Preview

Эпидемиология и Вакцинопрофилактика

Расширенный поиск

Особенности микробиоценозов различных биотопов у женщин как потенциальный фактор риска невынашивания беременности

https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-5-107-114

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. Невынашивание беременности представляет собой одну из наиболее распространенных акушерских патологий, определяющих гибель плода при спонтанном выкидыше. В числе активно изучаемых факторов риска данного состояния рассматривается роль изменений микробиома различных биотопов.

Цель. Определить структуру микробиоценозов влагалища и кишечника и их роль в развитии самопроизвольных выкидышей у женщин на ранних сроках беременности.

Материалы и методы. Проведено исследование «случай-контроль», включившее 23 женщины с самопроизвольным выкидышем на 5–14-й неделе беременности и 23 женщины с нормально протекающей беременностью. Данные метагеномного секвенирования V3– V4 участков гена 16SрРНК использованы для сравнительной оценки структуры микробиома влагалища и кишечника в данных группах.

Результаты и обсуждение. В ходе выполнения исследования выявлен ряд таксономических групп микроорганизмов, характеризующих особенности состава микробиома влагалища и кишечника женщин с невынашиванием беременности. Установлено, что снижение доли Lactobacillus spp. в структуре микробиома влагалища до уровня менее 90% от общего числа выявленных таксонов ассоциировано с данной патологией (OR = 5,28, 95% ДИ = 1,2–23,2). Кишечные микробиоценозы женщин со спонтанным выкидышем характеризуются меньшим таксономическим разнообразием, чем микробиом кишечника у женщин с прогрессирующей беременностью. При этом некоторые представители кишечного микробиома (Akkermansia sp., Faecalibacterium sp., Bifidobacterium sp., Methanobrevibacter sp., Lactococcus sp.) преобладают у женщин с прогрессированием беременности.

Заключение. Проведенное исследование продемонстрировало связь изменений микробиоценозов репродуктивного тракта и кишечника с невынашиванием беременности. Отмечается потенциально протективная функция лактобацилл. Полученные данные обосновывают необходимость активного использования молекулярно-генетических методов, направленных на оценку структуры кишечного и вагинального микробиома при оценке рисков возникновения репродуктивных неудач.

Об авторах

А. Е. Гончаров
ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»;ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России;ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет»
Россия

Гончаров Артемий Евгеньевич  – к. м. н., доцент, заведующий лабораторией функциональной геномики и  протеомики микроорганизмов; заведующий лабораторией инновационных методов микробиологического мониторинга НОЦ «Молекулярные основы взаимодействия микроорганизмов и человека»; профессор кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии;  доцент
кафедры фундаментальных проблем медицины и  медицинских технологий

197376, Санкт-Петербург, ул. Академика Павлова, 12; 191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41; 199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., д. 7–9

+7(812)234-05-42



С. В. Рищук
ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России
Россия

Рищук Сергей Владимирович  – к. м. н., профессор кафедры акушерства и гинекологии

191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41

 



Б. И. Асланов
ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России
Россия

Асланов Батырбек Исмелович – к. м. н., доцент, профессор кафедры эпидемиологии, паразитологии и  дезинфектологии

191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41.

+7 (812)543-13-21



Е. А. Лебедева
ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России; ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»
Россия

Лебедева Екатерина Андреевна  – ассистент кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии; научный сотрудник лаборатории инновационных методов микробиологического мониторинга

191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41; 197376, Санкт-Петербург, ул. Академика Павлова, 12.

+7 (812)544-22-94



Д. В. Азаров
ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России; ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»
Россия

Азаров Даниил Валерьевич – к. м. н., ассистент кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии;  научный сотрудник лаборатории инновационных методов микробиологического мониторинга

191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41; 197376,
Санкт-Петербург, ул. Академика Павлова, 12.

+7 (812)544-22-94



A. С. Мохов
СПб ГБУЗ «Городская Мариинская больница»; ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России; ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»
Россия

Мохов Алексей Сергеевич  – врач-бактериолог; аспирант кафедры эпидемиологии, паразитологии и  дезинфектологии; научный сотрудник лаборатории инновационных методов микробиологического мониторинга

191014, Санкт-Петербург, Литейный пр., 56.; 191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41; 197376, Санкт-Петербург, ул. Ака- демика Павлова 12.

