Актуальность. Современная эпидемиологическая ситуация в мире характеризуется высокой напряженностью, обусловленной сочетанием новых биологических вызовов и сохраняющихся традиционных угроз, что диктует необходимость разработки и имплементации инновационных подходов к реализации эпидемиологического надзора и прогнозированию развития эпидемического процесса инфекций, вызываемых известными и потенциальными возбудителями. Цель. Обоснование стратегии проактивной оценки эпидемиологических рисков на основе геномного эпидемиологического надзора для повышения эффективности предупреждения эпидемий и оптимизации противоэпидемических мер. Заключение. Современная парадигма прогностического эпидемиологического анализа опирается на объединение данных о геноме возбудителя с оценкой его эволюционного потенциала и эпигенетическом ответе организма хозяина, являющегося универсальным ранним маркером инфицирования, в том числе неизвестными ранее патогенами. Интеграция этих данных с цифровыми платформами позволяет реализовывать системный, многоуровневый геномный эпидемиологический надзор, который направлен на предупреждение возможных эпидемий и пандемий, а также разработку и оптимизацию противоэпидемических стратегий в системе общественного здравоохранения.

Актуальность. Агентный подход к моделированию широко востребован в самых разных областях науки, в т.ч. при изучении закономерностей распространения инфекционных болезней. Цель. Разработка русскоязычной адаптированной версии протокола «ODD» для совершенствования качества описания результатов агентного моделирования в эпидемиологических исследованиях. Материалы и методы. Использована оригинальная методологическая разработка группы авторов на английском языке «Overview, Design concept, Details», или ODD. При подготовке адаптированной версии протокола ODD были определены основополагающие пользовательские моменты. Согласованность экспертных оценок определяли путем расчет коэффициента каппа согласно методике Флейсса. Статистический анализ проводили в среде R 4.3.2 (RStudio). Результаты и обсуждение. Предложена русскоязычная версия ODD, предназначенная для полноценного описания процесса разработки модели и результатов моделирования для использования в медико-биологических исследованиях. В статье особое внимание уделено разделу «Концепции дизайна». Рекомендации, изложенные в нем, позволяют обосновать дизайн модели, сделать ее представление менее произвольным и более научным. В русскоязычной версии ODD содержатся все 11 понятий, касающихся дизайна, с кратким описанием их назначения и контрольным списком вопросов, на которые следует обратить внимание. К элементам дизайна отнесены: базовые принципы, возникновение новых результатов, адаптация, цели, обучение, прогнозирование, восприятие, взаимодействие агентов, стохастичность процессов, наблюдение. Дается характеристика отчета по рекомендациям ODD как в полном, так и сокращенном виде. В последнем случае читателю предлагается ознакомиться с кратким текстовым шаблоном оформления рукописи. Заключение. Используя протокол ODD, исследователь сможет полноценно описать агентную модель в целом, а также отразить те ее важные характеристики, которые не всегда легко представить математическими уравнениями и блок-схемами.

Актуальность. Исследования по разработке новых, более совершенных вакцин против COVID-19, как на основе современных технологий, так и традиционных инактивированных, по-прежнему остаются актуальными. В «48 ЦНИИ» Министерства обороны Российской федерации совместно с Филиалом Р-фарм Ярославского завода готовых лекарственных форм была разработана культуральная (в культуре клеток Vero (B)) инактивированная бета-пропиолактоном хроматографически очищенная вакцина от коронавирусной инфекции COVID-19. Цель. Оценить результаты доклинических исследований по иммуногенности и эффективности инактивированной культуральной очищенной вакцины от коронавирусной инфекции COVID-19 в экспериментах на животных. Материалы и методы. Оценили, в том числе в сравнении с Гам-КОВИД-Вак, иммуногенность и протективную активность экспериментальных образцов вакцины с адъювантами гидроокись алюминия и CpG 1018 после двукратной иммунизации сирийских хомячков с интервалом 21 сутки при интраназальном заражении их вирулентным вирусом SARS-CoV-2 в дозе 105 БОЕ/особь. В эксперименте на обезьянах оценили влияние вакцины при двукратной иммунизации на гуморальный – титр вируснейтрализующих антител (ВНА) – и показатели клеточного иммунитета в течение года. Результаты и обсуждение. Выбрана оптимальная доза вакцины – 15 мкг белка и определен состав входящих в нее адъювантов: 500 мкг гидроокиси алюминия и 10 мкг синтетического олигодезоксинуклеотида CpG 1018. Инактивированная сорбированная вакцина от коронавирусной инфекции COVID-19 при двукратном введении с интервалом 21 сутки индуцирует у 80–100 % сирийских хомячков образование вируснейтрализующих антител в титрах 1:20 и более через 21 сутки после завершения цикла иммунизации и характеризуется индексом защиты легких ≥ 3,2 lg на 6-е сутки после инфицирования 105 БОЕ вирулентного вируса (геновариант «Дельта»). При двукратном введении вакцина индуцировала образование специфических вируснейтрализующи антител у макак-резус как к геноварианту «Дельта», так и к геноварианту «Омикрон» вируса SARS-CoV-2, которые сохраняются у 100 % вакцинированных животных в течение 180 суток. К 42-м суткам после завершения вакцинации происходит увеличение цитотоксических Т-лимфоцитов и снижение общих В-лимфоцитов. Выводы. Инактивированная сорбированная очищенная вакцина от коронавирусной инфекции COVID-19 при двукратном введении с интервалом 21 сутки иммуногенна для сирийских хомячков и защищает их от интраназального заражения 105 БОЕ вирулентного вируса. Вакцина обладает иммуногенными свойствами как к геноварианту «Дельта», так и к геноварианту «Омикрон» вируса SARS-CoV-2.

