Preview

Эпидемиология и Вакцинопрофилактика

Расширенный поиск

Мониторинг метициллинрезистентных штаммов стафилококка в многопрофильном стационаре Москвы с помощью молекулярно-биологических методов

https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-1-44-50

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. Стафилококки являются одними из самых распространенных патогенов в структуре этиологических агентов госпитальных инфекций. Метициллинрезистентные стафилококки характеризуются устойчивостью к основным группам современных антибиотиков и имеют высокий приоритет по угрозе для здоровья человека по оценкам Всемирной организации здравоохранения. Внедрение современных молекулярно-биологических методов при мониторинге метициллинрезистентных стафилококков необходимо для быстрой и точной идентификации микроорганизмов, контроля за эпидемиологической ситуацией и изучения необходимости проведения противоэпидемических мероприятий.

Цель исследования – анализ результатов мониторинга метициллинрезистентных штаммов стафилококка с помощью молекулярно-биологических методов в многопрофильном стационаре Москвы в течение одного года.

Материалы и методы. Одноцентровое обсервационное исследование с периодом наблюдения – один год (с декабря 2016 г. по декабрь 2017 г.). Исследовался биологический материал от 240 пациентов с признаками инфекции, смывов (n = 250) с объектов внутрибольничной среды стационара. Проведено полногеномное секвенирование 24 изолятов стафилококков, выделенных от больных и из смыва с объекта внутрибольничной среды. Выявление ДНК метициллинрезистентных штаммов выполняли с использованием набора реагентов «АмплиСенс®MRSA-скрин-титр-FL». Секвенирование проводилось на приборе Illumina HiSeq1500 с использованием наборов IlluminaHiSeq PE RapidClusterKit v2 и IlluminaHiSeqRapid SBS Kit v2.

Результаты. Методом ПЦР ДНК метициллинрезистентных стафилококков была выявлена в 6,3% образцов крови от пациентов с признаками инфекции и в 42,4% образцов смывов c объектов внутрибольничной среды. Результаты ПЦР-исследования образцов смывов показали, что ДНК метициллинрезистентных коагулазонегативных стафилококков обнаруживалась гораздо чаще, чем ДНК MRSA (p < 0,001). ДНК метициллинрезистентных стафилококков выявляли чаще в отделениях реанимации и интенсивной терапии по сравнению с отделением гематологии и хирургическими отделениями (p<0,001). Изученные изоляты Staphylococcus aureus относились к 6 различным сиквенс-типам (ST-5, ST-7, ST-8, ST-22, ST-30 и ST-5555) и 8 spa-типам (t008, t021, t091, t1062, t12437, t1544, t223, t4573). В результате мониторинга обнаружен изолят с новым аллельным профилем. На сегодня ему присвоен номер ST5555. Преобладающим типом стафилококковой кассеты mec была SCCmec-кассета IV типа.

Заключение. В связи с широким распространением метициллинрезистентных штаммов и выявлением эпидемиологически значимых генетических линий стафилококков важно проведение регулярного мониторинга с использованием современных молекулярно-биологических методов для их для быстрой и точной идентификации.

Об авторах

Т. С. Скачкова
ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Татьяна Сергеевна Скачкова – научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии

111123, Россия, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а.



М. Н. Замятин
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия

Михаил Николаевич Замятин – доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой анестезиологии и реаниматологии

Москва



О. А. Орлова
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России; ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Оксана Анатольевна Орлова – доктор медицинских наук, начальник отдела эпидемиологии, врач-эпидемиолог НМХЦ им. Н. И. Пирогова; ведущий научный сотрудник лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, ЦНИИ эпидемиологии

Москва



Н. А. Юмцунова
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия

Наталья Александровна Юмцунова – помощник врача-эпидемиолога

Москва



Н. Н. Лашенкова
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия

Наталья Николаевна Лашенкова – врач-бактериолог бактериологической лаборатории

Москва



В. С. Фомина
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия

Валерия Сергеевна Фомина – кандидат медицинских наук, начальник службы клинической лабораторной диагностики

Москва



В. Г. Гусаров
ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия

Виталий Геннадьевич Гусаров – кандидат медицинских наук, заведующий отделением анестезиологии-реанимации (интенсивной терапии)

Москва



А. А. Шеленков
ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Андрей Александрович Шеленков – старший научный сотрудник лаборатории молекулярных механизмов антибиотикорезистентности

111123, Россия, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а



Ю. В. Михайлова
ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Юлия Владимировна Михайлова – заведующая лабораторией молекулярных механизмов антибиотикорезистентности

111123, Россия, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а



Е. н. Головешкина
ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Елена Николаевна Головешкина – кандидат биологических наук, заведующая лабораторией молекулярной диагностики и эпидемиологии инфекций органов репродукции

111123, Россия, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а



В. Г. Акимкин
ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Василий Геннадьевич Акимкин – академик РАН, доктор медицинских наук, профессор, директор

111123, Россия, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а



Список литературы

1. Yahav D., Shaked H., Goldberg E., et al. Time trends in Staphylococcus aureus bacteremia, 1988–2010, in a tertiary center with high methicillin resistance rates //Infection. 2017. 45. P. 51–57.