+7 (981)813-02-56



Ю. А. Артемова
СПб ГБУЗ «Городская поликлиника № 17»
Россия

Артемова Юлия Александровна – заведующая женской консультаци- ей №9, врач акушер-гинеколог

195176, Санкт-Петербург, пр. Металлистов д.56

+7 (952)266-48-52



М. В. Таболкина
СПб ГБУЗ «Городская поликлиника № 44»
Россия

Таболкина Мария Вячеславовна  – заведующая женской консультацией № 19

192071, Санкт-Петербург, ул. Будапештская д.20.

+7 (911)938-38-30



А. А. Мельцер
СПб ГБУЗ «Городская Мариинская больница»
Россия

Мельцер Александра Анатольевна  – врач-бактериолог

191014, Санкт-Петербург, Литейный пр., 56

+7 (921)397-73-32

 



Т. В. Осьмирко
ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава России
Россия

Осьмирко Татьяна Владимировна – к. м. н., доцент кафедры эпидеми- ологии, паразитологии и дезинфектологии 

191015, Санкт-Петербург, ул.  Кирочная, д. 41

+7 (921)6407791



А. В. Тушина
СПб ГБУЗ «Городская больница Святого Великомученика Георгия»
Россия

Тушина Анастасия Викторовна  – врач акушер-гинеколог

194354, Санкт-Петербург, Северный проспект д.1

8(921)776-81-41



Список литературы

1. Wang X, Chen C, Wang L, et al. Conception, early pregnancy loss, and time to clinical pregnancy: a population-based prospective study. Fertil Steril. 2003;79(3):577-84. https://doi:10.1016/s0015-0282 (02) 04694-0.

2. Larsen EC, Christiansen OB, Kolte AM, et al. New insights into mechanisms behind miscarriage. BMC Med. 2013;11:154-65. https://doi: 10.1186/1741-7015-11-154.

3. Hillier SL, Nugent RP, Eschenbach DA, et al. Association between bacterial vaginosis and preterm delivery of a low-birth-weight infant. The Vaginal Infections and Prematurity Study Group. N Engl J Med. 1995; 333(26):1737-1742. https://doi: 10.1056/NEJM199512283332604.

4. Moore DE, Soules MR, Klein NA, et al. Bacteria in the transfer catheter tip influence the live-birth rate after in vitro fertilization. Fertil Steril. 2000;74(6):1118-1124. https://doi:10.1016/S0015- 0282(00)01624-1.

5. Hyman RW, Herndon CN, Jiang H, et al. The dynamics of the vaginal microbiome during infertility therapy with in vitro fertilization-embryo transfer. J Assist Reprod Genet. 2012; 29(2):105-115. https:// doi:10.1007 /s10815-011-9694-6.

6. Hyman RW, Fukushima M, Jiang H, et al. Diversity of the vaginal microbiome correlates with preterm birth. Reprod Sci. 2014; 21(1):32-40. https://doi:10,1177 / 1933719113488838.

7. Sobel JD. Vaginitis. N Engl J Med. 1997;337(26):1896-1903. https://doi:10.1056/NEJM199712253372607.

8. Cicinelli E, Matteo M, Tinelli R, et al. Chronic endometritis due to common bacteria is prevalent in women with recurrent miscarriage as confirmed by improved pregnancy outcome after antibiotic treat- ment. Reprod Sci. 2014; 21(5):640-647. https://doi:10.1177/1933719113508817.

9. Gevers D, Knight R, Petrosino JF, et al. The Human Microbiome Project: a community resource for the healthy human microbiome. PLoS Biol. 2012; 10(8):e1001377. https://doi:10.1371/journal. pbio.1001377.

10. Lloyd-Price J., Abu-Ali G., Huttenhower C. The healthy human microbiome. Genome medicine. 2016;8(1):1-11. https://doi:10.1186/s13073-016-0307-y

11. Anderson G. Endometriosis pathoetiology and pathophysiology: roles of vitamin A, estrogen, immunity, adipocytes, gut microbiome and melatonergic pathway on mitochondria regulation. Biomolecular concepts. 2019;10(1): 133-149. https://doi:10.1515/bmc-2019-0017.