Актуальность. Вирус краснухи обычно ассоциируется с легкой инфекцией, однако, если он передается во время беременности, это может привести к серьезным последствиям, включая синдром врожденной краснухи (CRS). У людей с хронической болезнью почек (ХБП, CKD англ.) часто ослаблена иммунная система, что затрудняет им борьбу с краснухой или делает вакцинацию малоэффективной. Определение количества антител к краснухе у этих пациентов может помочь в разработке более эффективных профилактических стратегий. Цель. Оценить и сравнить уровень антител к вирусу краснухи (IgM и IgG) у пациентов с ХБП и здоровых лиц контрольной группы. Материалы и методы. Был разработан план исследования «случай-контроль», в котором приняли участие 180 пациентов с ХБП и 180 практически здоровых людей, образцы сыворотки крови которых были проанализированы на наличие специфичных к краснухе антител IgM и IgG с помощью иммуноферментного анализа (ELISA). Результаты. IgM к краснухе был обнаружен у 81 из 180 пациентов контрольной группы и у 65 из 180 пациентов с ХБП. IgG к краснухе был выявлены у всех участников (360 из 360, 100%). Средняя концентрация IgG была достоверно выше у пациентов с ХБП (456,82 ± 144,90 МЕ/мл), чем в контрольной группе (169,45 ± 117,52 МЕ/мл; t = 20,666, p < 0,001). Вывод. Как в группе пациентов с ХБП, так и в контрольной группы по результатам теста были определено присутствие IgG краснухи. При этом у пациентов с ХБП при более низком уровне IgM, средние титры IgG были значительно выше, что может указывать как на встречу с вирусом краснухи, так и относительно недавней иммунизацией. Эти данные требуют дополнительного тестирования и тщательной интерпретации иммунитета к краснухе у пациентов с хронической болезнью почек.

