Изменения структуры генов антибиотикорезистентности штаммов семейства Enterobacteriaceae, выделенных от пациентов перинатального центра III уровня в ходе многолетнего мониторинга

Актуальность. Проблема устойчивости к антибактериальным препаратам является одной из главных для здравоохранения Российской Федерации и других стран. В настоящее время отмечается рост числа антибиотикорезистентных штаммов как среди возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, так и среди представителей микробиоценоза нестерильных локусов человеческого организма.

Цель. Анализ изменения структуры генетических детерминант антибиотикорезистентности БЛРС-продуцирующих представителей семейства Enterobacteriaceae, выделенных от пациентов перинатального центра в ходе шестилетнего мониторинга.

Материалы и методы. Генетический профиль антибиотикорезистентности определяли у БЛРС-продуцирующих штаммов энтеробактерий, выделенных из образцов биологического материала, полученного от 221 женщины и 241 новорожденного ребенка, госпитализированных в отделения ФГБУ «НИИ ОММ» Минздрава России с 2019 по 2024 гг. включительно. ДНК бактериальных клеток выделяли из суточной культуры микроорганизмов с использованием набора «ПРОБА-НК», детекцию генов blaTEM, blaCTX-М -1, blaSHV; blaOXA-40-LIKE, blaOXA-48-LIKE, blaОXA-23-LIKE, blaOXA-51-LIKE, blaIMP, blaKPS, blaNDM осуществляли с применением диагностического набора «БакРезиста GLA» на детектирующем амплификаторе ДТ-48 (ДНК-технология, Россия). Для оценки статистической значимости различий частоты встречаемости генов использовали критерий х2 Пирсона с поправкой Йейтса.

Результаты и обсуждение. Количество геновариантов антибиотикорезистентности энтеробактерий, выделенных от пациенток отделений акушерско-гинекологического профиля с 2019 по 2024 гг. наблюдения, так же, как и у детей, возросло с 3 до 7. В 2019 г. детектировано 3 геноварианта, в 2020 г. - 4, в 2021 г. - 6 геновариантов. В последующие три года (2022–2024 гг.) спектр детерминант антибиотикорезистентности был представлен 7 геновариантами, их структура претерпевала изменения. В 2019 г. с одинаковой частотой (30%) преобладали гены blaCTX-М и blaSHV. В 2020 г. чаще был выделен геновариант blaCTX-М + blaTEM (37,5 %). В 2021, 2022 и 2024 гг. доминировали штаммы с геном blaCTX-М, зарегистрированные в 59,5 %, 37,7 %, 36,9 % случаев соответственно. В 2023 г. частота выделения гена blaCTX-М (27,1%) была сопоставима с частотой встречаемости геноварианта blaCTX-М + blaTEM (30 %) (р = 0,852). Доминирующим геном, обеспечивающим устойчивость к бета-лактамным антибиотикам среди представителей энтеробактерий в течение всего периода наблюдения, является blaCTX-М, который обнаруживается как в моноварианте, так и в сочетании с другими генами blaTEM, blaSHV, blaNDM.

Заключение. Динамика изменения структуры геновариантов антибиотикорезистентности и преобладание того или иного вида бактерий может отличаться в отделениях различного профиля, что требует непрерывного мониторирования спектра видового разнообразия бактерий и их антибиотикочувствительности для своевременной фиксации ухудшения эпидемиологической ситуации и принятия адекватных противоэпидемических мер.

1. Козлов Р. С., Кузьменков А. Ю., Виноградова А. Г. Антибиотикорезистентность как медицинская проблем. Вестник Российской академии наук. – 2024. Т. 94. № 1. С. 11–18. – DOI 10.31857/S0869587324010033.

2. Jian X., Li Y., Wang H., et al. A comparative study of genotyping and antimicrobial resistance between carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae and Acinetobacter baumannii isolates at a tertiary pediatric hospital in China. Front Cell Infect Microbiol. 2024 Mar 8;14:1298202. doi: 10.3389/fcimb.2024.1298202.

3. Тутельян А. В., Шлыкова Д. С., Восканян Ш. Л. и др. Молекулярная эпидемиология гипервирулентной K. pneumoniae и проблемы инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. – 2021. Т. 172. № 11. С. 532–551. – DOI 10.47056/0365-9615-2021-172-11-532-551.

4. Садеева З. З., Новикова И. Е., ЛазареваА. В. и др. Бактериемии и инфекции ЦНС у детей, ассоциированные с Klebsiella pneumoniae: молекулярно-генетическая характеристика и клинические особенности. Инфекция и иммунитет. – 2023. Т. 13. № 6. С. 1117–1128. – DOI 10.15789/2220-7619-PBA-14482.

