Актуальность. Вакцина против коронавируса SARS-Cov-2 рассматривается как наиболее перспективное средство для укрощения вызванной им нынешней пандемии и воспрепятствования возникновению новой. В числе трудностей создания вакцин выбор иммунодоминантных антигенов, обеспечивающих их эффективность и безвредность. Цель исследования - показать полезность применения концепции пептидного континуума родства белков (ПКРБ) для понимания сложности патогенеза Covid-19, поиска вакцин против Covid-19 и обсудить возможную природу будущих пандемий. Материалы и методы. Для выявления компьютерным анализом пептидного (иммуноэпитопного) родства S, M и N белков SARS-Cov-2 с белками человека и других вирусов был выполнен поиск гомологичных последовательностей. Источниками первичных последовательностей белков служили доступные в Интернете базы данных. Результаты. S-белку свойственно пептидное (иммуноэпитопное) родство со многими белками человека, локализующимися на поверхности клеток или циркулирующими в крови, и вирусов. Образование антител к SARS-Cov-2, перекрестно реагирующих с гомологичными последовательностями в белках человека, может отягощать течение Covid-19. Присутствие таких гомологичных последовательностей в вакцине против Covid-19 связано с риском развития аутоиммунных осложнений и гетерологичного иммунитета. Вывод. Концепция пептидного континуума родства белков (ПКРБ) представляется полезной в поисках иммунных эпитопов для вакцин против Covid-19 и позволяет спрогнозировать возможные риски, связанные с их применением. По-видимому, в будущем коронавирусные вспышки и пандемии будут чаще, чем пандемии гриппа.

Актуальность. Профилактика пневмококковой инфекции в РФ осуществляется импортными полисахаридными и коньюгированными вакцинами без учета циркуляции клинически значимых изолятов, что приводит к росту распространения ранее редких генетических линий и серотипов, не входящих в состав вакцин, а также не защищает от носительства. Проводится разработка серотипнезависимых вакцин на основе протективных белков и вариантов цельноклеточных вакцин, способных обеспечить перекрёстный протективный эффект против пневмококка. Цель работы. Исследование протективных свойств поверхностных белоксодержащих антигенов, выделенных из иммуногенного штамма S. pneumoniae 6B № 296 и определение их влияния на ключевые эффекторы врождённого иммунитета. Материалы и методы. S. pneumoniae 6B № 296 культивировали в полу-синтетической среде в стационарных условиях при 5% CO₂ в течение 5-7 ч. Из инактивированных бактериальных клеток получали экспериментальный исходный белоксодержащий препарат - водный экстракт (В/Э), из которого выделяли фракцию 30-100 kDa (ФР), и из стерильного надосадка культуральной жидкости - белоксодержащий препарат - супернатант (С/Н); в препаратах выявляли содержание белка. Иммунобиологические свойства изучали после двукратной внутрибрюшинной иммунизации мышей линии BALB/c. Протективную активность определяли после заражения вирулентными штаммами S. рпеитожае серотипов 6В № 1121 и 3 № 3. Фагоцитарную активность изучали по количеству гранулоцитов, поглотивших убитые нагреванием FITC-меченые клетки S. aureus. Экспрессию Толл-подобных рецепторов (TLRs) и субпопуляционную структуру лимфоцитов селезенок мышей исследовали после окрашивания FITC/PE-мечеными моноклональными антителами с помощью проточной цитометрии. Статистический анализ материалов проведен с применением параметрических и непараметрических методов с использованием пакета прикладных программ «Statistica for Windows», ver. 7.0 (Stat Soft, Inc). Результаты. Установлен про-тективный эффект ФР при заражении вирулентными штаммами гомологичного (6B № 1121) и гетерологичного серотипов (3 № 3); С/Н защищал мышей при заражении штаммом 3№ 3. Все исследуемые препараты приводили к увеличению количества фагоцитирующих клеток (наибольший эффект отмечен при иммунизации ФР и С/Н) и стимулировали численность TLR2 и TLR4 позитивных клеток (наблюдалось повышение количества TLR2-экспрeссирующих клеток при иммунизации Ф/Р по сравнению с В/Э). При изучении иммунофенотипа лимфоцитов мышей отмечено, что препараты индуцировали экспрессию эффекторов врождённого и адаптивного иммунитета. Выводы. В результате проведённых исследований показано, что протективная поверхностная белоксодержащая фракция с ММ 30-100 kDa является наиболее активным, из испытанных экспериментальных препаратов, стимулятором врожденного и адаптивного иммунитета и требует дальнейшего изучения для определения возможности использования при разработке серотипнезависимой пневмококковой вакцины.