2. Olearo F., Albrich W.C., Vernaz N., et al. Staphylococcus aureus and methicillin resistance in Switzerland: regional differences and trends from 2004 to 2014 //Swiss Med Wkly. 2016. Sep 15; 146:w14339. eCollection 2016.

3. Jaganath D., Jorakate P., Makprasert S., et al. Staphylococcus aureus Bacteremia Incidence and Methicillin Resistance in Rural Thailand, 2006–2014. //The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. 2018. Vol. 99, Issue 1. P. 155–163.

4. Хохлова О.Е., Перьянова О.В., Боброва О.П. и др. Молекулярно-генетические особенности метициллин-резистентных Staphylococcus aureus (MRSA) – возбудителей гнойно-воспалительных заболеваний у онкологических больных. //Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии (ЖМЭИ). 2017. 6. C.15–20.

5. Романов А.В., Дехнич А.В., Сухорукова М.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» в 2013–2014. //КМАХ. 2017. № 1.

6. Дехнич А. Терапия нозокомиальных стафилококковых инфекций в России – время менять стереотипы. //Врач. 2010. 10. C. 18–22.

7. Кузьменков А. Ю., Трушин И. В., Авраменко А. А. и др. AMRmap: интернет-платформа мониторинга антибиотикорезистентности. //Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017. Т.19, №2. С. 84–90.

8. Zankari E., Hasman H., Cosentino S., et al. Identification of acquired antimicrobial resistance genes. //J Antimicrob Chemother. 2012. 67, 11. P. 2640–2644.

9. Carattoli A., Zankari E., Garcia-Fernandez A., et al. PlasmidFinder and pMLST: in silico detection and typing of plasmids. //Antimicrob Agents Chemother. 2014. 58, 7. P:3895–903.

10. Bartels M.D., Petersen A., Worning P., et al. Comparing whole-genome sequencing with Sanger sequencing for spa typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. //J. Clin. Microbiol. 2014. 52, 12. P.4305–8.

11. Романов А. В., Дехнич А. В., Эйдельштейн М. В. Молекулярная эпидемиология штаммов Staphylococcus aureus в детских стационарах России //КМАХ. 2012. №3. – С.201–208.

12. Афанасьев М. В., Каракашев С. В., Ильина Е. Н., и др. Молекулярно-генетическая характеристика метициллинустойчивых штаммов Staphylococcus aureus, выделенных в стационарах Москвы. //Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2010.2.С.20–24.

13. Ishitobi N., Wan T.W., Khokhlova O.E., et al. Fatal case of ST8/SCCmecIVl community‐associated methicillin‐resistant Staphylococcus aureus infection in Japan. New Microbes New Infect. 2018. 26. P. 30–6.

14. Morgan M.S. Diagnosis and treatment of Panton–Valentine leukocidin (PVL)-associated staphylococcal pneumonia. //International Journal of Antimicrobial Agents. 2007. Vol. 30, №4. P. 289–296.

15. Labandeira-Rey M., Couzon F., Boisset S. Staphylococcus aureus Panton-Valentine Leukocidin Causes Necrotizing Pneumonia //Science 23. 2007. Р 1130–1133.


Для цитирования:


Скачкова Т.С., Замятин М.Н., Орлова О.А., Юмцунова Н.А., Лашенкова Н.Н., Фомина В.С., Гусаров В.Г., Шеленков А.А., Михайлова Ю.В., Головешкина Е.н., Акимкин В.Г. Мониторинг метициллинрезистентных штаммов стафилококка в многопрофильном стационаре Москвы с помощью молекулярно-биологических методов. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021;20(1):44-50. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-1-44-50

For citation:


Skachkova T.S., Zamyatin M.N., Orlova O.A., Yumtsunova N.A., Lashenkova N.N., Fomina V.S., Gusarov V.G., Mikhaylova Y.V., Shelenkov Yu.A., Goloveshkina E.N., Akimkin V.G. Monitoring Methicillin-Resistant Staphylococcus Strains in the Moscow Medical and Surgical Center using Molecular-Biological Methods. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2021;20(1):44-50. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-1-44-50

Просмотров: 222


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-3046 (Print)
ISSN 2619-0494 (Online)