Актуальность. Вариабельность индивидуального иммунного ответа на вакцинацию может быть связана не только с особенностями иммуногенеза, но и с психоэмоциональными факторами. При этом влияние психоэмоциональных факторов на формирование поствакцинального иммунитета в настоящее время изучено недостаточно. Цель. Оценить влияние психо­ эмоциональных факторов (ситуативной и личностной тревожности, информированности о вакцинации) на иммунный ответ после вакцинации. Материалы и методы. В исследование были включены 248 добровольцев, участвовавших в клинических испытаниях вакцины для профилактики COVID-19, в возрасте от 18 до 60 лет. Все они прошли анкетирование для оценки психоэмоционального состояния и анализа уровня осведомленности в вопросах вакцинопрофилактики. Уровень тревожности определяли стандартизированным опросником State-Trait Anxiety Inventory (STAI) в адаптации Ч. Д. Спилбергера. Была проведена оценка напряженности гуморального иммунитета до и после вакцинации с помощью иммуноферментного анализа. Все данные обрабатывались в закодированном виде с использованием криптографического протокола V1 для обеспечения сохранения слепоты исследования. Передача промежуточных данных осуществлялась в соответствии с утвержденной формой, предусмотренной в протоколе клинического исследования. Результаты. Увеличение уровня антител в 4 и более раз отмечалось у 90 % добровольцев с исходно низким уровнем ситуативной тревожности, в то время как у 100 % добровольцев с высоким уровнем ситуативной тревожности увеличения титра антител не было. Факторный анализ определил две компоненты, влияющие на поствакцинальный гуморальный иммунитет: 1 – «Тревожность», которая включала в себя личностную тревожность и ситуативную тревожность до и после вакцинации (психоэмоциональные детерминанты); 2 – «Иммунно-возрастной профиль», которая включала в себя возраст и уровень титра антител на момент вакцинации (биологические детерминанты). Общий накопленный вклад двух компонент в суммарную дисперсию составил 59,7 %. Прирост антител имел отрицательную корреляционную связь с возрастом и исходным уровнем антител (τ = -0,267; p < 0,00; 95% ДИ [-0,379;-0,141]; n = 156), в то время как уровень тревожности имел отрицательную корреляционную связь со степенью информированности о вакцинации (τ = -0,212; p < 0,001; 95% ДИ[-0,324; -0,095]; n = 156). Заключение. Повышенный уровень ситуативной тревожности в момент вакцинации является фактором риска снижения поствакцинального гуморального иммунного ответа. Разработана прогностическая модель для оценки этого риска, в которой изменяемым параметром выступает информированность пациента. Целевое повышение уровня информированности о вакцинопрофилактике представляет собой практический инструмент персонализированного подхода, направленный на снижение тревожности и повышение эффективности вакцинации. В перспективе реализация такого подхода позволит увеличить не только приверженность иммунизации, но и улучшить популяционные показатели иммунопрофилактики.

Актуальность. Ротавирусная инфекция в настоящее время сохраняет свою эпидемиологическую и экономическую значимость. Цель. Оценить профилактическую эффективность применения ротавирусной вакцины при вакцинации детей раннего возраста. Материалы и методы. В статье представлен сравнительный анализ заболеваемости ротавирусным энтеритом среди детей раннего возраста муниципального округа «город Березники» в периоды до начала вакцинации (2010–2018 гг.) и проведения иммунизации детей первого года жизни в рамках реализации регионального календаря профилактических прививок (2019–2024 гг.). Территорией сравнения явился Кудымкарский муниципальный округ, где вакцинация детей первого года жизни не проводилась. Результаты и обсуждение. Полученные результаты демонстрируют достоверное снижение уровня заболеваемости ротавирусным энтеритом среди детей первого года жизни муниципального округа «город Березники» в период проведения вакцинации, по сравнению с довакцинальным, и отсутствие серьезных и несерьезных побочных проявлений после иммунизации, что подтверждает высокую профилактическую эффективность и безопасность вакцинопрофилактики ротавирусного энтерита. Заключение. Полученные данные свидетельствуют о необходимости введения вакцинации детей первого года жизни против ротавирусной инфекции как наиболее эффективного инструмента в снижении заболеваемости. Конфликт интересов не заявлен.

Актуальность. В условиях современных биологических рисков существующая система эпидемиологической безопасности медицинской деятельности требует определенного пересмотра и оптимизации с опорой на инновационные подходы к организации и современные технологические решения. Цель. В условиях высоких биологических рисков с использованием авторских метрик оценить эффективность предлагаемой системы эпидемиологической безопасности медицинской деятельности, основанной на мультимодальном подходе к ее организации. Материалы и методы. Предлагаемая авторами система эпидемиологической безопасности разработана в условиях пандемии COVID-19 и основана на мультимодальном подходе к ее организации, включающем оптимизацию кадрового, документально-информационного, инженерно-технического, гигиенического, организационного, лабораторного и электронно-цифрового обеспечения медицинской деятельности и процедуры идентификации, анализа и управления рисками в учреждении. Оценка эффективности системы проведена на двух моделях медицинских организаций с использованием метрик: риски инфицирования сотрудников SARS-CoV-2 по данным ПЦР-исследований (n = 5216), уровень их приверженности вакцинопрофилактике, психоэмоциональное состояние работников (по данным пульс-опросов 1024 чел.) и комплексная оценка рисков в учреждении по результатам применения специального программного продукта, основанного на авторском онлайн-чек-листе и протоколах его анализа. В исследовании применяли эпидемиологический, молекулярнобиологический, социологический и статистический методы исследования. Результаты и обсуждение. Продемонстрирована эффективность предлагаемой системы эпидемиологической безопасности медицинской деятельности. Работа сотрудников в учреждении, где не внедрен мультимодальный подход, повышала риск их инфицирования SARS-CoV-2 в 1,6 раза (ОШ = 1,567, 95 % ДИ: 1,165–2,108), низкой приверженности вакцинопрофилактике – в 1,5 раза (OШ = 1,464, 95 % ДИ: 1,040–2,060), психоэмоциональной дестабилизации – в 3 раза (OШ = 3,015, 95 % ДИ: 2,278–3,991). Использование специального программного продукта показало, что в модели № 1, где применяли мультимодальный подход, риск осложнения эпидемиологической ситуации как в целом, так и при анализе результатов раздельно по каждой из позиций чек-листа, был приемлемым. В модели № 2 риск осложнения эпидемиологической ситуации был неприемлемым по 7 из 10 оцениваемых разделов чек-листа. Заключение. Совершенствование системы эпидемиологической безопасности с применением мультимодального подхода показало свою эффективность по данным оценки комплекса метрик, что необходимо учитывать при определении готовности медицинских организаций к современным инфекционным угрозам и эпидемиологическим вызовам.

