveland S., Coleman P.G., F vre E.M., Meltzer M.I., Miranda M.E. et al. Re-evaluating the burden of rabies in Africa and Asia. Bull World Health Organ. 2005; 83 (5): 360 - 368.
2. Fooks A.R., Banyard A.C., Horton D.L., Johnson N., McElhinney L.M., Jackson A.C. Current status of rabies and prospects for elimination. Lancet. 2014; 6736 (13):1 - 11. Доступно на: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24828901
3. Bouckaert R., Heled J., K hnert D., Vaughan T., Wu C.H., Xie D. et al. BEAST 2: A Software Platform for Bayesian Evolutionary Analysis,” PLoS Comput. Biol. 2014; 10 (4): 1 - 6, Доступно на: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24722319
4. Kuzmin I.V., Botvinkin A.D., McElhinney L.M., Smith J.S., Orciari L.F., Hughes G.J. et al. Molecular epidemiology of terrestrial rabies in the former Soviet Union. J. Wildl. Dis. 2004 Oct.; 40 (4): 617 - 631. Доступно на: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15650080
5. Metlin A.E., Rybakov S., Gruzdev K., Neuvonen E., Huovilainen А. Genetic heterogeneity of Russian, Estonian and Finnish field rabies viruses. Arch. Virol. 2007 Jan.;152 (9): 1645 - 54. Доступно на: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17558542
6. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Грибенча С.В. Итоги изучения антигенного и генетического разнообразия вируса бешенства в популяциях наземных млекопитающих России. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (3): 9 - 16.
7. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Ткачёв С.Е., Девяткин А.А., Дедков В.Г., Очкасова Ю.В. и др. Эколого-вирусологические особенности эпизоотического процесса бешенства в центрально- чернозёмном районе России. Ветеринарная патология. 2013; 2: 101 - 108.
8. Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Ткачёв С.Е. Молекулярная эпидемиология бешенства на юге Восточной Сибири. Инфекция и иммунитет. 2013; 3 (2): 164 - 164.
9. Чупин С.А., Чернышова Е.В., Метлин А.Е. Генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства , выявленных на территории Российской Федерации в период 2008 - 2011 гг. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 44 -48.
10. Сидоров Г.Н. Аспекты исторического развития природных очагов бешенства в Европе и Северной Азии. Ветеринарная патология. 2002; 1: 21 - 25.
11. Shchelkanov M.Y., Deviatkin A.A., Ananiev V.Y., Dedkov VG, Shipulin GA, Sokol NN, et al. Complete Genome Sequence of a Rabies Virus Strain Isolated from a Brown Bear ( Ursus arctos ) in Primorsky Krai, Russia (November 2014). Genome Announc. 2016 Aug 25 4 (4):e00642-16. Доступно на: http://genomea. asm.org/lookup/doi/10.1128/genomeA.00642-16.
Рецензия
Для цитирования:
Девяткин А.А., Лукашев А.Н., Полещук Е.М., Ткачёв С.Е., Дедков В.Г., Сидоров Г.Н., Щелканов М.Ю., Галкина И.В., Карганова Г.Г., Гаврило М.В., Шипулин Г.А. Молекулярная эпидемиология вируса бешенства на территории Российской Федерации. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2017;16(1):39-42. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-1-39-42
For citation:
Deviatkin A.A., Lukashev A.N., Poleshchuk E.M., Tkachev S.E., Dedkov V.G., Sidorov G.N., Shchelkanov M.Yu., Galkina I.V., Karganova G.G., Gavrilo M.V., Shipulin G.A. Molecular Epidemiology of Rabies Virus in the Territory of the Russian Federation. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2017;16(1):39-42. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-1-39-42
Просмотров: 605
Послать статью по эл. почте 