Актуальность. Штаммы Klebsiella pneumoniae могут обладать различными генами факторов вирулентности и вызывать такие нозологические формы, как пневмония, инфекция мочевыделительной системы, абсцесс печени, неонатальный сепсис. Цель работы - провести филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена uge, детектированного в штаммах K. pneumoniae. Материалы и методы. Всего исследовано 66 бактериальных культур K. pneumoniae, идентифицированных в 2019 г. Из них 45 -выделены из проб фекалий, 20 - из проб цервикального канала, 1 - из зева. Видовую идентификацию выделенных микроорганизмов проводили бактериологическим методом, детекцию гена uge осуществляли с помощью ПЦР в реальном времени. Результаты и обсуждение. При проведении скринингового исследования K. pneumoniae uge+ штаммы выявлены в 60,61%. Нуклеотидные последовательности являются гетерогенными, штаммы K. pneumoniae, проанализированные по нуклеотидной последовательности гена uge, имеют разное генетическое родство. Отсутствие кластеризации изолятов по времени выделения и принадлежности к стационару исключает наличие у них общих эпидемических связей. Выводы. Ген uge был детектирован в 60,6% штаммов K. pneumoniae, выделенных при проведении скринингового бактериологического исследования. Нуклеотидные последовательности гена uge, полученные в ходе настоящего исследования, отличаются от аналогичных, принадлежащих гипервирулентным штаммам, что может быть использовано для оценки патогенного потенциала выявляемых в стационарах изолятов и эпидемической ситуации в отделениях лечебного учреждения, а также разработки подходов к прогнозу уровня заболеваемости инфекций клебсиеллезной этиологии, основанных на методах молекулярной эпидемиологии.

Актуальность. В 2016 г. на 69-й Всемирной ассамблее здравоохранения была принята резолюция по элиминации парентеральных гепатитов в мире к 2030 г. В Республике Саха (Якутия), как и в целом в Российской Федерации, необходимо определить стартовые позиции по распространенности и заболеваемости гепатитами В, С и D как ведущих факторов развития гепатоцеллюлярной карциномы. Цель работы: дать клинико-эпидемиологическую характеристику гепатоцеллюлярной карциномы в Республике Саха (Якутия) на начальном этапе реализации программы элиминации вирусных гепатитов для последующего анализа ее эффективности. Материалы и методы. Проведен клинико-эпидемиологический анализ заболеваемости, смертности, кумулятивной выживаемости при гепатоцеллюлярной карциноме в Республике Саха (Якутия) за 10-летний период (2009-2018 гг.). Предикторы развития гепатоцеллюлярной карциномы анализировались по материалам первичной медицинской документации и результатам анкетирования 125 больных. Результаты и обсуждение. Уровень заболеваемости гепатоцеллюлярной карциномой в Республике Саха (Якутия) на протяжении последних 10 лет в 2,0-3,9 раза превышает соответствующий показатель в Российской Федерации. Наиболее высокая смертность от изучаемой патологии отмечается в Центральной и Заполярной зонах республики. По материалам ракового регистра медиана кумулятивной выживаемости больных карциномой составила 13,7 месяца с момента постановки диагноза, что значительно выше, чем десять лет назад. Установлены основные факторы риска, среди которых ведущую роль играет инфицирование вирусами гепатитов С, В и D. Кроме этого, имеет значение злоупотребление алкоголем, сахарный диабет, избыточный вес тела, табакокурение. Выводы. Республика Саха (Якутия) является гиперэндемичным регионом Российской Федерации по уровню заболеваемости гепатоцеллюлярной карциномой с преобладанием в ее структуре мужского населения. Темпы снижения заболеваемости раком печени в республике будет зависеть от эффективности региональной программы элиминации вирусных гепатитов и снижения заболеваемости циррозом печени неинфекционной этиологии.