Актуальность. Вирус гепатита С обладает высокой генетической вариабельностью и представлен рядом генотипов и субтипов, различающихся по географическому распространению. Своевременное и высокоточное определение вируса гепатита С (ВГС) с последующим генотипированием является обязательным условием для начала анти-ВГС терапии. Молекулярно-биологический метод – полимеразная цепная реакция (ПЦР) в настоящее время признан «золотым стандартом» для проведения генотипирования ВГС. Цель. Изучить нуклеотидные последовательности NS5B и 5’UTR регионов ВГС для дифференциации субтипов 1a, 1b генотипа 1 (ГТ) с последующей апробацией разрабатываемой тест-системы, основанной на ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Материалы и методы. В исследовании было использовано 270 образцов плазмы крови пациентов инфицированных вирусом гепатита С. Подтверждение результатов ПЦР осуществляли путем сравнения группы исследуемых образцов с данными, полученными с использованием коммерчески доступных на рынке генотипирующих ПЦР-наборов, которые позволяют дифференцировать субтипы 1a и 1b. Специфичность ПЦР-системы оценивалась на 150 образцах вируса гепатита С, 100 из которых относятся к ГТ 3, оставшиеся 50 к ГТ 2. Результаты и обсуждение. Из проверенных 120 образцов плазмы крови большой процент образцов был определен как субтип 1b – 95 %, а 1a – 5 %, что соотносится с данными по определению субтипов 1a и 1b генотипирующими наборами, используемыми в данном исследовании. Также при секвенировании участков NS5B и 5’UTR было выявлено, что три образца содержали рекомбинантную форму ВГС 2k/1b, при этом один из них ранее был идентифицирован как ГТ 2. Проводимый тест на специфичность показал, что разрабатываемая ПЦР-система, использующая области NS5B и 5’UTR, не имела перекрестного взаимодействия со 100 образцами ГТ 3 и 49 образцами ГТ 2. Выводы. Полученные данные подтверждают возможность проведения анализа с использованием NS5B/5’UTR регионов и эффективность методики определения субтипов 1a, 1b ГТ 1 вируса гепатита С в клинической практике. В дополнение, применение предложенной ПЦР-системы позволило идентифицировать рекомбинантный вариант ВГС 2k/1b.

Актуальность. Благодаря более чем 90%-ному охвату населения иммунизацией против столбняка в России заболеваемость столбняком, по сравнению с довакцинальным периодом, снизилась практически в 100 раз. Тем не менее, в последнее десятилетие ежегодно в стране регистрировалось 8–19 случаев постравматического столбняка, из них 71,3 % – среди взрослых. Сотням тысяч пациентов ежегодно проводится иммунопрофилактика заболевания по экстренным показаниям в соответствии с требованиями нормативных документов, разработанных еще в прошлом веке. Цель. Представить существующие проблемы организации экстренной профилактики столбняка у взрослых. Заключение. В современных условиях необходима оптимизация тактики экстренной профилактики столбняка, включающая пересмотр действующих рекомендаций по экстренной профилактике столбняка, меры, направленные на обеспечение доступности для пациентов и медицинских организаций данных о проведенных ранее прививках, и разработку отечественных экспресс-тестов для количественного определения IgG к столбнячному анатоксину.