12. Magoč T., Salzberg S. L. FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies. Bioinformatics. 2011;27(21):2957-2963. https://doi:10.1093/bioinformatics/btr507.

13. Bolyen E, Rideout JR, Dillon MR, et al. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nat Biotechnol. 2019;37(8):852-857. https://doi:10.1038/s41587-019-0209-9.

14. Callahan BJ, McMurdie PJ, Rosen MJ, et al. DADA2: high‐resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nat Methods. 2016;13:581‐583. https://doi:10.1038/nmeth.3869.

15. .

16. Bokulich NA, Kaehler BD, Rideout JR, Dillon M, Bolyen E, Knight R, et al. Optimizing taxonomic classification of marker-gene amplicon sequences with QIIME 2’s q2-feature-classifier plugin. Microbiome. 2018; 6(1):1-17. https://doi:10.1186/s40168-018-0470-z.

17. McDonald D, Price MN, Goodrich J, et al. An improved Greengenes taxonomy with explicit ranks for ecological and evolutionary analyses of bacteria and archaea. ISME J. 2012;6: 610‐618. https:// doi:10.1038/ismej.2011.139.

18. Faith DP. Conservation evaluation and phylogenetic diversity. Biol Cons. 1992;61:1‐10. https://doi:10.1016/0006-3207(92)91201-3.

19. Ravel J, Gajer P, Abdo Z, et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011;108:4680–4687. https://doi:10.1073/pnas.1002611107.

20. Spear GT, French AL, Gilbert D, et al. Human alpha‐amylase present in lower‐genital‐tract mucosal fluid processes glycogen to support vaginal colonization by Lactobacillus. J Infect Dis. 2014; 210(7):1019–1028. https://doi:10.1093/infdis/ jiu231.

21. Smith S. B., Ravel J. The vaginal microbiota, host defence and reproductive physiology. The Journal of physiology. 2017; 595(2):451-463. https://doi:10.1113/JP271694.

22. Wira CR, Fahey JV, Sentman CL, et al. Innate and adaptive immunity in female genital tract: cellular responses and interactions. Immunol Rev. 2005; 206(1):306–335. https://doi:10.1111/j.0105- 2896.2005.00287.x.

23. Petricevic L, Domig KJ, Nierscher FJ, et al. Characterisation of the vaginal Lactobacillus microbiota associated with preterm delivery. Sci Rep. 2014;4(1):1-6. https://doi:10.1038/srep05136.

24. Santacruz A, Collado MC, Garcia-Valdes L, et al. Gut microbiota composition is associated with body weight, weight gain and biochemical parameters in pregnant women. The British Journal of Nutrition. 2010;104(1):83-92. https://doi:10.1017 / S0007114510000176.

25. Cani PD, Osto M, Geurts L, et al. Involvement of gut microbiota in the development of low-grade inflammation and type 2 diabetes associated with obesity. Gut Microbes. 2012;3(4):279-288. https:// doi:10.4161/gmic.19625.

26. Koren O, Goodrich JK, Cullender TC, et al. Host remodeling of the gut microbiome and metabolic changes during pregnancy. Cell. 2012;150(3):470-80. https://doi: 10.1016/j.cell.2012.07.008.


Для цитирования:


Гончаров А.Е., Рищук С.В., Асланов Б.И., Лебедева Е.А., Азаров Д.В., Мохов A.С., Артемова Ю.А., Таболкина М.В., Мельцер А.А., Осьмирко Т.В., Тушина А.В. Особенности микробиоценозов различных биотопов у женщин как потенциальный фактор риска невынашивания беременности. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021;20(5):107-114. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-5-107-114

For citation:


Goncharov A.E., Rischuk S.V., Aslanov B.I., Lebedeva E.A., Azarov D.V., Mokhov A.S., Artemova Yu.A., Tabolkina M.V., Meltser A.A., Osmirko T.V., Tushina A.V. Features of Microbiocenoses of Various Biotopes in Women as Potential Miscarriage Risk Factor. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2021;20(5):107-114. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-5-107-114

Просмотров: 108


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-3046 (Print)
ISSN 2619-0494 (Online)