Актуальность. Впервые описана генетическая неоднородность эпидемического кластера B0/W148, являющегося наиболее «успешным» штаммом возбудителя туберкулеза в России и в мире. Цель. Создание эпидемиологической модели распространения штаммов туберкулеза B0/W148 на территории Сибирского и Дальневосточного федеральных округов (СФО и ДФО) с выявлением генетической взаимосвязи между исследуемыми штаммами и изолятами из западных регионов России. Результаты и обсуждения. Проведено сравнительное исследование распределения однонуклеотидного полиморфизма (SNP) в геномах 20 штаммов из СФО и ДФО с аналогичными данными от 62 близкородственных штаммов из западных регионов России. На основе байесовского филогенетического древа построена эпидемиологическая модель возникновения и распространения высокотрансмиссивных штаммов M. tuberculosis кластера B0/W148 в России. По результатам моделирования выявлены и охарактеризованы Сибирский и Якутский субкластеры B0/W148.

Актуальность. В Ярославской области, эндемичном по клещевому энцефалиту (КЭ) регионе (Центральный федеральный округ России), специфическая вакцинация против клещевого энцефалита в плановом порядке проводится более 20 лет. Поэтому оценка результатов многолетней массовой имммунопрофилактики населения эндемичного по клещевому энцефалиту региона представляет практический и научный интерес. Цель: изучение особенностей эпидемиологии клещевого энцефалита в условиях массовой плановой вакцинопрофилактики в 2008-2019 гг. Результаты и обсуждение. По итогам многолетней иммунизации к 2019 г. привиты 19,1% населения, при этом охват вакцинацией детского населения, проживающего на эндемичных территориях области, достигает 68-83%. В статье отмечено в 2,9 раз снижение уровня заболеваемости КЭ в 2013-2018 гг. в сравнении с 2008-2012 гг. Среднемноголетний уровень составил 0,69 на 100 тыс. населения. КЭ регистрировался среди непривитого населения, преобладали легкие лихорадочные формы - 56,8%, однако высоким оставался удельный вес очаговых форм заболевания - 36,3%. Летальных исходов от КЭ в 2013-2018 гг. не было. Таким образом, в условиях отсутствия специфического лечения КЭ вакцинопрофилактика имеет большое медико-социальное значение для эндемичной по КЭ территории Ярославской области. Многолетняя вакцинопрофилактика КЭ населения Ярославской области, охват прививками детей, проживающих на эндемичных территориях области, и естественная иммунизация в природных очагах КЭ способствовали формированию значительного уровня коллективного иммунитета населения к вирусу КЭ, снижению заболеваемости в последние 5 лет.