Актуальность. Иммунокомпрометированные пациенты являются многочисленной и гетерогенной группой с повышенным риском развития инфекционных заболеваний и их неблагоприятных исходов. Несмотря на существующие данные об эффективности и безопасности вакцинации этой категории пациентов, официальные рекомендации по вакцинации остаются ограниченными, что может представлять риски для их жизни и здоровья. Цель. Оценить наличие и полноту освещения вопросов вакцинопрофилактики инфекционных болезней у иммунокомпрометированных пациентов в клинических рекомендациях и других нормативных документах Российской Федерации. Материалы и методы. Проанализированы российские клинические рекомендации с использованием интернет-ресурса «Рубрикатор клинических рекомендаций Российской Федерации», посвященные лечению и профилактике отдельных инфекционных заболеваний, рекомендации по ведению пациентов с заболеваниями, потенциально сопровождающимися иммуносупрессией, нормативные и методические документы на наличие в них рекомендаций по вакцинации иммунокомпрометированных лиц, а также оценена полнота рекомендаций. Результаты. Положения по вакцинопрофилактике иммунокомпрометированных лиц отсутствуют в 11 из 19 (57,9 %) рассмотренных клинических рекомендаций по ведению пациентов с заболеваниями, потенциально сопровождающимися иммуносупрессией (в том числе «Рак молочной железы», «Хроническая болезнь почек», «Прижизненное донорство почки») и в 3 из 13 (23,1 %) рассмотренных клинических рекомендаций по лечению и профилактике отдельных инфекционных заболеваний («Вирусные пневмонии», «Внебольничная пневмония у детей», «Острый бронхиолит»). В Национальном календаре профилактических прививок и прививок по эпидемическим показаниям отдельные указания по вакцинации иммунокомпрометированных пациентов также отсутствуют. Во многих клинических рекомендациях, где вакцинация рекомендована, даны общие рекомендации, отсутствуют указания по схеме вакцинации и типе применяемых вакцин. Заключение. В настоящее время в большинстве клинических рекомендаций по ведению пациентов с состояниями, потенциально сопровождающимися иммуносупрессией, отмечаются информационные пробелы в отношении специфической профилактики инфекционных заболеваний. В клинических рекомендациях, в которых вакцинация иммунокомпрометированных пациентов присутствует, сами рекомендации достаточно фрагментированные и часто не содержат сведений о типах вакцин и схемах их применения. Включение в клинические рекомендации рекомендаций по вакцинопрофилактике, основанных на данных доказательной медицины, может способствовать повышению информированности медицинских работников о важности вакцинации, росту охвата и снижению риска инфекционных заболеваний и их последствий среди иммунокомпрометированных пациентов.

Актуальность. Стрептококки группы Mitis (Mitis Group Streptococci, SMG), относящиеся к одной из 5 групп зеленящих стрептококков, являются компонентом нормальной назофарингеальной флоры человека и включают 17 известных видов. Среди SMG, Streptococcus pneumoniae выступает наиболее частым возбудителем ряда инвазивных и неинвазивных заболеваний человека, приводящих к высокому уровню смертности во всем мире. Интересно отметить, что в ряде работ показаны не только различия, но и совпадения в генах, кодирующих факторы патогенности S. pneumoniae и других представителей SMG, в частности, Streptococcus oralis. Цель. Проанализировать и обобщить данные результатов молекулярно-генетических исследований SMG и выявить особенности генетического разнообразия штаммов возбудителей. Заключение. Проведенный сравнительный анализ геномов близкородственных видов SMG выявил ключевые общие гены, кодирующие белки – основные факторы патогенности, что позволяет оптимизировать выбор кандидатных штаммов для разработки эффективных пневмококковых вакцин.

Актуальность. Таргетное секвенирование постепенно занимает все более важное место в диагностике инфекционных заболеваний на фоне ряда ограничений традиционных методов и высокой стоимости/сложности метагеномного секвенирования. Цель. Обобщить современные подходы к таргетному NGS в диагностике инфекций, показать его преимущества и ограничения, по сравнению с культуральными и ПЦР-методами, а также с метагеномным секвенированием, и обсудить перспективы внедрения в рутинную практику и систему геномного эпиднадзора. Заключение. Показано, что таргетное секвенирование, при сопоставимых с традиционными методами сроках и стоимости, позволяет существенно повышать чувствительность и специфичность выявления возбудителей, точно типировать патогены и одновременно получать данные, пригодные для эпиднадзора и мониторинга устойчивости к противомикробным препаратам. Обсуждаются ключевые технологические и организационные барьеры, а также направления развития панелей и биоинформатических решений, которые способны сделать таргетное NGS одним из базовых инструментов инфекционной диагностики в ближайшие годы.