5. Акимкин В. Г. Национальная система микробиологического мониторинга микроорганизмов, устойчивых к противомикробным препаратам / В. Г. Акимкин // Вестник Российской академии наук. – 2024. Т. 94. № 1. С. 4–10. – DOI 10.31857/S0869587324010026.

6. Амелин И. М., Никитина И. В., Гордеев А. Б. Диагностика, терапия и профилактика неонатальных инфекций, вызванных условно-патогенными микроорганизмами с множественной лекарственной устойчивостью: исторический аспект и современные представления и др. Акушерство и гинекология. – 2024. № 7. С. 48–57. – DOI 10.18565/aig.2024.115.

7. Косякова К. Г., Эсауленко Н. Б., Каменева О. А. и др. Распространенность генов карбапенемаз, qacE, qacEΔ1 и cepA у множественно-резистентных грамотрицательных бактерий с различной чувствительностью к хлоргексидину. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2020;19(5):49–60. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2020-19-5-49-60.

8. Скачкова Т. С., Князева Е. В., Головешкина Е. Н. и др. Распространенность генетических детерминант антибиотикорезистентности, имеющих особое эпидемиологическое значение, в микробиоте мазков со слизистой оболочки ротоглотки больных муковисцидозом. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2023;22(4): 44–48 https://doi:10.31631/2073-3046-2023-22-4-44-48.

9. Колоусова К. А., Шипицына Е. В., Шалепо К. В. и др. Факторы вирулентности и патогенности штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных и новорожденных. Журнал акушерства и женских болезней. – 2021. Т. 70. № 5. С. 15–22. – DOI 10.17816/JOWD75671.

10. Петровская Т. А., Карпова Е. В., Тапальский Д.В. и др. Молекулярно-генетические механизмы устойчивости нозокомиальных штаммов Klebsiella pneumoniae к полимиксинам и антибиотикам других групп по данным полногеномного секвенирования. Вестник Витебского государственного медицинского университета. – 2021. Т. 20. № 5. С. 34–41. – DOI 10.22263/2312-4156.2021.5.34.

11. Ojeda A., Akinsuyi O., McKinley K.L., et al. Increased antibiotic resistance in preterm neonates under early antibiotic use. mSphere. 2024 Oct 29;9(10):e0028624. doi: 10.1128/msphere.00286-24.

12. Любимова А. В., Светличная Ю. С., Дарьина М. Г. Антибиотикорезистентность возбудителей, выделенных от пациентов детских больниц и родильных домов при поступлении в стационар Профилактическая и клиническая медицина. – 2024. № 2(91). С. 55–66.

13. Алексеева А. Е., Бруснигина Н. Ф., Гординская Н. А. Молекулярно-генетическая характеристика резистома и вирулома карбапенем-устойчивых клинических штаммов Klebsiella pneumoniae и др. Клиническая лабораторная диагностика. – 2022. Т. 67. № 3. С. 186–192. – DOI 10.51620/0869-2084-2022-67-3-186-192.

14. Устюжанин А. В., Чистякова Г. Н., Ремизова И. И. и др. Анализ генетических детерминант антибиотикорезистентности blaCTX-M, blaNDM и blaOXA-48, выделенных из штаммов, входящих в группу ESKAPE. Бактериология. – 2024. Т. 9. № 1. С. 81–86. – DOI 10.20953/2500-1027-2024-1-81-86.

15. Yang Q., Zhang M., Tu Z., et al. Department-specific patterns of bacterial communities and antibiotic resistance in hospital indoor environments. Appl Microbiol Biotechnol. 2024 Oct 16;108(1):487. doi: 10.1007/s00253-024-13326-9.

16. . Wang Y.C., Jiang T.M., Mo L., et al. Distribution of Antibiotic-Resistant Genes in Intestines of Infants and Influencing Factors. Crit Rev Eukaryot Gene Expr. 2024;34(8):59–73. DOI: 10.1615/CritRevEukaryotGeneExpr.v34.i8.60.

17. Самойлова А.А., Краева Л.А., Михайлов Н.В., и др. Геномный анализ вирулентности и антибиотикорезистентности штаммов Klebsiella pneumoniae Инфекция и иммунитет. – 2024. Т. 14. №2. C. 339–350. doi: 10.15789/2220-7619-GAO-15645

18. Ивушкина Л. В., Миронов А. Ю. Микробиологический мониторинг Klebsiella pneumoniae и механизмы их резистентности к антимикробным препаратам у больных туберкулезом г. Москвы. Клиническая лабораторная диагностика. – 2024. Т. 69. № 4. С. 131–141. – DOI 10.51620/0869-2084-2024-69-4-131-141.