Актуальность. Кардиохирургия - активно развивающееся направление в медицине. Ежегодно растет количество операций, выполненных на открытом сердце, а также частота послеоперационных осложнений, в том числе и инфекционного генеза. Цель работы - выявить частоту инфекций области хирургического вмешательства (ИОХВ) при операциях на открытом сердце, изучить ведущие факторы риска. Материалы и методы. Основная информация была получена из медицинских карт, а также с помощью медицинской информационной системы, которая позволяет отслеживать повторные госпитализации пациента в стационар. Были разработаны дополнительные формы по учету интраоперационных факторов риска. Период наблюдения составил 3 года (2016-2018 гг.). Всего проанализировано 433 оперативных вмешательства и их исходов, длительность наблюдения за пациентами составила один год с момента проведения операции. Выявлено 19 случаев ИОХВ. Результаты и обсуждение. Частота ИОХВ при операциях на открытом сердце составила 4,4 на 100 операций (2,6-6,7). До 74% всех ИОХВ возникло в период до 30 суток с момента операции. Рассчитан показатель относительного риска для таких факторов, как длительность пребывания в отделении реанимации в послеоперационном периоде, сроки дренирования послеоперационной раны, наличие у пациента сахарного диабета. Установлено, что для кардиохирургических операций 1-го класса операционной раны сахарный диабет является значимым фактором риска ИОХВ. Выводы. Для проведения глубокого эпидемиологического расследования каждого случая инфекционного послеоперационного осложнения, разработки и внедрения противоэпидемических мероприятий необходим полный учет возможных факторов риска, заинтересованность и участие кардиохирургов в выявлении и анализе каждого случая ИОХВ, наличие информации об исходе оперативного вмешательства, что подразумевает взаимодействие стационарных и амбулаторно-поликлинических медицинских организаций, которые принимают участие в ведении кардиохирургического пациента в послеоперационном периоде.

Актуальность. При серологической диагностике краснухи методом иммуноферментного анализа, направленного на выявление антител класса М, возможно получение сомнительного или ложноположительного результата. В данном случае необходимо дополнительное подтверждающее исследование, которое может быть проведено методом иммунного блоттинга, позволяющим выявить антитела к отдельным антигенам вируса краснухи. На сегодняшний день в Российской Федерации отсутствует подобный набор реагентов, что делают его разработку достаточно актуальной. Цель - разработка отечественной тест-системы для выявления антител класса М к отдельным антигенам вируса краснухи методом иммунного блоттинга в формате «Western blot». Материалы и методы. Для получения иммуносорбента новой тест-системы использовали электрофорез нативного лизата вируса краснухи в полиакриламидном геле с целью разделения входящих в его состав белков по молекулярному весу и последующий электроперенос (блоттинг) разделенных белков на нитроцеллюлозную мембрану. Для оценки чувствительности и специфичности новой тест-системы использовали стандартные панели сывороток, содержащих и не содержащих IgM к вирусу краснухи, а также охарактеризованные методом ИФА образцы клинического материала. Результаты и их обсуждение. В результате проведенной работы была создана отечественная тест-система, позволяющая выявлять антитела класса М к отдельным антигенам вируса краснухи методом иммунного блоттинга, аналитическая чувствительность и специфичность которой составили 100%, а диагностическая чувствительность и специфичность - не менее 99,61% и не менее 99,99% соответственно. Итоговая оценка диагностической эффективности составила не менее 99,5%. Выводы. Разработанная тест-система обладает высокими показателями аналитической и диагностической чувствительности и специфичности, а также высокой диагностической эффективностью. Она предназначена для проведения подтверждающих исследований в диагностике краснушной инфекции.

