Preview

Эпидемиология и Вакцинопрофилактика

Расширенный поиск

Встречаемость и генетическое разнообразие вируса Кемерово в иксодовых клещах Западной Сибири

https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-2-75-79

Полный текст:

Аннотация

Вирус Кемерово (ВК), представитель семейства Reoviridae, род Orbivirus, переносится иксодовыми клещами и может вызывать поражения центральной нервной системы человека. Встречаемость и генетическое разнообразие ВК в Западной Сибири остаются слабо изученными, поэтому целью данной работы являлось изучение распространенности и генетической вариабельности ВК в иксодовых клещах в Западной Сибири. На присутствие РНК вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) и ВК было проанализировано 1958 клещей Ixodes persulcatus, I. pavlovskyi и их гибридов из Новосибирской и Омской областей и Республики Алтай (Россия) и Восточно-Казахстанской области (Казахстан). Было показано, что ареал ВК в Западной Сибири шире, чем полагали ранее, и включает в себя Северный и Северовосточный Алтай, в дополнение к Омской и Новосибирской областям. Впервые ВК был найден на территории Казахстана. Встречаемость ВК была статистически ниже, чем ВКЭ на большинстве исследуемых территорий Западной Сибири. ВК был найден как в клещах I. persulcatus и I. pavlovskyi, так и их гибридах. Варианты вируса, выявленные в 2010-е годы, генетически отличались от таковых, выделенных в 60-е годы прошлого столетия. Анализ последовательностей фрагментов сегментов 1 и 2 генома выявленных изолятов ВК указывает на возможную реассортацию вируса.

Об авторах

С. Е. Ткачев
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН
Россия


А. Ю. Тикунов
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН
Россия


И. В. Бабкин
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН
Россия


Н. Н. Ливанова
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН; ФГБУН «Институт систематики и экологии животных СО РАН»
Россия


С. Г. Ливанов
ФГБУН «Институт систематики и экологии животных СО РАН»
Россия


В. В. Панов
ФГБУН «Институт систематики и экологии животных СО РАН»
Россия


В. В. Якименко
ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора
Россия


А. К. Танцев
ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора
Россия


Д. Е. Тараненко
ФГБУН «Институт систематики и экологии животных СО РАН»
Россия


Н. В. Тикунова
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН
Россия


Список литературы

1. Hubаlek Z., Rudolf I. Tick-borne viruses in Europe. Parasitol. Res. 2012; 111(1): 9-36. doi: 10.1007/s00436-012-2910-1.

2. Gritsun T.S., Lashkevich V.A., Gould E.A. Tick-borne encephalitis. Antiviral Res. 2003; 57 (1 - 2): 129 - 146. doi: 10.1016/S0166-3542(02)00206-1.

3. Chumakov M.P. Report on isolation from Ixodes persulcatus ticks and from patients in Western Siberia of a virus differing from agent of tick-borne encephalitis. Acta Virol. 1963; 7 (1): 82 - 83.

4. Libikova H., Mayer V., Kozuch O., Rehacek J., Ernek E., Albrecht P. Isolation from Ixodes persulcatus ticks of cytopathic agents (Kemerovo virus) differing from tick-borne encephalitis virus and some of their properties. Acta Virol. 1964; 8: 289 - 301.

5. Dedkov V.G. Markelov M.L., Gridneva K.A., Bekova M.V., Gmyl A.P., Kozlovskaya L.I., et al. Prevalence of Kemerovo virus in ixodid ticks from the Russian Federation. Ticks Tick Borne Dis. 2014; 5(6): 651-655. doi: 10.1016/j.ttbdis.2014.04.01.

6. Tkachev S., Panov V., Dobler G., Tikunova N. First detection of Kemerovo virus in Ixodes pavlovskyi and Ixodes persulcatus ticks collected in Novosibirsk region, Russia. Ticks Tick-Borne Dis. 2014; 5(5): 494 - 496. doi: 10.1016/j.ttbdis.2014.03.003.

7. Ткачев С.Е., Ливанова Н.Н. Разработка системы молекулярного видотипирования клещей Ixodes persulcatus и Ixodes pavlovskyi. Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2012; 5(1): 325 - 327.

8. Livanova N.N., Tikunov A.Yu., Kurilshikov A.M., Livanov S.G., Fomenko N.V., Taranenko D.E., et al. Genetic diversity of Ixodes pavlovskyi and I. persulcatus (Acari: Ixodidae) from the sympatric zone in the south of Western Siberia and Kazakhstan. Exp. Appl. Acarol. 2015; 67: 441-456. doi: 10.1007/s10493-015-9947-7.

9. Tkachev S.E., Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Kozlova I.V., Verkhozina M.M., Doroshchenko E.K., et al. Genetic studies of tick-borne encephalitis virus strains from Western and Eastern Siberia. In: Flavivirus encephalitis (Ed. R ek, D.). Croatia: InTech; 2011: 235 - 254.

10. Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M., the UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics. 2012; 28: 1166-1167. doi:10.1093/bioinformatics/bts091.

11. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular evolutionary genetics zanalysis version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30: 27252729. doi: 10.1093/molbev/mst197.


Для цитирования:


Ткачев С.Е., Тикунов А.Ю., Бабкин И.В., Ливанова Н.Н., Ливанов С.Г., Панов В.В., Якименко В.В., Танцев А.К., Тараненко Д.Е., Тикунова Н.В. Встречаемость и генетическое разнообразие вируса Кемерово в иксодовых клещах Западной Сибири. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2017;16(2):75-79. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-2-75-79

For citation:


Tkachev S.E., Tikunov A.Y., Babkin I.V., Livanova N.N., Livanov S.G., Panov V.V., Yakimenko V.V., Tantsev A.K., Taranenko D.E., Tikunova N.V. Occurrence and Genetic Diversity of Kemerovo Virus in Ixodid Tick of Western Siberia. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2017;16(2):75-79. (In Russ.) https://doi.org/10.31631/2073-3046-2017-16-2-75-79

Просмотров: 408


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-3046 (Print)
ISSN 2619-0494 (Online)