Актуальность. Начиная с середины прошлого века появлялись сообщения о выделении Neisseria meningitidis из нижних отделов урогенитального тракта и анального канала, как с признаками, так и без признаков воспаления. Во второй декаде XXI века число таких сообщений значительно возросло, причем большинство описанных случаев было вызвано новым генетическим кладом менингококка. Цель. Обзор посвящен острым менингококковым уретритам, их возможной эпидемиологической значимости и свойствам возбудителя. Результаты. Особое внимание уделено вспышкам менингококковых уретритов, вызванных генетическим кладом «USNmCU», возникшим в нескольких штатах США в 2013-2016 гг. Изоляты от больных были бескапсульными и принадлежали к клональному комплексу СС-11, наиболее вирулентному среди штаммов серогрупп B, C, Y, W. Доказана орогенитальная передача штаммов клада. Предполагается, что в результате генетических рекомбинаций при совместном нахождении с N. gonorrhoeae на слизистых оболочках N. meningitidis приобрела гены, обеспечивающие анаэробный рост, способствующий колонизации урогенитального тракта. Предполагается, что уретритогенный менингококковый клад есть результат адаптации капсульного штамма менингококка серогруппы С клонального комплекса СС-11, ответственного за вспышки генерализованной менингококковой инфекции в сообществах мужчин-гомосексуалистов. Эти уретритогенные штаммы рассматривают как эмергентный клад N. meningitidis. Способность штаммов этого клада передаваться при прямом половом контакте неизвестна. Выводы. Эпидемиологическая значимость уретритов, вызванных новым кладом, в распространении менингококковой инфекции пока неясна. Обосновано дальнейшее изучение этой проблемы в нашей стране.

Актуальность. Природная очаговость сапронозов охарактеризована с экологических позиций. Многие патогенные бактерии (вибрионы, легионеллы, иерсинии, листерии) связаны общей экологической чертой - возможностью автономно существовать во внешней среде. Цель. Аналитический обзор сфокусирован на гидробионтах и растениях как альтернативных хозяевах патогенных бактерий, способных жить в водных и почвенных экосистемах. Приводятся экспериментальные доказательства их способности колонизировать амеб, инфузорий, а также ткани растений. Заключение. Обсуждается роль ассоциаций патогенов с другими организмами в формировании резервуаров возбудителей инфекций и минимизация риска их распространения во вторичных (антропургических) очагах.

В данном обзоре выделены и систематизированы проявления эволюции клещевого энцефалита (КЭ) в разных аспектах, которые прослежены за 80-летний период с момента открытия вируса КЭ. Эволюция инфекции выражается в изменении свойств этиологического агента (изменение генетической структуры популяций возбудителя на отдельных территориях, феномен смены доминирующего подтипа, изменение вирулентности), эпидемиологии и экологии КЭ (период выраженного роста заболеваемости, изменение эндемичности территорий, уровня популяционного иммунитета, появление очагов заболевания в пригородных зонах и на территории городов, изменение ареала определённых видов клещей и появление «клещей-мутантов»), а также клинической картины КЭ (явление патоморфоза, рост актуальности микст-инфекций, переносимых клещами). Проведен анализ возможных причин эволюционных преобразований, среди которых основными являются природные факторы (изменение климата), антропогенные факторы, а именно - нарушение естественных природных ландшафтов вследствие хозяйственной деятельности человека и загрязнение окружающей среды некоторыми ядохимикатами, и дополнительные - воздействие вакцинации. Цель статьи: характеристика основных проявлений и вероятных причин эволюции КЭ за 80-летний период. Заключение. В обзоре впервые представлена информация по основным вопросам данной проблемы, выявлены изменения и преобразования, которые затрагивают возбудителей, переносчиков и, как следствие, влекут за собой изменения в эпидемиологии и клинической картине данного заболевания, что прослеживается на разных территориях.

Актуальность. Группа нетуберкулезных микобактерий включает более 200 видов, из которых порядка 50 являются возбудителями микобактериальных инфекций, или микобактериозов, которые клинически и рентгенологически схожи с туберкулезом. Микобактериозы представляют собой мультидисциплинарную, недостаточно изученную проблему. Цель - обобщить современные представления о данных заболеваниях. Заключение. В обзоре представлена информация по основным аспектам рассмотренной проблемы: определены особенности экологии и диагностики нетуберкулезных микобактерий, описана эпидемиология данных заболеваний, установлена возможность вариативности клинических проявлений микобактериозов, в т. ч. среди иммунокомпрометированных лиц и на примере инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Особое внимание уделено возрастающей необходимости разработки нормативно-правовых документов, касающихся профилактики, диагностики и лечения инфекций, вызываемых нетуберкулезными микобактериями.